观察IELs在肠道上皮的分布和迁移模式
确定猪小肠IELs是否仅存在于基底膜或侧细胞间隙,还是也能迁移至自由表面。
通过HE染色、CD3免疫组化、扫描电镜和免疫荧光观察不同日龄猪小肠中IELs的分布,并统计不同肠段的IELs数量。
Porcine intraepithelial lymphocytes undergo migration and produce an antiviral response following intestinal virus infection.
包含体内猪模型(口服感染和结扎肠环)、体外共培养系统(IELs/IPEC-J2/Marc-145)、功能验证(迁移、增殖、细胞毒性、IFN-γ中和)及机制研究(CCL2、STAT1、ISG)。
猪小肠上皮内淋巴细胞(IELs) IPEC-J2细胞系 Marc-145细胞系 30日龄仔猪口服感染模型和结扎肠环模型
PEDV感染剂量:MOI=0.1,口服接种1 mL 10^7 PFU/mL IELs与上皮细胞共培养时间:24小时 CCL2重组蛋白浓度:50 ng/mL IFN-γ中和抗体浓度:25 μg/mL 动物模型中PEDV接种时间:1小时和3小时(结扎肠环),48小时(口服感染)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定猪小肠IELs是否仅存在于基底膜或侧细胞间隙,还是也能迁移至自由表面。
通过HE染色、CD3免疫组化、扫描电镜和免疫荧光观察不同日龄猪小肠中IELs的分布,并统计不同肠段的IELs数量。
探究PEDV感染是否促进IELs进入侧细胞间隙和自由表面。
对30日龄仔猪进行口服PEDV感染,48小时后通过IHC观察IELs分布;建立结扎肠环模型,注射PEDV、PBS或枯草芽孢杆菌,通过IHC和PCNA染色分析IELs迁移和增殖。
在体外模拟肠道环境,验证PEDV感染是否直接诱导IELs跨上皮迁移。
建立IELs/IPEC-J2共培养系统,将Transwell置于PEDV感染的Marc-145细胞上,通过共聚焦显微镜和流式细胞术检测迁移的IELs,并用TEM观察细胞形态。
确定PEDV感染时哪些趋化因子促进IELs迁移。
分析转录组数据筛选候选趋化因子;通过ELISA检测CCL2和CCL5分泌;在共培养系统中添加重组CCL2/CCL5或CCL2受体抑制剂TC1,观察IELs迁移变化。
探究IELs是否需要病毒预激活才能抑制PEDV感染。
用全灭活PEDV或S蛋白刺激IELs,然后与感染细胞共培养(接触或非接触),检测病毒滴度、RNA和蛋白表达。
验证口服灭活病毒能否在体内预激活IELs并增强其抗病毒活性。
给仔猪口服全灭活PEDV或PBS,4小时后分离IELs和MLN T细胞,与PEDV感染的细胞共培养,检测病毒抑制效果。
确定抗病毒是否依赖于穿孔素/颗粒酶介导的细胞毒性。
检测共培养系统中上皮细胞凋亡和LDH释放,测量穿孔素和颗粒酶B水平;用抑制剂CMA和DCI处理IELs后检测抗病毒活性。
确定激活的IELs是否通过分泌IFN-γ诱导抗病毒反应。
检测共培养上清中IFN-α/β/γ水平,分析STAT1磷酸化和ISGs转录;加入IFN-γ中和抗体,观察抗病毒效果是否被逆转。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 改良Eagle培养基(DMEM) | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Life Technologies | -- | |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 热灭活胎牛血清 | Gibco | A38401 | |
| Percoll分离液 | -- | -- | |
| 白细胞介素2 | -- | -- | |
| 台盼蓝 | -- | -- | |
| Hank's平衡盐溶液 | -- | -- | |
| 二硫苏糖醇 | Invitrogen | 15508 | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 谷氨酰胺 | -- | -- | |
| HEPES | -- | -- | |
| 非必需氨基酸 | Invitrogen | -- | |
| 细胞计数器(JIMBIO CL) | -- | -- | |
| Transwell插入小室(0.4 μm孔径,6.5 mm直径) | Corning | -- | |
| Hoechst 33342 | Life Technologies | H3570 | |
| Zombie NIR可固定活力检测试剂盒 | BioLegend | -- | |
| 流式分析 | 抗猪PerCP-Cy5.5-CD3ε抗体 | BD Biosciences | 561478 |
| 抗猪PE-TCR γδ抗体 | BD Biosciences | 561486 | |
| 抗猪PE-Cy7-CD4抗体 | BD Biosciences | 561473 | |
| 抗猪FITC-CD8α抗体 | BD Biosciences | 551303 | |
| 免疫组化 | 抗猪CD3抗体 | Abcam | ab16669 |
| 免疫荧光 | 抗猪CCL2单克隆抗体 | Bioss Antibodies | bs-1955R |
| 免疫荧光/免疫组化 | 抗PEDV N蛋白单克隆抗体 | Medgene labs | SD17-103 |
| 免疫荧光 | 抗小鼠紧密连接蛋白ZO-1抗体 | Invitrogen | Z01-1A12 |
| Western blot | 抗GAPDH单克隆抗体 | Solarbio | K200057M |
| 山羊抗小鼠IgG H&L(HRP) | Abcam | ab205719 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗小鼠IgG H&L(Alexa Fluor 488) | Abcam | ab150113 |
| 山羊抗兔IgG H&L(Alexa Fluor 488) | Abcam | ab150077 | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L(Alexa Fluor 594) | Abcam | ab150116 | |
| 细胞因子检测 | 重组猪CCL2 | GenScript | -- |
| 重组猪CCL5 | R&D | -- | |
| 受体抑制 | CCR2拮抗剂4(TC1) | MedChemExpress | -- |
| 细胞毒性抑制 | 刀豆霉素A | Sigma-Aldrich | HY-N1724 |
| 3,4-二氯异香豆素 | TargetMol | T8677 | |
| 抗病毒检测 | 抗猪IFN-γ抗体(R4-6A2) | R&D | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| HiScript Q RT SuperMix qPCR逆转录预混液 | Vazyme | -- | |
| SYBR Green qPCR试剂盒 | Takara | -- | |
| 免疫组化 | SABC-POD试剂盒 | -- | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| 细胞迁移 | CFSE | -- | -- |
| 显微成像 | 共聚焦激光显微镜(LSM-710;蔡司) | Zeiss | -- |
| 切片机(Leica RM2235) | Leica | RM2235 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒扩增和灭活 | PEDV ZJ株的纯化方法、灭活温度和时间(56°C 0.5小时) 阅读提示:Methods: Viruses and infection |
| 细胞培养 | Marc-145、Vero E6、IPEC-J2的培养条件(DMEM, 10% FBS, 37°C, 5% CO2) 阅读提示:Methods: Cells, antibodies, and reagents |
| 动物口服感染 | 猪日龄(1月龄)、PEDV剂量(1 mL 10^7 PFU/ml)、PBS对照、48小时感染时间 阅读提示:Methods: Animal experiments |
| 结扎肠环模型 | 手术步骤、PEDV剂量(10^6 PFU/段)、PBS和B. subtilis对照、处理时间(1或3小时) 阅读提示:Methods: Animal experiments, Figure 2 legend |
| IELs分离和培养 | 分离步骤(HBSS、DTT、EDTA、Percoll梯度)、培养条件(IL-2 10 U/mL, 10% FBS, 10% CO2)、细胞密度(500,000 cells/mL) 阅读提示:Methods: Generation of porcine small intestinal IELs |
| IELs激活 | 体外:全灭活PEDV(MOI=0.1)或S蛋白(50 ng),离心1200×g 15分钟,37°C 1小时;体内:口服1 mL 10^7 PFU/mL WI PEDV,4小时 阅读提示:Methods: IELs activation and blocking |
| 共培养系统 | Transwell的规格(0.4 μm孔径)、IPEC-J2种植密度(2×10^5 cells/cm^2)、TEER达到500 Ω×cm^2、共培养时间 阅读提示:Methods: Establishment of the IELs/IPEC-J2, IELs/IPEC-J2/Mac 145, and IELs/Mac 145 co-culture system |
| 迁移检测 | CFSE标记、CLSM成像、z-orthogonal视图、细胞计数 阅读提示:Methods: Immunofluorescence and confocal microscopy; Figure 3 legend |
| 抗病毒实验 | 共培养时间(24小时)、病毒滴度检测(噬斑实验)、RNA和蛋白检测 阅读提示:Methods: Plaque assay and western blot analysis; Figure 5 legend |
| IFN-γ中和 | 抗IFN-γ抗体浓度(5、10、25 μg/mL)、处理时间 阅读提示:Methods: IELs activation and blocking; Figure 8 legend |
| 统计分析 | 统计方法(One-way ANOVA, t-test)、重复次数(至少3次)、P值阈值(*P<0.05, **P<0.01) 阅读提示:Methods: Statistics and reproducibility |