模型建立与表型评估
建立TGF-β1诱导的HK-2细胞EMT和炎症模型,并验证EMT和炎症的表型变化。
用TGF-β1处理HK-2细胞,观察细胞形态变化,检测炎症因子(TNF-α、IL-6、IL-1β、IL-4、IL-10)和EMT标志物(collagen I、collagen III、α-SMA、vimentin、N-cadherin、E-cadherin)的水平。
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived exosomal miR-335-5p attenuates the inflammation and tubular epithelial-myofibroblast transdifferentiation of renal tubular epithelial cells by reducing ADAM19 protein levels.
包含细胞模型(HK-2)和hucMSC外泌体,进行了功能验证(miR-335-5p mimic/inhibitor、ADAM19过表达/敲低)及机制验证(双荧光素酶报告基因),但缺乏动物模型和患者样本。
TGF-β1诱导的HK-2人肾小管上皮细胞 hucMSC来源的外泌体
HK-2细胞用10 ng/ml重组人TGF-β1处理24小时以诱导EMT hucMSC外泌体处理浓度:10、20、40 μg蛋白当量,处理24小时 miR-335-5p mimic、inhibitor、si-ADAM19和ov-ADAM19转染 ADAM19 3'UTR野生型和突变型双荧光素酶报告基因实验 qPCR内参U6,Western blot内参GAPDH
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立TGF-β1诱导的HK-2细胞EMT和炎症模型,并验证EMT和炎症的表型变化。
用TGF-β1处理HK-2细胞,观察细胞形态变化,检测炎症因子(TNF-α、IL-6、IL-1β、IL-4、IL-10)和EMT标志物(collagen I、collagen III、α-SMA、vimentin、N-cadherin、E-cadherin)的水平。
从hucMSC培养上清中提取外泌体并鉴定其特性,然后评估其对TGF-β1诱导的HK-2细胞EMT和炎症的影响。
收集hucMSC无血清条件培养基,用总外泌体分离试剂提取外泌体,TEM、NTA和Western blotting鉴定。将不同浓度的外泌体处理TGF-β1诱导的HK-2细胞,检测EMT和炎症指标。
筛选hucMSC外泌体中可能介导抗纤维化作用的miRNA。
结合GEO数据集(GSE69909、GSE76549)和文献数据,筛选出在hucMSC外泌体中高表达且在肾纤维化组织中低表达的miRNA,最终确定miR-335-5p,并在细胞中验证其表达变化。
验证hucMSC外泌体中的miR-335-5p是否介导其抗EMT和抗炎作用。
用miR-335-5p抑制剂转染hucMSC,收集外泌体处理TGF-β1诱导的HK-2细胞,检测EMT和炎症指标。
预测并验证miR-335-5p的直接靶基因。
利用StarBase3.0、miRWalk预测靶基因,与GSE20247差异表达基因取交集,筛选ADAM19,通过双荧光素酶报告基因验证miR-335-5p与ADAM19 3'UTR的结合。
验证ADAM19在EMT和炎症中的作用,并确认miR-335-5p通过下调ADAM19发挥功能。
在TGF-β1诱导的HK-2细胞中敲低或过表达ADAM19,检测EMT和炎症指标;并在miR-335-5p mimic基础上过表达ADAM19,观察是否逆转miR-335-5p的效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| α-MEM培养基 | -- | -- | |
| 药物处理 | 重组人TGF-β1 | R&D Systems | -- |
| 外泌体提取 | 总外泌体分离试剂 | GENESEED | -- |
| 外泌体鉴定 | 日立H-7650透射电子显微镜 | Hitachi | H-7650 |
| ZetaView® 纳米粒子追踪分析仪 | Particle Metrix | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript™逆转录试剂盒 | Takara | -- | |
| Mir-X miRNA qPCR SYBR试剂盒 | Clontech Laboratories, Inc. | -- | |
| 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | 7500 | |
| Western blotting | 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- |
| 抗ADAM19抗体 | Abcam | ab191457 | |
| 抗胶原蛋白I抗体 | Abcam | ab34710 | |
| 抗胶原蛋白III抗体 | Abcam | ab184993 | |
| 抗α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Abcam | ab5831 | |
| 抗波形蛋白抗体 | Abcam | ab92547 | |
| 抗N-钙粘蛋白抗体 | Abcam | ab76011 | |
| 抗E-钙粘蛋白抗体 | Abcam | ab40772 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)和小鼠/人吸附HRP | Abcam | ab6702 | |
| 增强化学发光试剂 | Thermo Scientific Pierce | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Bioss | bsk11004 |
| IL-4 ELISA试剂盒 | Bioss | bsk11004 | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Bioss | bsk11010 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Bioss | bsk11014 | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Bioss | bsk11007 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Bioss | bsk11001 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- |
| miR-335-5p模拟物和抑制剂 | RiboBio | -- | |
| 阴性对照模拟物/抑制剂 | RiboBio | -- | |
| si-ADAM19和si-NC | RiboBio | -- | |
| pcDNA 3.1载体 | GENEWIZ | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | psi-CHECK-2载体 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| 统计分析 | SPSS软件 | IBM | 19.0 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与诱导 | HK-2细胞使用DMEM/F12+10% FBS培养,37°C、5% CO2;TGF-β1处理浓度、时间,血清饥饿条件 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 外泌体提取与处理 | hucMSC培养条件、无血清培养基、收集时间;外泌体提取试剂;外泌体处理浓度(10、20、40 μg)和时间 阅读提示:Materials and methods: Exosome collection and identification; Figure 2 legend |
| miRNA靶基因验证 | 双荧光素酶报告基因实验的转染组合、时间;ADAM19 3'UTR野生型和突变型序列 阅读提示:Materials and methods: Dual-luciferase reporter assay; Results section and Figure 6 |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 3000),各转染物的浓度和转染时间 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection |
| 检测指标 | 炎症因子和EMT标志物的检测方法及内参(GAPDH、U6) 阅读提示:Materials and methods: Western blotting, RT-qPCR, ELISA |