患者样本MD3表达分析
明确溃疡性结肠炎和克罗恩病患者结肠中MD3表达及定位是否改变。
取8例UC、8例CD和8例健康对照的乙状结肠活检,通过蛋白质印迹检测MD3 v1和v2蛋白水平,免疫荧光染色检测定位。
MarvelD3 Is Upregulated in Ulcerative Colitis and Has Attenuating Effects during Colitis Indirectly Stabilizing the Intestinal Barrier.
包含临床患者样本分析、细胞系信号通路研究、转基因小鼠体内模型及电生理和分子验证,多个独立证据层级。
HT-29/B6人结肠上皮细胞系 肠道MD3过表达小鼠(Villin-Cre) 溃疡性结肠炎患者结肠活检
患者分组:8例UC、8例CD和8例健康对照(乙状结肠活检) 细胞实验:HT-29/B6细胞,IL-13浓度100 ng/mL处理48小时,STAT3/6抑制剂(SAHA、AG490、Inhibitor VI)预处理1小时 小鼠模型:12周龄雄性,3% DSS饮水5天,DAI评分 屏障功能:Ussing室阻抗谱和稀释电位测量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确溃疡性结肠炎和克罗恩病患者结肠中MD3表达及定位是否改变。
取8例UC、8例CD和8例健康对照的乙状结肠活检,通过蛋白质印迹检测MD3 v1和v2蛋白水平,免疫荧光染色检测定位。
鉴定调控MD3表达的细胞因子及其信号通路。
用多种IBD相关细胞因子(包括IL-13等)处理人结肠HT-29/B6细胞,并通过抑制剂(STAT3、STAT6、MAPK等)探索信号通路。
创建肠上皮特异性MD3过表达小鼠模型以研究MD3上调的体内功能。
将携带eGFP标记的鼠MD3编码序列的载体注射到Villin-Cre小鼠受精卵中,与Villin-Cre小鼠杂交,回交至C57Bl/6NCrl超过十代,通过基因分型确认Cre和GFP。
评估MD3过表达对实验性结肠炎严重程度和肠道屏障功能的影响。
对12周龄雄性MD3-OE和wt小鼠给予3% DSS饮水5天,评估DAI(体重下降、粪便性状、便血),结肠形态学(H&E染色),电生理屏障分析(阻抗谱、稀释电位、荧光素和FITC-葡聚糖通量),以及紧密连接蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 含GlutaMAX的RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Corning | -- | |
| PCF滤膜 | Merck Millipore | -- | |
| Western blot | 小鼠抗ACTB抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 |
| 兔抗CLDN1抗体 | Invitrogen | 519000 | |
| 兔抗CLDN2抗体(用于小鼠组织分析) | Invitrogen | 516100 | |
| 小鼠抗CLDN2抗体 | Invitrogen | 325600 | |
| 兔抗CLDN3抗体 | Invitrogen | 341700 | |
| 小鼠抗CLDN4抗体 | Invitrogen | 329400 | |
| 小鼠抗CLDN7抗体 | Invitrogen | 349100 | |
| 兔抗CLDN8抗体 | Invitrogen | 400700Z | |
| 兔抗CLDN15抗体 | Invitrogen | 364200 | |
| 兔抗ILDR1抗体 | Bioss | bs-11013R | |
| 兔抗LSR抗体 | Atlas antibodies | HPA007270 | |
| 免疫荧光和Western blot | 兔抗MD3抗体 | Proteintech | 25567-1-AP |
| Western blot | 兔抗MD3抗体(用于患者组织及部分小鼠组织分析) | Jerrold Turner的实验室 | -- |
| 兔抗OCCL抗体 | Invitrogen | 711500 | |
| 兔抗TRIC抗体 | Invitrogen | 700191 | |
| 小鼠抗TUBA抗体 | Sigma-Aldrich | T9026 | |
| 免疫荧光 | 小鼠抗ZO-1 647抗体 | Invitrogen | MA3-39100-A647 |
| DAPI | Roche Diagnositics | 10 236 276 001 | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)二抗Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11034 | |
| 山羊抗小鼠IgG(H+L)二抗Alexa Fluor 594 | Invitrogen | A11032 | |
| Western blot | 辣根过氧化物酶标记的羊抗兔二抗 | Jackson ImmunoResearch | 111-036-003 |
| 辣根过氧化物酶标记的羊抗小鼠二抗 | Jackson ImmunoResearch | 115-036-003 | |
| 细胞因子处理 | 肿瘤坏死因子α | PeproTech | -- |
| 干扰素γ | PeproTech | -- | |
| 白细胞介素-1α | PeproTech | -- | |
| 转化生长因子β1 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 转化生长因子β2 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 白细胞介素-4 | PeproTech | -- | |
| 白细胞介素-5 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 白细胞介素-6 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 白细胞介素-9 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 白细胞介素-13 | PeproTech | -- | |
| 白细胞介素-22 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 抑制剂实验 | U0126 | Cell Signaling Technology | -- |
| SAHA | Sigma-Aldrich | -- | |
| AG490 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 丹参酮IIa | Sigma-Aldrich | -- | |
| STAT3抑制剂VI | Calbiochem | -- | |
| JAK3抑制剂II | Calbiochem | -- | |
| JNK V抑制剂 | Calbiochem | -- | |
| SP600125 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 蛋白质提取 | 蛋白酶抑制剂(Complete) | Roche | -- |
| FastPrep-24匀浆机 | MP Biomedical | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | PerkinElmer | -- |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | ThermoFisher | -- | |
| Fusion FX7成像系统 | Vilber Lourmat | -- | |
| AIDA图像分析软件 | Elysia | -- | |
| 免疫荧光 | Dako封闭液 | Dako North America Inc. | S3022 |
| 动物实验 | 葡聚糖硫酸钠 | TdB | -- |
| 电生理测量 | 尤斯室 | -- | -- |
| 402频率响应分析仪 | Beran Instruments | -- | |
| 1286电化学接口 | Solartron Schlumberger | -- | |
| 通透性测量 | FITC标记的葡聚糖(4-kDa, 10-kDa) | TdB | -- |
| 荧光素 | -- | -- | |
| 辣根过氧化物酶(VI型) | Sigma-Aldrich | -- | |
| QuantaBlu荧光底物 | Pierce | -- | |
| Tecan Infinite M200酶标仪 | Tecan | -- | |
| 免疫荧光 | 激光扫描共聚焦显微镜 | -- | -- |
| 动物模型构建 | Villin-Cre小鼠 | -- | -- |
| C57Bl/6NCrl小鼠 | Charles River Laboratory | -- | |
| 增强绿色荧光蛋白 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本分析 | 患者分组:UC、CD、对照各8例;检测组织:乙状结肠活检;蛋白分析:膜蛋白组分;内参:β-actin。 阅读提示:见2.1节及图2 |
| 细胞培养与处理 | HT-29/B6细胞培养条件(37°C,5% CO2,10% FBS,青霉素/链霉素);细胞因子浓度:IL-13 100 ng/mL等;处理时间:48小时(TNFα 24小时);抑制剂预处理1小时。 阅读提示:见2.2节和2.3节 |
| 信号通路研究 | 抑制剂浓度:SAHA 5 µM,AG490 50 µM,STAT3-Inhibitor VI 10 µM等;检测MD3表达变化。 阅读提示:见2.3节及图3 |
| 动物模型 | 小鼠品系:MD3-OE(Villin-Cre)及wt对照;性别和年龄:12周龄雄性;DSS浓度:3%;给药方式:饮水;持续时间:5天;对照组:普通饮水。 阅读提示:见2.6和2.7节 |
| 屏障功能测量 | Ussing chamber面积:0.049 cm2;阻抗谱频率范围:1.3 Hz-65 kHz;通量标记物:荧光素(332 Da)、FD4(4 kDa)、FD10(10 kDa)、HRP;检测时间点:0-120分钟。 阅读提示:见2.8和2.9节 |
| 统计方法 | 数据表示:均值±SEM;统计检验:Student's t-test(两组比较)或单因素方差分析(多组比较);显著性水平:p<0.05。 阅读提示:见2.10节 |