TKI诱导TRIM15表达上调
验证TKI处理是否影响TRIM15表达
用regorafenib和sorafenib处理Huh7和Hep3B细胞,检测TRIM15蛋白和mRNA水平,并建立耐药细胞系。
TRIM15 forms a regulatory loop with the AKT/FOXO1 axis and LASP1 to modulate the sensitivity of HCC cells to TKIs.
包含细胞实验、动物模型和患者样本等多层级验证,涵盖功能验证(CCK-8、凋亡、迁移)和机制验证(Co-IP、泛素化、ChIP-qPCR)。
Huh7细胞 Hep3B细胞 裸鼠异种移植模型 HCC患者肿瘤样本
TKI处理时间及剂量(如3 μM regorafenib或sorafenib处理不同时间) TRIM15敲低或过表达对IC50的影响 AKT/FOXO1轴抑制剂(MK2206、AS1842856)处理 LASP1 K75A突变对泛素化和核转位的影响 裸鼠异种移植实验的细胞注射量和给药方式
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TKI处理是否影响TRIM15表达
用regorafenib和sorafenib处理Huh7和Hep3B细胞,检测TRIM15蛋白和mRNA水平,并建立耐药细胞系。
探究TKI诱导TRIM15上调的机制
使用数据库预测转录因子,ChIP-qPCR验证FOXO1结合TRIM15启动子,报告基因实验验证启动子活性,并通过siRNA或抑制剂干扰FOXO1。
验证TRIM15是否影响HCC细胞对TKI的敏感性
敲低或过表达TRIM15,检测IC50、凋亡和体内肿瘤生长。
探究TRIM15调控TKI敏感性的下游机制
RNA-seq和GSEA分析,Western blot检测AKT和S6K1磷酸化,迁移和侵袭实验。
验证LASP1是否为TRIM15的关键下游效应分子
Co-IP和GST pull-down验证相互作用,敲低LASP1检测对AKT和Snail的影响,以及功能实验。
阐明TRIM15调控LASP1的分子机制
检测LASP1的泛素化类型,通过质谱鉴定泛素化位点,构建K75A突变体验证功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Life-iLab Biotech | AC03L055 | |
| 支原体检测试剂盒 | InvivoGen | -- | |
| 药物处理 | 瑞戈非尼 | Selleck | S1178 |
| 索拉非尼 | Selleck | S7397 | |
| AS1842856 | Selleck | S8222 | |
| MK2206 | Selleck | S1078 | |
| MG132 | Selleck | S2619 | |
| 细胞培养 | OmicLink™表达克隆(CMV启动子) | GeneCopoeia | EX-V0006-M14 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-7AAD试剂盒 | 4A Biotech | FXP147-100 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白A+G琼脂糖珠 | Beyotime | P2029 | |
| 免疫球蛋白G | Beyotime | A7007 | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ECL检测试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ChemiDoc XRS凝胶成像系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| GST pull-down | BeyoMag™抗GST磁珠 | Beyotime | P2138 |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| PrimeScript™逆转录试剂盒 | Takara Bio Inc. | RR037A | |
| TB Green™快速qPCR预混液 | Takara Bio Inc. | RR430A | |
| ChIP-qPCR | 染色质提取试剂盒 | Abcam | ab117152 |
| 一步法磁珠ChIP试剂盒 | Abcam | ab156907 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | Beyotime | C0037 |
| 血管生成实验 | 基质胶 | BD Bioscience | -- |
| 侵袭实验 | BioCoat基质胶侵袭小室 | BD Biosciences | -- |
| 动物实验 | BALB/C-nu/nu裸鼠 | -- | -- |
| Western blot | 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig |
| 抗TRIM15抗体 | Proteintech | 13623-1-AP | |
| 抗LASP1抗体 | Proteintech | 68080-1-Ig | |
| 抗FOXO1抗体 | Cell Signaling Technology | 2880S | |
| 抗PARP1抗体 | Proteintech | 13371-1-AP | |
| 抗AKT抗体 | Bioss antibodies | bsm-33278M | |
| 抗S6K1抗体 | Cell Signaling Technology | 2708 | |
| 抗磷酸化S6K1(T398)抗体 | Cell Signaling Technology | 9209 | |
| 抗裂解半胱天冬酶3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 抗半胱天冬酶3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| 抗磷酸化AKT(S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S | |
| 抗磷酸化AKT(T308)抗体 | Cell Signaling Technology | 13038 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件(DMEM+10%FBS,37°C,5%CO2) 阅读提示:Methods and materials 中 Cell lines, chemicals and antibodies |
| TKI处理 | 药物浓度和时间(如3 μM regorafenib或sorafenib处理不同时间) 阅读提示:图1图例及Results部分 |
| 基因敲低或过表达 | siRNA/shRNA序列、转染时间和质粒构建 阅读提示:Methods和补充材料Table S1 |
| IC50测定 | 细胞密度、药物梯度范围、处理时间和CCK-8检测条件 阅读提示:Cell Counting Kit-8 assay方法部分 |
| 体内异种移植 | 小鼠品系、年龄、皮下注射细胞数(5×10^6)、肿瘤测量频率和给药剂量(如50 mg/kg sorafenib口服) 阅读提示:Nude mice xenografts assay方法部分及图5图例 |