建立ALI模型并验证铁死亡贡献
验证铁死亡在ALI中的作用。
建立CS、LPS和X射线诱导的ALI小鼠模型,使用ferrostatin-1和deferoxamine干预,检测铁死亡相关指标(PTGS-2、铁含量、GSH、MDA、8-oxo-dG等)。
STAT6 inhibits ferroptosis and alleviates acute lung injury via regulating P53/SLC7A11 pathway.
包含体外细胞实验、肺上皮特异性敲除小鼠模型、过表达救援实验及生物信息学分析,并进行功能验证和机制验证。
小鼠急性肺损伤模型(CS、LPS、X射线诱导) 肺上皮特异性STAT6敲除小鼠(STAT6cKO) HBE人支气管上皮细胞系 THP-1巨噬细胞与HBE细胞共培养体系
STAT6在ALI中的表达和激活(mRNA、蛋白、核转位) STAT6敲除或过表达对铁死亡指标(PTGS-2、GSH、MDA、铁含量)的影响 STAT6与CBP竞争性结合抑制P53乙酰化的机制 STAT6对SLC7A11启动子活性和表达的影响 STAT6过表达对CS和LPS诱导肺损伤的缓解作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证铁死亡在ALI中的作用。
建立CS、LPS和X射线诱导的ALI小鼠模型,使用ferrostatin-1和deferoxamine干预,检测铁死亡相关指标(PTGS-2、铁含量、GSH、MDA、8-oxo-dG等)。
探究STAT6与铁死亡的关系。
通过qRT-PCR、Western blot、免疫组化检测STAT6表达和激活;利用GEO数据集进行生物信息学分析(GSEA、PPI网络)评估STAT6与铁死亡的相关性。
验证STAT6对铁死亡和肺损伤的影响。
构建肺上皮特异性STAT6敲除小鼠(STAT6cKO)和细胞模型,通过敲低或过表达STAT6,检测铁死亡指标和肺损伤程度。
探究STAT6调控P53/SLC7A11通路的机制。
通过免疫共沉淀、ChIP、双荧光素酶报告基因等实验,验证STAT6与CBP竞争性结合,抑制P53乙酰化,恢复SLC7A11表达。
验证STAT6过表达对ALI的缓解作用。
通过慢病毒介导的STAT6过表达,在CS和LPS诱导的ALI模型中评估其对铁死亡和肺损伤的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Hyclone | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 佛波醇-12-豆蔻酸-13-乙酸酯 | Sigma | -- | |
| 动物模型建立 | 结晶二氧化硅颗粒(石英DQ 12) | Doerentrup Quarz GmbH | -- |
| 脂多糖 | Beyotime | SI732 | |
| 铁死亡抑制干预 | Ferrostatin-1 | TargetMol | T6500 |
| 去铁胺 | Glpbio | GC13554 | |
| 铁死亡诱导 | Erastin | Glpbio | GC16630 |
| RSL3 | Glpbio | GC12431 | |
| P53乙酰化调控 | 烟酰胺 | Sigma Aldrich | 72340 |
| 曲古抑菌素A | Selleck | S1045 | |
| 免疫印迹 | 抗STAT6抗体 | Santa Cruz | sc-374021 |
| 抗p-STAT6抗体 | Santa Cruz | sc-136019 | |
| 抗PTGS-2抗体 | Santa Cruz | sc-52972 | |
| 抗P53抗体 | Santa Cruz | sc-126 | |
| 抗P21抗体 | Santa Cruz | sc-6246 | |
| 抗CBP抗体 | Santa Cruz | sc-32244 | |
| 抗HA抗体 | Santa Cruz | sc-7392 | |
| 抗Histone H3抗体 | Santa Cruz | sc-517576 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-47778 | |
| 抗SLC7A11抗体 | Beyotime | AF7992 | |
| 免疫组化 | 抗8-氧代-脱氧鸟苷抗体 | Trevigen | 3154-MC-050 |
| 免疫印迹 | 抗Flag抗体 | Cell Signaling Technology | 14793 |
| 抗乙酰化赖氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 9441S | |
| 免疫组化 | 抗4-羟基壬烯醛抗体 | Bioss | -- |
| 免疫印迹 | HRP标记二抗 | Immunoway | RS0001, RS0002 |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记抗鼠二抗 | Abcam | ab150113 |
| Alexa Fluor 594标记抗兔二抗 | Abcam | ab15008 | |
| DAPI | Solarbio | C0065 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | CWBIO | -- |
| cDNA合成 | HiFiScript cDNA合成试剂盒 | CWBIO | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green PCR预混液 | CWBIO | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Fdbio science | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Fdbio science | -- |
| 核质分离 | 核质蛋白提取试剂盒 | Fdbio science | -- |
| 蛋白免疫印迹 | 预染蛋白标记 | Vazyme Biotech | MP102-01 |
| PageRuler预染蛋白梯 | Thermo Scientific | 26617 | |
| 细胞转染 | PEI40000转染试剂 | Yeasen | 40816ES03 |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠 | -- | -- |
| 细胞活力测定 | MTT | Sigma-Aldrich | -- |
| GSH检测 | GSH检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Biotechnology | A006-2-1 |
| MDA检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131 |
| 铁含量检测 | 铁比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K139-M |
| LDH检测 | LDH检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Biotechnology | A020-2 |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG027 |
| TUNEL检测 | TUNEL检测试剂盒 | Vazyme Biotech | A111 |
| 仪器 | X射线发生器 | Precision X-Ray, Inc. | X-RAD320iX |
| 显微镜 | 光学显微镜 | Leica | DM 2500 |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | Leica | DM 2500 |
| 细胞活力测定 | 多功能酶标仪 | Molecular Devices | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ALI小鼠模型建立 | 小鼠品系、年龄、性别、麻醉方式、CS和LPS剂量及给药途径、Ferr-1和DFO的给药方式及时间、X射线剂量和剂量率 阅读提示:Methods中的Animal Experiments部分 |
| 细胞培养和分化 | 细胞系来源、培养条件、PMA浓度和分化时间、CS处理时间、LPS处理浓度和时间 阅读提示:Methods中的Chemicals, antibodies and cell culture部分 |
| 基因敲低和过表达 | 转染试剂(PEI40000)用量、质粒浓度、转染时间、shRNA和过表达质粒的序列 阅读提示:Methods中的Transfection of shRNA and cDNA部分 |
| 铁死亡指标检测 | GSH、MDA、铁含量检测试剂盒的使用方法、细胞或组织样本处理方式 阅读提示:Methods中的Detection of GSH, MDA and iron content部分 |
| 分子机制验证 | 免疫共沉淀使用的抗体、细胞裂解液、ChIP实验的固定条件、双荧光素酶报告实验的质粒组合 阅读提示:Methods中的Immunoblot analysis, nuclear and cytoplasmic protein extraction, and Immunoprecipitation、Dual-luciferase reporter assay、Chromatin immunoprecipitation (ChIP)部分 |