用于感染即时检测的智能手机读取噬菌体侧向层析 assay

Smartphone-read phage lateral flow assay for point-of-care detection of infection.

作者信息Maede Chabi, Binh Vu, Kristen Brosamer, Maxwell Smith, Dimple Chavan, Jacinta C Conrad, Richard C Willson, Katerina Kourentzi
PMID36645184
期刊Analyst
发布时间2023-02-13
DOI10.1039/d2an01499h

实验完整度

包含抗体筛选、体外分析灵敏度验证、临床样本测试和智能手机读取验证等多个独立实验层级。

主要模型

SARS-CoV-2 核蛋白重组蛋白 临床鼻拭子提取物 M13 噬菌体报告颗粒

重点核对

抗体对:捕获抗体兔单抗 #12 (ExonBio),检测抗体鼠单抗 #3 (Ray Biotech) 检测限:鼻拭子提取物中 25 pg mL−1(实验室成像)和 100 pg mL−1(智能手机) 临床样本:15 阳性(Ct 18.7-29.6)和 11 阴性,Mann-Whitney U 检验 p < 0.001 LFA 运行缓冲液成分:1X PBS (pH 7.4), 10 mg/mL BSA, 5 mg/mL PVP-40, 0.25% IGEPAL CA-630

摘要

COVID-19 疫情凸显了对即时护理中灵敏、经济且广泛可及的检测的迫切需求。在此,我们展示了一种新的、通用的侧向层析检测(LFA)平台技术,该技术使用偶联抗体和 HRP 酶的 M13 噬菌体,提供高分析灵敏度和在复杂临床基质中的优异性能。我们还报告了其完全集成到一种灵敏的基于化学发光的智能手机可读侧向层析检测中,用于检测 SARS-CoV-2 核蛋白。我们在噬菌体 LFA 中筛选了 84 对抗核蛋白单克隆抗体,并确定了一对抗体对,在鼻拭子提取物中使用 FluorChem 凝胶成像系统检测限(LoD)为 25 pg mL−1 核蛋白,使用内部开发的智能手机读取器成像和分析时 LoD 为 100 pg mL−1。阳性临床样本(N = 15,已知 Ct 值)的智能手机读取 LFA 信号与阴性临床样本(N = 11)的信号有统计学差异(p < 0.001)。噬菌体 LFA 技术与智能手机化学发光成像相结合,可以及时开发超灵敏、经济实惠的即时检测平台,用于 SARS-CoV-2 及其他病原体的检测。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
开发一种灵敏、经济、用户友好的即时检测技术,用于检测活动性感染,特别是 COVID-19。
核心机制
M13 噬菌体作为各向异性报告颗粒,携带多个抗鼠 IgG/HRP 酶,通过 HRP 催化化学发光底物产生可检测的光信号。
主要证据
通过临床鼻拭子样本测试,智能手机读取的 LFA 信号在阳性(N=15)和阴性(N=11)样本间有显著差异 (p<0.001),LoD 为 100 pg/mL。
研究意义
该平台技术可快速部署用于超灵敏、低成本的即时检测,广泛适用于传染病病原体、食品毒素和环境污染物检测。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

M13 噬菌体报告颗粒的制备

生成偶联抗鼠 IgG/HRP 的 M13 噬菌体报告颗粒,用于信号放大。

通过高碘酸盐氧化 IgG-HRP 偶联物上的糖基产生醛基,再与 M13 噬菌体表面伯胺进行还原胺化偶联,并用氰基硼氢化钠还原,过量未偶联抗体通过 Capto Core 700 柱去除。

2

LFA 试纸条组装与抗体划线

制备带有捕获抗体(测试线)和对照抗体的硝酸纤维素膜试纸条。

在硝酸纤维素膜上分别划线固定兔单克隆抗 SARS-CoV-2 核蛋白抗体(测试线)和羊抗鼠抗体(质控线),干燥后切成窄条。

3

LFA 运行与化学发光成像

检测鼻拭子提取物中的 SARS-CoV-2 核蛋白,并量化测试线和质控线的信号。

将含检测抗体的样本加到试纸条上,然后依次加入噬菌体报告颗粒、洗涤缓冲液和化学发光底物,并通过实验室成像系统或智能手机应用捕捉发光信号。

4

抗体筛选

筛选在噬菌体 LFA 中性能最佳的抗体对。

将 84 对抗核蛋白单克隆抗体在噬菌体 LFA 中初步筛选(使用阴性样本和 5 ng/mL 阳性样本),选出前 6 对后进行第二轮(1 ng/mL),再选出前 2 对进行第三轮(鼻拭子提取物中的 0.05-0.5 ng/mL),最终确定最佳抗体对 #12/#3。

5

分析灵敏度评估

确定噬菌体 LFA 在鼻拭子提取物中的检测限。

在阴性鼻拭子提取物中掺入系列稀释的重组核蛋白,运行 LFA 并成像,计算测试线/质控线比值,基于空白平均值+3倍标准差确定 LoD。

6

临床样本验证

评估噬菌体 LFA 区分阳性和阴性临床样本的能力。

测试了 27 例或 26 例去识别鼻拭子提取物(阳性已知 Ct 值,阴性 Ct>40),计算 LFA 信号并进行统计分析。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
盐酸羟胺Sigma Aldrich99%
IGEPAL CA-630Sigma Aldrich--
牛血清白蛋白Sigma AldrichA7906
乙酸钠Sigma Aldrich99%
碳酸钠Millipore Sigma--
磷酸盐缓冲液片剂TaKaRa--
增强化学发光超敏底物LumigenTMA-6
1-Step Ultra TMB-ELISA 底物溶液Thermo Scientific--
IgG-辣根过氧化物酶偶联物Jackson ImmunoResearch115-035-003
M13mp18 噬菌体Guild Biosciences--
Zeba 旋转脱盐柱 7K MWCOThermo Fisher Scientific--
Capto Core 700 树脂Cytiva--
Thermo NanoDrop ND-1000 紫外可见分光光度计ThermoND-1000
TECAN Infinite M200 PRO 酶标仪TECAN--
UniSart CN140 硝酸纤维素膜Sartorius Stedim--
ReliaFlow™ 440 吸收垫Ahlstrom-Munksjö--
背衬卡DCNMIBA-020
羊抗鼠多克隆抗体Arista BiologicalsABGAM-0500
Biodot XYZ3060 系统Biodot--
ZQ2000 切条机Kinbio Tech--
SARS-CoV-2 核蛋白(重组)ACRO BiosystemsNUN-C5227
兔单克隆抗 SARS-CoV-2 核蛋白抗体(克隆 12F1)ExonBio--
小鼠单克隆抗 SARS-CoV-2 核蛋白抗体(克隆 1G1-F2)Ray Biotech--
Alpha Innotech FluorChem 凝胶成像系统Alpha Innotech--
CoolSNAP K4 CCD 相机Photometrics--
iPhone XRApple--
3D 打印无透镜附件--Thingiverse
蛋白酶 K----
CDC 2019-nCoV-2 RUO 预混引物和探针组IDT DNA Technologies--
Luna Universal Probe One-Step RT-qPCR 试剂盒New England BiolabsE3006S
MX3005P qPCR 仪Agilent--
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) RUO 质粒对照IDT DNA Technologies--
Hs_RPP30 质粒对照IDT DNA--
qPCR 对照 SARS-CoV-2 RNABEI ResourcesNR-52347
Puritan 泡沫头拭子Puritan--
IBM SPSS 统计软件IBM28.0.1.0

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
噬菌体报告颗粒偶联
偶联反应中 IgG-HRP 浓度、M13 噬菌体浓度、反应时间、还原剂浓度、淬灭条件
阅读提示:Materials and Methods §2.3
LFA 组装
硝酸纤维素膜型号、捕获抗体和质控抗体浓度、划线系统参数、干燥条件
阅读提示:Materials and Methods §2.4
LFA 运行
样本体积、检测抗体浓度、报告颗粒浓度、底物体积、成像时间
阅读提示:Materials and Methods §2.5 和 §2.6
抗体筛选
各轮筛选的核蛋白浓度、所用缓冲液、候选抗体对编号
阅读提示:Materials and Methods §2.7 和 Figure 2 图注
临床样本测试
样本来源、样本类型、阳性样本 Ct 值范围、阴性样本定义、统计检验方法
阅读提示:Materials and Methods §2.9 和 §3.4 及 Figure 4 和 6 图注