基于数字方法的SARS-CoV-2特异性抗体反应超灵敏监测揭示IgG血清转化的时间为一周

Ultrasensitive monitoring of SARS-CoV-2-specific antibody responses based on a digital approach reveals one week of IgG seroconversion.

作者信息Feiyang Ou, Danyun Lai, Xiaojun Kuang, Ping He, Yang Li, He-Wei Jiang, Wei Liu, Hongping Wei, Hongchen Gu, Yuan Qiao Ji, Hong Xu, Sheng-Ce Tao
PMID36174360
发布时间2022-12-01
DOI10.1016/j.bios.2022.114710

实验完整度

高

包含多层级实验:建立并优化Simoa测定法,与流式细胞术和ELISA对比灵敏度;验证疫苗免疫人群及恒河猴感染模型的血清转化;使用临床样本进行诊断性能评估。

主要模型

灭活病毒疫苗免疫志愿者 COVID-19康复患者 健康对照 SARS-CoV-2感染的恒河猴

重点核对

免疫队列样本:8名接种灭活病毒疫苗(BBIBP CorV)的志愿者,共11个时间点纵向血清 检测抗体浓度:RBD包被磁珠时,抗人IgG和IgM检测抗体浓度为0.3 μg/mL;S2-78包被时为0.5 μg/mL 血清稀释:UIM-COVID-19测定中,疫苗接种监测时血清稀释1:200;诊断性能评估时稀释1:10,000 流式细胞术对照:血清稀释1:200,使用Cy5标记的检测抗体,孵育1小时 灵敏度验证:使用SARS-CoV-2标准中和抗体(NIFDC,Cat No. 280034-202001)进行校准

摘要

COVID-19仍在持续,而许多人已接种疫苗。与核酸检测(NAT)相比,基于抗体的免疫测定更快、更方便。然而,其应用受到较低灵敏度的阻碍,且传统免疫测定中,病原体特异性抗体(如IgM或IgG)的可测量血清转化时间远落后于核酸。在此,通过结合单分子阵列平台(Simoa)、RBD和先前鉴定的SARS-CoV-2 S2蛋白衍生12氨基酸肽(S2-78),我们开发并优化了一种超灵敏测定法(UIM-COVID-19测定法)。测试了来自三个来源的血清,即康复者、灭活病毒疫苗免疫供体和野生型真实SARS-CoV-2感染的恒河猴。UIM-COVID-19测定的灵敏度比传统流式细胞术高100–10,000倍,流式细胞术是目前相对灵敏的检测方法。对于已建立的以RBD为探针的UIM-COVID-19测定,疫苗接种后IgG和IgM血清转化时间分别为7.5天和8.6天,而流式细胞术测定分别为21.4天和24天。此外,使用S2-78作为探针,UIM-COVID-19测定可以将COVID-19患者(康复者)与健康人和其他疾病患者区分开来,AUC范围为0.85–0.95。总之,我们开发的UIM-COVID-19是一种有前景的超灵敏生物检测策略,有潜力应用于免疫学研究和诊断。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
使用更高灵敏度的单分子阵列测定能否缩短SARS-CoV-2特异性IgG和IgM抗体的血清转化检测时间,并评估其在COVID-19诊断中的应用。
核心机制
超灵敏检测平台(Simoa)通过数字化单分子计数将检测灵敏度提高至传统方法的100–10,000倍,从而能够在抗体滴度极低时检测到血清转化,将IgG和IgM的血清转化时间分别提前至疫苗接种后7.5天和8.6天,比传统流式细胞术提前约两周。
主要证据
UIM-COVID-19测定在8名疫苗接种者纵向血清中检测到IgG和IgM血清转化时间分别为7.5天和8.6天,而流式细胞术为21.4天和24天;在恒河猴感染模型中,血清转化时间为6.6天;S2-78肽探针在区分COVID-19康复者与健康人和其它疾病时AUC为0.983和0.897。
研究意义
该研究表明,通过更高灵敏度的检测平台可以更早地捕获病毒特异性抗体反应,为免疫学研究和COVID-19的早期诊断提供了新的策略,并有望扩展到其他病毒感染的早期检测。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立UIM-COVID-19超灵敏免疫测定

开发并优化基于Simoa平台的超灵敏检测方法,用于SARS-CoV-2特异性IgG和IgM抗体。

将RBD蛋白和S2-78肽分别包被在磁珠上,使用生物素化的抗人IgG和IgM检测抗体以及链霉亲和素-β-半乳糖苷酶形成免疫复合物,通过HD-X Analyzer进行自动化检测,计算平均酶标记蛋白分子数。

2

评估测定灵敏度并与传统方法比较

比较UIM-COVID-19与流式细胞术和ELISA的灵敏度。

使用连续稀释的血清样本和标准中和抗体,分别通过Simoa、流式细胞术和ELISA检测IgG和IgM抗体,计算LoD并比较。

3

监测疫苗接种后的血清转化时间

确定灭活病毒疫苗诱导的IgG和IgM抗体的最早血清转化时间。

收集8名接种BBIBP CorV疫苗的志愿者在接种前至第二剂后约2周的11个时间点血清,用UIM-COVID-19和流式细胞术检测RBD特异性IgG和IgM,并用LOESS回归确定血清转化点。

4

评估基于S2-78肽的诊断性能

评估S2-78肽在区分COVID-19康复者与健康人和其它疾病患者中的诊断能力。

使用UIM-COVID-19和流式细胞术检测来自康复者、健康对照和其它疾病患者的血清中IgG和IgM抗体,生成ROC曲线并计算AUC。

5

验证恒河猴感染模型中的血清转化

在感染模型中验证UIM-COVID-19能否更早检测到抗体反应。

使用UIM-COVID-19检测感染野生型SARS-CoV-2或B.1.351变体的恒河猴血清样本,连续8天采样,评估血清转化时间。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
HD-X分析仪Quanterix--
BD Accuri C6流式细胞仪BD--
LuxScan 10K-A扫描仪CapitalBio Corporation--
SpectraMax i3X酶标仪Molecular Devices--
GenePix Pro 6.0软件Molecular Devices--
GraphPad Prism 8.0----
RStudio----
Origin 2016----
Cy3标记的羊抗人IgGJackson ImmunoResearch109-165-008
Alexa Fluor 647标记的驴抗人IgMJackson ImmunoResearch709-605-073
Cy5标记的羊抗人IgGSangon BiotechD111118
Cy5标记的羊抗人IgMBiosynthesis Biotechnologybs-0345G-Cy5
聚乙烯亚胺Sigma-Aldrich181978-250G
磺基-SMCC交联剂Sigma-AldrichM6035
EDC交联剂Sigma-AldrichE1769
NHS酯Thermo Fisher Scientific24500
Proclin 300防腐剂Sigma-Aldrich48914-U
S2-78肽GL Biochem--
RBD蛋白Sanyou BiopharmaceuticalsLZQ20200809
生物素化羊抗人IgGSangon BiotechD110152
生物素化羊抗人IgMSangon BiotechD110159
链霉亲和素-β-半乳糖苷酶----
SARS-CoV-2标准中和抗体National Institutes for Food and Drug Control280034-202001
SARS-CoV-2 RBD特异性IgG和IgM ELISA试剂盒Vazyme BiotechDD3103,

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
样本收集与队列
队列构成:疫苗接种者8名;康复者47例;健康对照43例;其他疾病50例;恒河猴4只。年龄、性别、来源需核对。
阅读提示:Materials and methods: Sample collection and cohorts; Table 1
免疫测定
磁珠浓度、检测抗体浓度、SBG浓度、孵育时间(两步法或三步法)、血清稀释度
阅读提示:Materials and methods: Establishment of the UIM-COVID-19 assay
流式细胞术
磁珠数量、血清稀释比例(1:200)、检测抗体体积及浓度、孵育条件(37°C 1小时)
阅读提示:Materials and methods: Establishment of the flow cytometry assay
数据分析
标准曲线拟合方法(四参数逻辑回归)、血清转化判定标准(LOESS回归和99%置信区间)、统计检验(Wilcoxon符号秩检验)
阅读提示:Materials and methods: Data analysis and visualization; Results: 3.2