检测SKA1在喉癌组织及细胞中的表达
评估SKA1在喉癌中的表达水平及其与临床病理参数的关系
使用组织微阵列进行IHC染色,分析44例喉癌组织和39例癌旁组织中SKA1蛋白表达;通过qRT-PCR检测4种喉癌细胞系中SKA1 mRNA表达。
SKA1 is overexpressed in laryngocarcinoma and modulates cell growth via P53 signaling pathway.
研究包含临床组织样本分析、体外细胞功能实验、动物模型及机制验证,共四个独立证据层级。
AMC-HN-8细胞系 TU212细胞系 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型 喉癌组织微阵列
SKA1表达:IHC评分、qRT-PCR、Western blot验证 细胞系:AMC-HN-8和TU212,培养条件:DMEM+10%FBS、H-DMEM+10%FBS 基因敲低:慢病毒介导的shRNA,靶序列GAGGACTTACTCGTTATGTTA,感染效率>80% Pifithrin-α处理浓度和时间:文中未明确说明 动物模型:4周龄雌性BALB/c裸鼠,皮下注射1×10^7细胞,10只/组,观察20天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SKA1在喉癌中的表达水平及其与临床病理参数的关系
使用组织微阵列进行IHC染色,分析44例喉癌组织和39例癌旁组织中SKA1蛋白表达;通过qRT-PCR检测4种喉癌细胞系中SKA1 mRNA表达。
验证SKA1敲低效率,为后续功能实验提供细胞模型
使用慢病毒介导的shRNA感染AMC-HN-8和TU212细胞,通过荧光观察、qRT-PCR和Western blot验证敲低效率。
评估SKA1敲低对喉癌细胞增殖、迁移和凋亡的影响
通过Celigo细胞计数、CCK-8、集落形成、伤口愈合、Transwell和流式细胞术检测细胞增殖、迁移和凋亡变化。
验证SKA1敲低在体内对肿瘤生长的影响
将SKA1敲低和对照AMC-HN-8细胞皮下注射至裸鼠,测量肿瘤体积和重量,并通过IHC检测Ki67水平。
探索SKA1调控喉癌的潜在下游信号通路
使用Human Phospho-Kinase Array检测敲低SKA1后39种磷酸化激酶的变化;随后用Pifithrin-α处理,检测细胞增殖、凋亡及P53、p-P53、Bax、Bcl-2蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | SKA1抗体 | BIOSS | bs-7846R |
| Ki-67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| 山羊抗兔IgG H&L(HRP) | Abcam | -- | |
| DAB显色剂 | -- | -- | |
| 苏木素 | Baso Diagnostics Inc. | -- | |
| 中性树脂 | China National Pharmaceutical Group Co., Ltd. | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Sigma | -- |
| cDNA合成 | Promega M-MLV逆转录试剂盒 | Promega | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green预混液试剂盒 | Vazyme | -- |
| Applied Biosystems 7500序列检测系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| SKA1抗体 | Bioss | bs-7846R | |
| P53抗体 | Proteintech | 60283-2-Ig | |
| p-P53抗体 | Proteintech | 28961-1-AP | |
| Bax抗体 | Wuhan Sanying | 50599-2-Ig | |
| Bcl-2抗体 | Abcam | ab182858 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-lg | |
| 山羊抗兔二抗 | Beyotime | A0208 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Beyotime | A0216 | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物试剂盒 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | Celigo图像细胞仪 | Nexcelom Bioscience | -- |
| CCK-8试剂 | -- | -- | |
| 集落形成实验 | 吉姆萨染液 | Dingguo | -- |
| 荧光显微镜 | Olympus | -- | |
| 伤口愈合实验 | Cellomics高内涵分析系统 | Thermo | -- |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Costar | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC | eBioscience | -- |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 机制探索 | 人类磷酸化激酶阵列膜 | -- | -- |
| 药物处理 | Pifithrin-α | -- | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Jiangsu Jicui Yaokang Biotechnology Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 组织微阵列样本来源、IHC评分标准 阅读提示:Methods: Collection of tissues samples和Immunohistochemistry (IHC) |
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、培养条件 阅读提示:Methods: Cell lines and cell culture |
| 基因敲低 | shRNA靶序列、慢病毒滴度、感染时间、感染效率 阅读提示:Methods: Establishment of stably infected cells |
| 体外功能实验 | 细胞接种密度、培养时间、检测方法 阅读提示:Methods: Cell proliferation detection, Colony forming assay, Wound healing assay, Transwell assay, Detection of cell apoptosis |
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、周龄、细胞注射量、观察时间、肿瘤体积测量公式 阅读提示:Methods: The construction of nude mouse tumor formation model |
| 机制验证 | Pifithrin-α浓度、处理时间、激酶阵列方法、Western blot抗体信息 阅读提示:Methods: Human phospho-Kinase array-membrane, Western blot assay, Results: P53/bcl-2/bax signaling pathway |