临床样本收集与验证
比较重度子痫前期患者和正常孕妇胎盘中miR-4443的表达差异,验证前期测序结果。
采集sPE组(n=10)和正常组(n=10)胎盘组织,通过qRT-PCR检测miR-4443表达水平,并统计临床特征。
miR-4443/MMP2 suppresses the migration and invasion of trophoblasts through the HB-EGF/EGFR pathway in preeclampsia.
包含临床样本验证(胎盘组织)、细胞功能实验(迁移/侵袭)、分子机制验证(荧光素酶报告基因、Western blot),但缺乏动物体内实验。
HTR-8/SVneo细胞系 重度子痫前期患者胎盘组织 JAR细胞系 JEG-3细胞系
临床样本:sPE组和正常对照组各10例,胎盘组织采集需注意诊断标准(ACOG指南) 细胞处理:miR-4443 mimic/inhibitor及MMP2 siRNA/过表达质粒转染,使用Lipofectamine 3000 迁移/侵袭实验:迁移5×10^4细胞/孔,侵袭1.5×10^5细胞/孔,基质胶预包被(侵袭),迁移24h,侵袭48h 荧光素酶报告基因:HTR-8/SVneo细胞共转染WT/MUT MMP2 3'-UTR质粒和miR-4443 mimic/inhibitor,48h后检测 Western blot:检测MMP2、HB-EGF、EGFR、p-EGFR、MEK、p-MEK、ERK、p-ERK,使用特异性抗体,GAPDH作为内参
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较重度子痫前期患者和正常孕妇胎盘中miR-4443的表达差异,验证前期测序结果。
采集sPE组(n=10)和正常组(n=10)胎盘组织,通过qRT-PCR检测miR-4443表达水平,并统计临床特征。
选择最适合的滋养层细胞系用于后续功能实验。
检测三种滋养层细胞系(HTR-8/SVneo、JAR、JEG-3)中miR-4443的表达及迁移侵袭能力,确定HTR-8/SVneo为后续实验模型。
验证miR-4443对滋养层细胞迁移和侵袭能力的影响。
在HTR-8/SVneo细胞中转染miR-4443 mimics或inhibitor,通过transwell实验检测迁移和侵袭能力,并用CCK-8实验评估增殖。
预测miR-4443的靶基因并通过实验验证。
利用TargetScan预测靶基因,并通过RNA-seq分析转染miR-4443 mimics后的差异表达基因,确认MMP2为候选靶点。在胎盘组织和细胞中检测MMP2表达与miR-4443的相关性,并通过荧光素酶报告基因实验验证miR-4443直接结合MMP2 3'-UTR。
证实miR-4443通过抑制MMP2影响滋养层细胞迁移和侵袭。
转染MMP2 siRNA或过表达质粒观察迁移侵袭变化,并共转染miR-4443 mimics和MMP2过表达质粒(或miR-4443 inhibitor和MMP2 siRNA)进行拯救实验。
验证miR-4443通过MMP2抑制HB-EGF/EGFR信号通路的假设。
通过Western blot检测转染miR-4443 mimic/inhibitor或共转染MMP2相关质粒后,HB-EGF/EGFR通路关键蛋白(HB-EGF、EGFR、p-EGFR、MEK、p-MEK、ERK、p-ERK)的表达变化,并用免疫组化验证胎盘组织中的HB-EGF表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Transgen | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Sangon Biotech | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取与定量 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| NanoDrop ND-2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| QuantStudio 7 Flex实时荧光定量PCR仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Accurate Biology | -- | |
| TransScript All-in-One第一链cDNA合成SuperMix用于qPCR | TransGen | -- | |
| SYBR Green Premix Pro Taq HS qPCR试剂盒 | Accurate Biology | -- | |
| 迁移/侵袭实验 | Transwell上室(8μm孔径膜) | Corning | -- |
| 基质胶 | BD Bioscience | -- | |
| 结晶紫 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | Sangon Biotech | -- | |
| CCK-8实验 | CCK-8溶液 | Yeasen | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Invitrogen | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Yeasen | -- | |
| 磷酸酶抑制剂 | Yeasen | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗MMP2一抗 | Proteintech | 10,373-2-AP | |
| 抗HB-EGF一抗 | Abcam | ab185555 | |
| 抗EGFR一抗 | Bioss | bs-34,018 R | |
| 抗p-EGFR一抗 | Abcam | ab40815 | |
| 抗MEK一抗 | Abcam | ab178876 | |
| 抗p-MEK一抗 | CST | 9154S | |
| 抗ERK一抗 | CST | 4695 T | |
| 抗p-ERK一抗 | CST | 4370 T | |
| 抗GAPDH一抗 | Abcam | ab181602 | |
| 山羊抗兔IgG-HRP二抗 | Abcam | ab6721 | |
| ECL检测试剂 | Bio-Rad | -- | |
| Amersham Imager 600凝胶成像系统 | Cytiva | -- | |
| 荧光素酶报告基因实验 | pmirGLO载体 | GenePharma | -- |
| 双荧光素酶检测 | Promega | -- | |
| 免疫组化 | 二甲苯 | Sinopharm | -- |
| 无水乙醇 | Sangon | -- | |
| HRP/DAB免疫组化检测试剂盒 | Abcam | ab64264 | |
| RNA测序 | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| TruSeq链式mRNA LT样品制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Illumina测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本采集 | 样本来源:重度子痫前期患者及正常孕妇胎盘组织;样本量:每组10例;诊断标准:ACOG指南;采样位置:脐带插入点附近母体面,0.5h内取4个组织块(约0.5 cm³) 阅读提示:Materials and methods: Sample collection |
| 细胞培养与转染 | 细胞系:HTR-8/SVneo、JAR、JEG-3;培养基:RPMI-1640(10% FBS, 100 μg/mL链霉素,100 U/mL青霉素);培养条件:37°C,5% CO2;转染试剂:Lipofectamine 3000;转染物:miR-4443 mimic/inhibitor及对照,siRNA-MMP2及对照,MMP2过表达质粒及空载体 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Oligonucleotide, plasmid construction and transfection |
| 迁移/侵袭实验 | 迁移实验:5×10^4细胞/孔,200 μL无血清培养基,下室600 μL含10% FBS培养基,24h;侵袭实验:1.5×10^5细胞/孔,上室预铺Matrigel(3h),48h;计数:三随机视野(100×) 阅读提示:Materials and methods: Migration/invasion assay; Figure legends 1-2 |
| 荧光素酶报告基因 | 细胞:HTR-8/SVneo(50-70%密度);共转染:WT/MUT MMP2 3'-UTR质粒与miR-4443 mimic/inhibitor或对照,使用Lipofectamine 3000;检测时间:48h后;检测方法:双荧光素酶检测 阅读提示:Materials and methods: Luciferase reporter assay |
| Western blot | 抗体及稀释比例:MMP2 (1:1000, Proteintech, 10,373-2-AP), HB-EGF (1:10,000, Abcam, ab185555), EGFR (1:1000, Bioss, bs-34,018 R), p-EGFR (1:1000, Abcam, ab40815), MEK (1:20,000, Abcam, ab178876), p-MEK (1:1000, CST, 9154S), ERK (1:1000, CST, 4695 T), p-ERK (1:2000, CST, 4370 T), GAPDH (1:3000, Abcam, ab181602);二抗:goat anti-rabbit IgG-HRP (1:10,000);孵育条件:一抗4°C过夜,二抗室温1h 阅读提示:Materials and methods: Western blot assay; Figure legends 3, 5, 7 |