三维球体代谢流分析揭示结直肠癌和胰腺导管腺癌细胞系与匹配二维培养在葡萄糖代谢上的显著差异

Metabolic flux analysis of 3D spheroids reveals significant differences in glucose metabolism from matched 2D cultures of colorectal cancer and pancreatic ductal adenocarcinoma cell lines.

作者信息Tia R Tidwell, Gro V Røsland, Karl Johan Tronstad, Kjetil Søreide, Hanne R Hagland
PMID35578327
发布时间2022-05-16
DOI10.1186/s40170-022-00285-w

实验完整度

研究包含详细的体外细胞培养(2D与3D)、代谢流分析(Seahorse)、蛋白质表达检测(流式)以及代谢物浓度测定等多个独立实验层级,并进行了功能验证和机制探讨。

主要模型

结直肠癌细胞系HCT116和SW948 胰腺导管腺癌细胞系Panc-1和MIA-Pa-Ca-2 3D球体培养模型

重点核对

细胞系:HCT116、SW948、Panc-1、MIA-Pa-Ca-2 培养条件:DMEM培养基,5 mM葡萄糖,2 mM L-谷氨酰胺,10% FBS 球体形成:5000细胞/40μl,培养3天(CRC)或4天(PDAC) 代谢流分析:Seahorse XFe96和XFp,CCCP浓度每细胞系和培养方法不同(表S2) 蛋白质表达:流式细胞术检测MCT1、MCT4、GLUT1、UCP2、TOMM20

摘要

背景:大多数体外癌细胞实验使用二维模型进行。然而,三维球体培养因其更能代表体内肿瘤条件而日益受到青睐。为了克服二维细胞培养的转化挑战,三维系统更好地模拟了肿瘤中存在的更复杂的细胞间接触和营养水平,增进了我们对癌症复杂性的理解。尽管有这种需求,但关于三维培养在代谢上与二维培养有何不同的报道很少。方法:使用来自结直肠癌(HCT116和SW948)和胰腺导管腺癌(Panc-1和MIA-Pa-Ca-2)的已明确描述的细胞系来研究三维球体模型中的代谢。通过代谢流分析和关键代谢蛋白的表达,研究了在正常葡萄糖条件下二维和三维培养的代谢差异。结果:我们发现,与二维培养相比,三维培养的葡萄糖代谢存在显著差异,既涉及糖酵解也涉及氧化磷酸化。在标准营养条件下,球体具有更高的ATP相关呼吸,并且在缺乏补充葡萄糖的情况下具有更高的非有氧ATP产生。此外,ATP相关呼吸与OCR/ECAR显著负相关(p = 0.0096)。与二维相比,所有球体模型中线粒体转运蛋白TOMM20的表达降低,而单羧酸转运蛋白(MCT)的表达在4个球体模型中的3个中增加。结论:在这项对CRC和PDAC细胞系的研究中,我们证明三维球体中的葡萄糖代谢与二维培养显著不同,无论是在糖酵解还是氧化磷酸化指标方面。一个细胞系从二维到三维培养的代谢表型转变大于每个细胞系与肿瘤来源之间的表型差异。本文的结果强调了使用三维细胞模型研究营养利用和代谢流的必要性,以更好地理解肿瘤代谢和潜在的代谢治疗靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
三维球体培养与二维培养在葡萄糖代谢上有何差异?
核心机制
三维培养导致细胞向更具糖酵解的表型转变,ATP相关呼吸增加,但非有氧ATP产生在无葡萄糖条件下增加;TOMM20表达降低,MCT表达在部分细胞系中增加,提示代谢重编程适应球体微环境。
主要证据
通过对四种细胞系(HCT116、SW948、Panc-1、MIA-Pa-Ca-2)进行Seahorse代谢流分析(MST和GST),发现3D球体相比2D培养具有更高的ATP相关呼吸和更高的非有氧ATP产生(尤其在无葡萄糖条件下);流式细胞术显示TOMM20表达下降,MCT1和MCT4表达在3D中增加(HCT116、SW948、Panc-1)。
研究意义
研究表明代谢表型从2D到3D的转变大于细胞系之间的差异,强调在3D模型中研究肿瘤代谢和评估代谢药物的重要性,有助于提高向体内肿瘤环境转化的能力。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

细胞系选择和培养

在可控条件下建立2D和3D培养模型,用于比较代谢差异。

选择四种细胞系(HCT116、SW948、Panc-1、MIA-Pa-Ca-2),在含有5 mM葡萄糖的DMEM培养基中培养。3D球体通过悬滴法或U型底板形成,每球体5000细胞,培养3-4天。

2

生长和增殖测定

测量2D和3D培养下的细胞生长速率和球体大小。

2D倍增时间通过Hoechst染色和共聚焦显微镜直接计数。球体生长通过透射光图像分析横截面积。

3

代谢流分析

测量线粒体呼吸和糖酵解的实时代谢流,比较2D和3D培养的差异。

使用Seahorse XFe96和XFp进行线粒体压力测试(MST)和糖酵解压力测试(GST)。MST依次注射寡霉素、CCCP、鱼藤酮和抗霉素A;GST注射葡萄糖、寡霉素和2-脱氧-D-葡萄糖。

4

ATP产生计算

计算糖酵解和氧化磷酸化对ATP产生的贡献,量化代谢表型。

根据Seahorse数据,使用Mookerjee等人的方法,计算糖酵解指数(GI)、Crabtree指数(CI)和Pasteur指数(PI)。

5

代谢物测定

测定2D和3D培养中的葡萄糖、乳酸和谷氨酰胺消耗量。

收集培养液,使用GlucCell系统测葡萄糖,L-乳酸检测试剂盒测乳酸,谷氨酰胺/谷氨酸检测试剂盒测谷氨酰胺。

6

蛋白质表达分析

检测代谢相关蛋白的表达水平,以支持代谢流结果。

通过流式细胞术分析MCT1、MCT4、GLUT1、UCP2、TOMM20的表达。球体解离成单细胞后染色,使用Bio-Rad S3e或CytoFlex分析。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Corning--
胎牛血清BioWest--
L-谷氨酰胺Corning--
青霉素----
链霉素Merck Millipore Corporation--
CELLSTAR细胞排斥U型底板Greiner Bio-One--
Hoechst染料----
Leica SP8共聚焦显微镜Leica Microsystems--
Seahorse XFe96分析仪Agilent--
Seahorse XFp分析仪Agilent--
寡霉素Sigma-Aldrich--
鱼藤酮Sigma-Aldrich--
2-脱氧-D-葡萄糖Sigma-Aldrich--
BCA蛋白定量试剂盒PanReac AppliChem--
CellTak细胞粘附剂Corning--
GlucCell葡萄糖监测系统Cesco Bioengineering--
L-乳酸检测试剂盒Sigma-AldrichMAK329
谷氨酰胺/谷氨酸检测试剂盒Sigma-AldrichGLN1
Accutase酶Innovative Cell Technologies, Inc.--
小鼠抗MCT1抗体Santa Cruz BiotechnologySC-365501
小鼠抗MCT4抗体Santa Cruz BiotechnologySC-376140
兔抗GLUT1抗体AbcamEPR3915
兔抗UCP2抗体Bioss Antibodies Inc.--
羊驼抗兔IgG多克隆抗体,CF™ 488ABiotium--
抗小鼠IgG多克隆抗体,CF™ 488ABiotium--
Bio-Rad S3e流式细胞仪Bio-Rad Laboratories--
CytoFlex流式细胞仪Beckman Coulter--
Muse细胞分析仪Luminex--
Muse计数与活力检测试剂盒Luminex--
FCS Express软件De Novo Software--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
培养基组成(DMEM,5 mM葡萄糖,2 mM L-谷氨酰胺,10% FBS),细胞系来源
阅读提示:Methods: Cell culture
球体形成
细胞数量(5000细胞/40μl),培养时间(CRC 3天,PDAC 4天),底板类型(CELLSTAR U-bottom板)
阅读提示:Methods: Spheroid formation
代谢流分析
Seahorse仪器型号(XFe96或XFp),CCCP浓度(表S2),注射顺序和浓度(寡霉素3μM,CCCP细胞系依赖,鱼藤酮1μM,抗霉素A 1μM)
阅读提示:Methods: Metabolic flux assays
蛋白质表达分析
抗体信息(克隆号,稀释度未明确),解离方法(Accutase),固定和染色条件
阅读提示:Methods: Protein expression