构建VWM患者来源的iPSC系
获得携带EIF2B4或EIF2B5突变的诱导多能干细胞,用于后续分化。
从两名VWM患者(VWM1:EIF2B5突变;VWM2:EIF2B4突变)获取体细胞,通过电穿孔导入Yamanaka因子(OCT3/4、SOX2、KLF4、L-MYC)和Lin28进行重编程,获得iPSC系。
Human-induced pluripotent stem cell-derived cerebral organoid of leukoencephalopathy with vanishing white matter.
包含体外脑类器官模型,通过免疫荧光、Western blot、透射电镜等方法验证了细胞增殖、凋亡、UPR通路、神经元发育及胶质细胞分化等表型,但缺乏体内模型、患者样本或组学数据等多层级验证。
VWM患者来源的iPSC诱导的脑类器官(EIF2B4和EIF2B5突变) 野生型iPSC诱导的脑类器官
VWM患者来源的iPSC(EIF2B5突变:VWM1;EIF2B4突变:VWM2)与一个野生型iPSC系 脑类器官培养时间点:第6周、第12周、第20周 细胞凋亡检测:免疫荧光检测caspase-3和caspase-9阳性细胞比例 UPR信号通路检测:免疫荧光检测PERK、CHOP、ATF4、ATF6、XBP1、GADD34表达 少突胶质细胞成熟检测:免疫荧光检测PDGFRα、O4、Olig2、MBP表达及透射电镜观察髓鞘结构
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得携带EIF2B4或EIF2B5突变的诱导多能干细胞,用于后续分化。
从两名VWM患者(VWM1:EIF2B5突变;VWM2:EIF2B4突变)获取体细胞,通过电穿孔导入Yamanaka因子(OCT3/4、SOX2、KLF4、L-MYC)和Lin28进行重编程,获得iPSC系。
模拟大脑发育过程,研究eIF2B突变对早期至后期神经发育的影响。
按照STEMdiff Cerebral Organoid kit说明书,将iPSC形成拟胚体(EB),随后包埋于Matrigel进行三维培养,并持续培养至20周以观察胶质细胞。
评估eIF2B突变对脑类器官大小和细胞增殖的影响。
通过显微镜观察并测量类器官最大直径;通过免疫荧光检测Ki-67阳性细胞比例,评估细胞增殖。
探索突变脑类器官体积较小的原因,评估细胞凋亡水平。
通过免疫荧光检测caspase-3和caspase-9阳性细胞比例,并使用Western blot检测caspase-9表达水平。
验证突变脑类器官中UPR信号通路是否过度激活。
通过免疫荧光检测UPR相关分子PERK、CHOP、ATF4、ATF6、XBP1、GADD34的表达,并观察其在星形胶质细胞和少突胶质细胞中的分布。
评估eIF2B突变对早期神经元发育和晚期神经元分化的影响。
通过免疫荧光检测神经干细胞(SOX2)、中间祖细胞(TBR2)、未成熟神经元(TUJ1)、深层神经元(TBR1、CTIP2)和浅层神经元(SATB2)的标志物。
评估eIF2B突变对星形胶质细胞和少突胶质细胞成熟的影响。
通过免疫荧光检测星形胶质细胞标志物GFAP、GFAPδ、nestin、αB-crystallin,少突胶质细胞谱系标志物PDGFRα、O4、Olig2、MBP,并使用透射电镜观察髓鞘结构。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| iPSC重编程 | Epi5附加型iPSC重编程试剂盒 | Invitrogen | A15960 |
| 细胞培养 | Matrigel基底膜基质 | Corning | 354277 |
| mTeSR培养基 | STEMCELL Technologies | 85850 | |
| 细胞传代 | 温和细胞解离试剂 | STEMCELL Technologies | 100-0485 |
| 脑类器官培养 | STEMdiff脑类器官试剂盒 | STEMCELL Technologies | 08570, 08571 |
| 96孔圆底超低吸附培养板 | Corning | 7007 | |
| 24孔超低吸附培养板 | Corning | 3473 | |
| 6孔超低吸附培养板 | Corning | 3471 | |
| 免疫荧光 | SOX2抗体 | CST | -- |
| 磷酸化波形蛋白抗体 | MBL International | D076-3S | |
| TUJ1抗体 | CST | 5568 | |
| TBR1抗体 | Abcam | ab31940 | |
| TBR2抗体 | Millipore | AB15894 | |
| CTIP2抗体 | Abcam | ab18465 | |
| SATB2抗体 | Abcam | ab92446 | |
| GFAP抗体 | CST | 3670S | |
| GFAPδ抗体 | EMD Millipore | AB9598 | |
| Nestin抗体 | CST | 4760S | |
| αB-晶状体蛋白抗体 | Abcam | ab76467 | |
| Ki-67抗体 | CST | 9129S | |
| caspase-3抗体 | Abcam | ab32351 | |
| caspase-9抗体 | Abcam | ab202068 | |
| PDGFRα抗体 | Santa Cruz | ab61219 | |
| Olig2抗体 | Abcam | ab109186 | |
| O4抗体 | Sigma-Aldrich | MAB1326 | |
| MBP抗体 | CST | ab62631 | |
| PERK抗体 | CST | 5683S | |
| CHOP抗体 | CST | 2895S | |
| ATF4抗体 | CST | 11815S | |
| ATF6抗体 | Abcam | ab122897 | |
| XBP1抗体 | Abcam | ab37152 | |
| GADD34抗体 | Abcam | ab236516 | |
| Alexa Fluor 568偶联驴抗兔IgG | Life Technologies | A11011 | |
| Alexa Fluor 488偶联驴抗小鼠IgG | Life Technologies | A11001 | |
| Alexa Fluor 647偶联驴抗鸡IgG | Bioss | A104097728 | |
| DAPI | Southern Biotech | 0100-20 | |
| PermaFluor封片剂 | -- | -- | |
| 显微镜观察 | Fv10-ASW显微镜 | Olympus | -- |
| Western blot | RIPA蛋白裂解缓冲液 | Applygen | -- |
| 蛋白分子量标准(10-180 kDa) | Thermo Scientific | 26616 | |
| β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| HRP偶联多克隆绵羊抗兔IgG | ZSGB-Bio | ZB-2301 | |
| HRP偶联多克隆绵羊抗小鼠IgG | ZSGB-Bio | ZB-2305 | |
| 增强化学发光检测试剂盒 | Millipore | 2106001 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| iPSC重编程与培养 | 患者来源和突变类型:VWM1(EIF2B5突变)和VWM2(EIF2B4突变);重编程方法:电穿孔导入Yamanaka因子和Lin28;培养条件:Matrigel包被,mTeSR培养基。 阅读提示:Methods 2.1节 |
| 脑类器官生成 | 使用STEMdiff Cerebral Organoid kit,第0天接种密度90,000 cells/ml,96孔板,每个EB形成条件;第5-7天转移至24孔板;第7-10天包埋Matrigel;第10天起使用成熟培养基,轨道摇床65rpm,每周换液频率。 阅读提示:Methods 2.2节 |
| 脑类器官培养时间点 | 观察时间点:第6周、第12周、第20周。 阅读提示:Results 3.1-3.7节及图例 |
| 细胞增殖与凋亡检测 | Ki-67免疫荧光染色;caspase-3和caspase-9免疫荧光染色及Western blot。 阅读提示:Results 3.2和3.3节 |
| UPR信号通路检测 | 免疫荧光检测PERK、CHOP、ATF4、ATF6、XBP1、GADD34表达。 阅读提示:Results 3.4节 |
| 神经发育检测 | 免疫荧光检测SOX2、TBR2、TUJ1、TBR1、CTIP2、SATB2。 阅读提示:Results 3.5节 |
| 胶质细胞分化检测 | 免疫荧光检测GFAP、GFAPδ、nestin、αB-crystallin、PDGFRα、O4、Olig2、MBP;透射电镜观察髓鞘和G-ratio计算。 阅读提示:Results 3.6和3.7节 |
| 统计分析 | SPSS v26.0和GraphPad Prism v9.0;正态性检验(Kolmogorov-Smirnov)、方差齐性检验(F-test);两组比较用t-test或Mann-Whitney U,三组用one-way ANOVA或Kruskal-Wallis。 阅读提示:Methods 2.6节 |