M13 噬菌体报告颗粒的制备
生成偶联抗鼠 IgG/HRP 的 M13 噬菌体报告颗粒,用于信号放大。
通过高碘酸盐氧化 IgG-HRP 偶联物上的糖基产生醛基,再与 M13 噬菌体表面伯胺进行还原胺化偶联,并用氰基硼氢化钠还原,过量未偶联抗体通过 Capto Core 700 柱去除。
Smartphone-read phage lateral flow assay for point-of-care detection of infection.
包含抗体筛选、体外分析灵敏度验证、临床样本测试和智能手机读取验证等多个独立实验层级。
SARS-CoV-2 核蛋白重组蛋白 临床鼻拭子提取物 M13 噬菌体报告颗粒
抗体对:捕获抗体兔单抗 #12 (ExonBio),检测抗体鼠单抗 #3 (Ray Biotech) 检测限:鼻拭子提取物中 25 pg mL−1(实验室成像)和 100 pg mL−1(智能手机) 临床样本:15 阳性(Ct 18.7-29.6)和 11 阴性,Mann-Whitney U 检验 p < 0.001 LFA 运行缓冲液成分:1X PBS (pH 7.4), 10 mg/mL BSA, 5 mg/mL PVP-40, 0.25% IGEPAL CA-630
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成偶联抗鼠 IgG/HRP 的 M13 噬菌体报告颗粒,用于信号放大。
通过高碘酸盐氧化 IgG-HRP 偶联物上的糖基产生醛基,再与 M13 噬菌体表面伯胺进行还原胺化偶联,并用氰基硼氢化钠还原,过量未偶联抗体通过 Capto Core 700 柱去除。
制备带有捕获抗体(测试线)和对照抗体的硝酸纤维素膜试纸条。
在硝酸纤维素膜上分别划线固定兔单克隆抗 SARS-CoV-2 核蛋白抗体(测试线)和羊抗鼠抗体(质控线),干燥后切成窄条。
检测鼻拭子提取物中的 SARS-CoV-2 核蛋白,并量化测试线和质控线的信号。
将含检测抗体的样本加到试纸条上,然后依次加入噬菌体报告颗粒、洗涤缓冲液和化学发光底物,并通过实验室成像系统或智能手机应用捕捉发光信号。
筛选在噬菌体 LFA 中性能最佳的抗体对。
将 84 对抗核蛋白单克隆抗体在噬菌体 LFA 中初步筛选(使用阴性样本和 5 ng/mL 阳性样本),选出前 6 对后进行第二轮(1 ng/mL),再选出前 2 对进行第三轮(鼻拭子提取物中的 0.05-0.5 ng/mL),最终确定最佳抗体对 #12/#3。
确定噬菌体 LFA 在鼻拭子提取物中的检测限。
在阴性鼻拭子提取物中掺入系列稀释的重组核蛋白,运行 LFA 并成像,计算测试线/质控线比值,基于空白平均值+3倍标准差确定 LoD。
评估噬菌体 LFA 区分阳性和阴性临床样本的能力。
测试了 27 例或 26 例去识别鼻拭子提取物(阳性已知 Ct 值,阴性 Ct>40),计算 LFA 信号并进行统计分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 试剂制备 | 盐酸羟胺 | Sigma Aldrich | 99% |
| LFA 缓冲液 | IGEPAL CA-630 | Sigma Aldrich | -- |
| 牛血清白蛋白 | Sigma Aldrich | A7906 | |
| 试剂制备 | 乙酸钠 | Sigma Aldrich | 99% |
| 碳酸钠 | Millipore Sigma | -- | |
| 缓冲液 | 磷酸盐缓冲液片剂 | TaKaRa | -- |
| 化学发光检测 | 增强化学发光超敏底物 | Lumigen | TMA-6 |
| 酶活性检测 | 1-Step Ultra TMB-ELISA 底物溶液 | Thermo Scientific | -- |
| 噬菌体偶联 | IgG-辣根过氧化物酶偶联物 | Jackson ImmunoResearch | 115-035-003 |
| M13mp18 噬菌体 | Guild Biosciences | -- | |
| 纯化 | Zeba 旋转脱盐柱 7K MWCO | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Capto Core 700 树脂 | Cytiva | -- | |
| 浓度测定 | Thermo NanoDrop ND-1000 紫外可见分光光度计 | Thermo | ND-1000 |
| 酶活性检测 | TECAN Infinite M200 PRO 酶标仪 | TECAN | -- |
| LFA 组装 | UniSart CN140 硝酸纤维素膜 | Sartorius Stedim | -- |
| ReliaFlow™ 440 吸收垫 | Ahlstrom-Munksjö | -- | |
| 背衬卡 | DCN | MIBA-020 | |
| 羊抗鼠多克隆抗体 | Arista Biologicals | ABGAM-0500 | |
| Biodot XYZ3060 系统 | Biodot | -- | |
| ZQ2000 切条机 | Kinbio Tech | -- | |
| 抗原 | SARS-CoV-2 核蛋白(重组) | ACRO Biosystems | NUN-C5227 |
| 抗体筛选 | 兔单克隆抗 SARS-CoV-2 核蛋白抗体(克隆 12F1) | ExonBio | -- |
| 小鼠单克隆抗 SARS-CoV-2 核蛋白抗体(克隆 1G1-F2) | Ray Biotech | -- | |
| 成像分析 | Alpha Innotech FluorChem 凝胶成像系统 | Alpha Innotech | -- |
| CoolSNAP K4 CCD 相机 | Photometrics | -- | |
| iPhone XR | Apple | -- | |
| 3D 打印无透镜附件 | -- | Thingiverse | |
| RT-qPCR | 蛋白酶 K | -- | -- |
| CDC 2019-nCoV-2 RUO 预混引物和探针组 | IDT DNA Technologies | -- | |
| Luna Universal Probe One-Step RT-qPCR 试剂盒 | New England Biolabs | E3006S | |
| MX3005P qPCR 仪 | Agilent | -- | |
| SARS-CoV-2 (2019-nCoV) RUO 质粒对照 | IDT DNA Technologies | -- | |
| Hs_RPP30 质粒对照 | IDT DNA | -- | |
| qPCR 对照 SARS-CoV-2 RNA | BEI Resources | NR-52347 | |
| 临床样本采集 | Puritan 泡沫头拭子 | Puritan | -- |
| 数据分析 | IBM SPSS 统计软件 | IBM | 28.0.1.0 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 噬菌体报告颗粒偶联 | 偶联反应中 IgG-HRP 浓度、M13 噬菌体浓度、反应时间、还原剂浓度、淬灭条件 阅读提示:Materials and Methods §2.3 |
| LFA 组装 | 硝酸纤维素膜型号、捕获抗体和质控抗体浓度、划线系统参数、干燥条件 阅读提示:Materials and Methods §2.4 |
| LFA 运行 | 样本体积、检测抗体浓度、报告颗粒浓度、底物体积、成像时间 阅读提示:Materials and Methods §2.5 和 §2.6 |
| 抗体筛选 | 各轮筛选的核蛋白浓度、所用缓冲液、候选抗体对编号 阅读提示:Materials and Methods §2.7 和 Figure 2 图注 |
| 临床样本测试 | 样本来源、样本类型、阳性样本 Ct 值范围、阴性样本定义、统计检验方法 阅读提示:Materials and Methods §2.9 和 §3.4 及 Figure 4 和 6 图注 |