芯片设计与制造
构建具有192个微室的3D胶原微环境,模拟乳腺癌微环境。
利用软光刻技术制作PDMS芯片,通过胶原蛋白填充形成微室,并接种MDA-MB-231-RFP细胞。
3D collagen microchamber arrays for combined chemotherapy effect evaluation on cancer cell numbers and migration.
包含体外3D细胞模型、微流控芯片、药物梯度模拟与实验验证、免疫荧光分析等至少两个独立证据层级,并包含功能验证(细胞数量与迁移)和机制验证(DDR1和E-cad表达)。
MDA-MB-231-RFP乳腺癌细胞系 3D胶原微室芯片(CCEC) 微流控药物梯度模型
细胞密度为3.0×10^6 cells/ml 胶原浓度为5.0 mg/ml 药物浓度:紫杉醇31.00 ng/ml、吉西他滨19.00 ng/ml、7rh 44.88 μg/ml、氟尿嘧啶2.50 μg/ml、PP2 150.87 μg/ml 实验持续时间为120小时,每24小时更换培养基并成像 统计检验:Shapiro–Wilks检验和Kolmogorov–Smirnov检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建具有192个微室的3D胶原微环境,模拟乳腺癌微环境。
利用软光刻技术制作PDMS芯片,通过胶原蛋白填充形成微室,并接种MDA-MB-231-RFP细胞。
在芯片上形成稳定的单一和复合药物浓度梯度。
通过向培养基通道加入不同药物,利用胶原中的扩散形成梯度,并用COMSOL模拟和荧光染料实验验证。
评估药物梯度对乳腺癌细胞数量及迁移的抑制效应。
通过荧光显微镜获取细胞图像,计算荧光强度比率,定量分析细胞数量和迁移。
验证药物对DDR1和E-cad蛋白表达的影响。
使用免疫荧光染色检测DDR1和E-cad蛋白表达,并通过共聚焦显微镜成像和MATLAB定量分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Corning | -- | |
| 构建微环境 | I型胶原蛋白 | Corning | 354236 |
| 10×磷酸盐缓冲液 | Corning | -- | |
| 芯片制备 | 纤连蛋白 | Corning | -- |
| 牛血清白蛋白 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 免疫荧光 | 正常山羊血清 | Solarbio | -- |
| DDR1 (D1G6) XP兔单抗 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 链霉亲和素-Alexa Fluor 555抗体 | Bioss | -- | |
| E-钙粘蛋白 (24E10) 兔单抗 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 链霉亲和素-Alexa Fluor 350抗体 | Bioss | -- | |
| 药物梯度验证 | 罗丹明-葡聚糖 | -- | -- |
| Cascade Blue-葡聚糖 | -- | -- | |
| FITC-葡聚糖 | -- | -- | |
| 成像 | 共聚焦显微镜 (SP8, Leica) | Leica | -- |
| 倒置荧光显微镜 (Ti-E, Nikon) | Nikon | -- | |
| 细胞培养 | 活细胞培养装置 (Okolab) | Okolab | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与接种 | 细胞密度、培养基组成、培养条件、接种时间 阅读提示:详见章节 II.A 细胞培养。 |
| 胶原制备 | 胶原浓度(5.0 mg/ml)、pH(7.2)、固化条件 阅读提示:详见章节 II.B 胶原制备。 |
| 芯片设计与药物梯度 | 药物种类和浓度、梯度形成时间(120小时)、刷新频率(24小时) 阅读提示:详见章节 III.A 和 III.B。 |
| 细胞数量和迁移分析 | 荧光强度率计算方法、子区域划分、分析时间点(120小时) 阅读提示:详见章节 III.B 和 III.C。 |
| 免疫荧光分析 | 抗体稀释比例、孵育时间、温度 阅读提示:详见章节 II.E 免疫荧光分析。 |