化合物分析
鉴定SCTWD水提物中的主要化学成分。
采用UPLC-Q-TOF-MS对SCTWD水提物进行正负离子模式分析,鉴定出75种化合物。
Study on the Mechanism of Sancao Tiaowei Decoction in the Treatment of MNNG-Induced Precancerous Lesions of Gastric Carcinoma Through Hedgehog Signaling Pathway.
包含临床回顾性观察、大鼠体内模型、分子检测(RT-PCR、免疫组化)及组学分析(转录组测序)等多个独立证据层级,并进行了功能与机制验证。
SD大鼠MNNG诱导PLGC模型 PLGC患者临床样本(112例)
模型建立:28只大鼠饮用含MNNG(100 μg/ml)和0.03%雷尼替丁饲料,持续10周 药物干预:SCTWD灌胃剂量22.4 g/kg(8 ml/kg),持续16周 检测方法:HE染色、ELISA、RT-PCR、免疫组化 统计标准:FC≥2或≤0.5,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定SCTWD水提物中的主要化学成分。
采用UPLC-Q-TOF-MS对SCTWD水提物进行正负离子模式分析,鉴定出75种化合物。
建立MNNG诱导的PLGC大鼠模型,并分组进行药物干预。
36只SD大鼠,8只作为空白组,28只造模。模型组自由饮用含MNNG(100 μg/ml)的水和含0.03%雷尼替丁的饲料,持续10周。造模成功后,模型大鼠随机分为模型组和SCTWD治疗组,每组9只。治疗组每天灌胃SCTWD(22.4 g/kg),模型组给予生理盐水,持续16周。
评估SCTWD对PLGC大鼠胃黏膜组织病理变化的影响。
取胃组织,HE染色,光镜下观察胃黏膜结构、腺体排列、炎症细胞浸润等。
检测大鼠血清中PG I、PG II水平并计算PGR,评估胃黏膜萎缩状态。
采用ELISA法检测血清PG I、PG II水平,计算PGR值。
检测胃组织中Shh、Ptch、Gli-1的mRNA表达水平。
提取胃组织RNA,RT-PCR检测Shh、Ptch、Gli-1 mRNA表达。
检测胃黏膜中Hh信号通路相关蛋白的表达。
采用免疫组化法检测Shh、Ptch、Gli-1、Smo、Cyclin D1、CDKN2A/p16INK4a、NF-κBp65、IL-6、IL-8蛋白表达。
筛选SCTWD治疗前后的差异表达基因,并进行功能富集分析。
对大鼠胃组织进行转录组测序,筛选差异基因(FC≥2或≤0.5,P<0.05),进行GO和KEGG富集分析,构建蛋白质互作网络。
评估SCTWD对PLGC患者临床症状和病理变化的改善作用。
回顾性分析112例PLGC患者,在SCTWD治疗6个月后,比较治疗前后临床症状和病理组织学变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物制备 | 雷尼替丁 | 杭州奎腾生物科技有限公司 | -- |
| HE染色 | 二甲苯 | 上海伊恩化学科技有限公司 | -- |
| Harris苏木素染液 | 合肥白鲨生物科技有限公司 | BL702A | |
| 伊红染液(醇溶) | 合肥白鲨生物科技有限公司 | BL703A | |
| 中性树胶 | 合肥白鲨生物科技有限公司 | BL704A | |
| 免疫组化 | 山羊抗小鼠IgG-HRP | 合肥白鲨生物科技有限公司 | BL001A |
| 山羊抗兔IgG-HRP | 合肥白鲨生物科技有限公司 | BL003A | |
| 兔二步法检测试剂盒(增强酶标山羊抗兔IgG聚合物) | 北京中杉金桥生物技术有限公司 | PV-9001 | |
| 浓缩DAB试剂盒 | 北京中杉金桥生物技术有限公司 | ZLI-9017 | |
| 柠檬酸盐缓冲液 | 北京中杉金桥生物技术有限公司 | ZLI9065 | |
| PBS磷酸盐缓冲液 | 北京中杉金桥生物技术有限公司 | ZLI-9062 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | 上海碧云天生物技术有限公司 | P0013B |
| 4-20% SDS-PAGE预制胶 | 上海碧云天生物技术有限公司 | P0057A | |
| Western一抗二抗去除液 | 上海碧云天生物技术有限公司 | P0025-250ml | |
| 肌动蛋白抗体(小鼠单克隆抗体) | 上海碧云天生物技术有限公司 | AA128 | |
| Gli-1兔多克隆抗体 | 上海碧云天生物技术有限公司 | AF6990 | |
| Smo兔多克隆抗体 | 上海碧云天生物技术有限公司 | AF8010 | |
| PTCH1兔多克隆抗体 | 上海碧云天生物技术有限公司 | AF7836 | |
| NF-κB p65抗体 | 上海碧云天生物技术有限公司 | AN365 | |
| Cyclin D1兔多克隆抗体 | 上海碧云天生物技术有限公司 | AF0126 | |
| CDKN2A/p16INK4a兔多克隆抗体 | 上海碧云天生物技术有限公司 | AF6471 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG (Hendl) | 上海碧云天生物技术有限公司 | A0208 | |
| PageRuler预染蛋白Ladder | Thermo Fisher Scientific | 26617 | |
| 免疫组化 | 兔抗patched抗体 | 北京博森生物技术有限公司 | bs-1614R |
| Shh抗体 | Proteintech Group | 20697-1-AP | |
| ELISA | 大鼠血清TNF-α ELISA试剂盒 | 上海朗顿生物科技有限公司 | BEP30635 |
| 大鼠血清胃蛋白酶原I ELISA试剂盒 | 上海朗顿生物科技有限公司 | BEP30821 | |
| 大鼠血清胃蛋白酶原II ELISA试剂盒 | 上海朗顿生物科技有限公司 | BEP30896 | |
| 大鼠血清胃泌素ELISA试剂盒 | 上海朗顿生物科技有限公司 | BEP30675 | |
| 大鼠IL-6试剂盒 | Abcam | AB234570 | |
| 大鼠IL-8 ELISA试剂盒 | 上海索莱宝生物科技有限公司 | SEKR-0071 | |
| Western blot | IL-8抗体(内参) | Affinity Biosciences | DF6698 |
| IL-6抗体(内参) | Affinity Biosciences | DF6087 | |
| RT-PCR | RNA提取试剂盒 | TaKaRa Bio | AHF1991D |
| RT逆转录试剂盒 | TaKaRa Bio | RR036A | |
| SYBR Green荧光定量PCR染料 | TaKaRa Bio | AK9301 | |
| 化合物分析 | 超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱 | Waters | SYNAPT G2-Si |
| 动物实验 | 三草调胃汤 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 模型建立 | 造模大鼠自由饮用含MNNG (100 μg/ml)和0.03%雷尼替丁饲料,持续10周,需确认药物浓度和造模时间。 阅读提示:见Materials and Methods中的Grouping, Modeling, and Intervention |
| 药物干预 | SCTWD给药剂量为22.4 g/kg(8 ml/kg),灌胃每天一次,持续16周,需确认剂量和给药方式。 阅读提示:见Materials and Methods中的Grouping, Modeling, and Intervention |
| 病理学检查 | HE染色观察胃黏膜病理变化,需确认取材部位和固定液(4%多聚甲醛)。 阅读提示:见Materials and Methods中的Index Detection和Figure 3B |
| 血清学检测 | ELISA检测血清PG I、PG II,并计算PGR,需确认试剂盒货号和操作步骤。 阅读提示:见Materials and Methods中的Detection of Serum PG I and PG II |
| 分子表达检测 | RT-PCR检测Shh、Ptch、Gli-1 mRNA,免疫组化检测相关蛋白,需确认引物序列、抗体货号和修复条件。 阅读提示:见Materials and Methods中的RT-PCR和Immunohistochemical部分 |
| 转录组分析 | 转录组测序筛选差异基因(FC≥2或≤0.5,P<0.05),需确认测序平台和数据分析标准。 阅读提示:见Materials and Methods中的Analysis of Rat Gastric Tissue by Reference Transcriptome Sequencing |