LPA对MPNST细胞增殖和迁移的影响
确定外源性LPA是否影响MPNST细胞的增殖和迁移。
用不同浓度油酰-LPA处理三种MPNST细胞系(ST88-14、STS-26T、90.8TL),进行3H-胸苷掺入实验和Transwell迁移实验。
LPAR1 and aberrantly expressed LPAR3 differentially promote the migration and proliferation of malignant peripheral nerve sheath tumor cells.
包含体外细胞系模型、患者肿瘤样本、RNA-seq和全外显子测序、shRNA敲低功能验证以及R-Ras/ROCK信号通路机制验证等多层次实验。
人MPNST细胞系(ST88-14、STS-26T、90.8TL等) 非肿瘤性人雪旺细胞 手术切除的MPNST肿瘤样本
LPAR1和LPAR3在MPNST细胞中的表达水平(RNA-Seq和RT-qPCR验证) LPAR1和LPAR3的敲低效率(shRNA)及其对增殖和迁移的影响 油酰-LPA处理浓度(1 nM至10 μM)和持续时间(48小时增殖,6小时迁移) DN R-Ras和Y27632抑制剂的浓度(2 μg/mL多西环素诱导,10 μM Y27632)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定外源性LPA是否影响MPNST细胞的增殖和迁移。
用不同浓度油酰-LPA处理三种MPNST细胞系(ST88-14、STS-26T、90.8TL),进行3H-胸苷掺入实验和Transwell迁移实验。
确定MPNST细胞和肿瘤样本中LPA受体的表达和突变状态。
通过RNA-Seq和RT-qPCR检测非肿瘤雪旺细胞和16个MPNST细胞系中LPAR1-6的表达;通过免疫组化检测手术切除MPNST中LPAR1和LPAR3的表达;通过全外显子测序检测LPAR基因和ENPP2的突变。
确定LPAR1和LPAR3在LPA诱导的增殖和迁移中的作用。
在ST88-14和STS-26T细胞中使用shRNA敲低LPAR1或LPAR3,评估对增殖(Celigo增殖实验,7天)和迁移(Transwell)的影响。
确定LPA诱导的迁移是否依赖于R-Ras和ROCK信号通路。
在ST88-14和STS-26T细胞中使用多西环素诱导的DN R-Ras突变体,检测LPA诱导的迁移和ERK/AKT磷酸化;使用ROCK抑制剂Y27632检测对LPA诱导迁移的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 油酰-LPA | Avianti Polar Lipids | #857128X |
| Ki16425 | Cayman Chemical Company | #10012659 | |
| Y27632 | Selleckchem | #S6390 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| RNA-seq | TruSeq RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- |
| 全外显子测序 | QIAamp DNA血液迷你试剂盒 | Qiagen | #51104 |
| SureSelectXT人类全外显子试剂盒 | Agilent Technologies | -- | |
| 免疫组化 | LPAR1抗体 | Abcam | #ab166903 |
| LPAR3抗体 | Abcam | #137497 | |
| 免疫细胞化学 | LPAR1抗体 | Novus Biologicals | NBPI-03363 |
| LPAR3抗体 | Bioss | bs-2882R | |
| 质膜标志物抗体 | Abcam | ab7671 | |
| 细胞染色 | Hoechst 33258 | -- | -- |
| 鬼笔环肽 | -- | -- | |
| 免疫细胞化学 | Prolong Diamond封片剂 | Invitrogen | -- |
| 迁移实验 | Transwell小室 | Becton Dickinson Labware | -- |
| 成像 | EVOS M5000成像系统 | Thermo Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | MPNST细胞系来源和培养条件(DMEM10,10% FCS,青霉素/链霉素) 阅读提示:Materials and Methods 2.2 |
| LPA刺激 | 油酰-LPA浓度(1 nM-10 μM);增殖实验刺激48小时,迁移实验刺激6小时 阅读提示:Results 3.1, Figure 1 |
| 受体表达分析 | RNA-Seq和RT-qPCR检测LPAR1-6的表达;全外显子测序检测LPAR基因和ENPP2突变 阅读提示:Materials and Methods 2.4, 2.10; Results 3.2 |
| shRNA敲低 | shRNA序列(表S1);转导效率;敲低效率验证(RT-qPCR) 阅读提示:Materials and Methods 2.6; Results 3.3, Figure S5 |
| 功能实验 | 增殖实验(Celigo,7天,2000细胞/孔);迁移实验(Transwell,6小时,多聚赖氨酸/层粘连蛋白包被) 阅读提示:Materials and Methods 2.8, 2.9; Results 3.1 |
| 信号通路验证 | DN R-Ras诱导(多西环素2 μg/mL,48小时);Y27632浓度(10 μM);pERK/pAKT检测 阅读提示:Materials and Methods 2.9, 2.11; Results 3.4 |