建立细胞PD模型
通过NGF-β诱导PC12细胞分化并经6-OHDA处理,模拟PD的神经毒性环境。
PC12细胞用NGF-β(50 ng/mL)处理7天诱导分化,随后暴露于不同浓度(100-900 μM)6-OHDA 24小时。通过显微镜观察、TH表达检测(RT-PCR和免疫细胞化学)验证分化;通过MTS和流式细胞术验证细胞增殖和凋亡。
Nrf2 Inhibits the Progression of Parkinson's Disease by Upregulating AABR07032261.5 to Repress Pyroptosis.
包含细胞模型、大鼠模型及患者样本的多个独立实验层级,且通过过表达/敲低验证了功能与机制,并进行了转录组测序分析。
PC12细胞系(经NGF-β诱导分化为神经样细胞) 6-OHDA诱导的大鼠帕金森病模型
PC12细胞分化条件:NGF-β(50 ng/mL)处理7天 6-OHDA处理浓度:100-900 μM,处理24小时 大鼠模型:雄性Wistar大鼠,200-220 g,10-12周龄,6-OHDA(2.5 μg/μL,4.8 μL)单侧注射至黑质 Nrf2过表达:细胞转染LV003-Nrf2质粒;大鼠注射AAV9-Nrf2(1.25e14 vg/mL) AABR07032261.5敲低:siRNA转染
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过NGF-β诱导PC12细胞分化并经6-OHDA处理,模拟PD的神经毒性环境。
PC12细胞用NGF-β(50 ng/mL)处理7天诱导分化,随后暴露于不同浓度(100-900 μM)6-OHDA 24小时。通过显微镜观察、TH表达检测(RT-PCR和免疫细胞化学)验证分化;通过MTS和流式细胞术验证细胞增殖和凋亡。
通过单侧黑质注射6-OHDA,模拟PD的神经退行性病变。
雄性Wistar大鼠(200-220 g,10-12周龄)在麻醉下,于左侧黑质注射6-OHDA(2.5 μg/μL,4.8 μL)建立模型。通过牵引试验、Morris水迷宫、旷场试验评估神经行为;通过H&E、尼氏染色、TUNEL染色评估组织学变化。
在细胞和大鼠PD模型中过表达Nrf2,验证其对焦亡的影响。
细胞:将大鼠Nrf2编码序列克隆至LV003质粒,通过Lipofectamine 3000转染PC12细胞。大鼠:将AAV9-Nrf2(1.25e14 vg/mL)注射至左侧黑质,3周后建立PD模型。通过Western blot和免疫荧光验证过表达效果。
评估Nrf2过表达对PD模型中细胞焦亡、氧化应激和神经行为的影响。
通过Western blot检测焦亡标志物(NLRP1、NLRP3、caspase-1 p10)、α-syn和磷酸化Nrf2水平;ELISA检测IL-1β、IL-18和LDH释放;流式细胞术检测ROS和凋亡;MTS检测增殖;行为学测试评估运动功能。
鉴定Nrf2过表达引起的lncRNA和mRNA差异表达,并探讨相关信号通路。
提取总RNA,去除rRNA后构建cDNA文库,使用Illumina HiSeq 2000测序。差异表达定义:log2比值(Nrf2/NC)≥0.6,P≤0.05。通过KEGG富集分析、构建lncRNA-miRNA-mRNA相互作用网络。
验证AABR07032261.5在PD模型中是否调控焦亡。
用siRNA转染PC12细胞敲低AABR07032261.5表达,检测焦亡标志物(NLRP1/3、caspase-1 p10)、IL-1β/18、LDH、细胞增殖和凋亡,并分析下游miRNA和mRNA表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | 未明确 | -- |
| 马血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 神经生长因子-β | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| LV003质粒 | ForeverGen | -- | |
| siRNA | GenePharma | -- | |
| 动物实验 | 腺相关病毒9型-Nrf2 | WZ Biosciences | -- |
| 腺相关病毒9型-hSyn | WZ Biosciences | -- | |
| 细胞增殖检测 | MTS检测试剂盒 | Abcam | ab197010 |
| 流式细胞术 | Annexin V-APC/7-AAD细胞凋亡试剂盒 | Multi Sciences Biotech | AT105 |
| 活性氧检测试剂盒 | Yeason Biotech | 50101ES01 | |
| 细胞毒性检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime Biotech | C0017 |
| 组织学染色 | 尼氏染色液 | Solarbio Life Science | G1430 |
| 凋亡检测 | 一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime Biotech | C1086 |
| 免疫荧光 | 抗Nrf2抗体 | Abcam | ab137550 |
| ELISA | IL-18 ELISA试剂盒 | Cusabio Technology | CSB-E04610r |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Cusabio Technology | CSB-E08055r | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| RNA-seq | 人/小鼠/大鼠rRNA去除试剂盒 | Illumina | -- |
| TruSeq RNA LT试剂盒 | Illumina | -- | |
| RT-qPCR | miScript II反转录试剂盒 | QIAGEN | 218160 |
| QuantiTect SYBR Green PCR试剂盒 | QIAGEN | 204143 | |
| Western blot | 抗TH抗体 | Proteintech | 25859-1-AP |
| 抗NRF2抗体 | Abcam | ab137550 | |
| 抗磷酸化NRF2抗体 | BIOSS | #bs2013R | |
| 抗α-突触核蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4179 | |
| 抗caspase-1 p10抗体 | Proteintech | 22915-1-AP | |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | ab214185 | |
| 抗NLRP1抗体 | Cell Signaling Technology | 4990 | |
| 细胞裂解液 | Beyotime Biotech | P0013 | |
| BeyoECL Plus化学发光底物 | Beyotime Biotech | P0018S | |
| 免疫细胞化学 | 辣根过氧化物酶标记山羊抗兔IgG(H+L) | Jackson Immunoresearch | 111-035-003 |
| 细胞培养 | PC12细胞系 | Cellcook | CC9120 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞PD模型建立 | PC12细胞分化条件(NGF-β浓度和处理时间)、6-OHDA浓度和处理时间、细胞密度 阅读提示:Materials and Methods中的“Cellular PD Model” |
| 细胞转染 | 转染试剂、质粒或siRNA序列、转染后检测时间 阅读提示:Materials and Methods中的“Cell Transfection” |
| 大鼠PD模型建立 | 大鼠品系、性别、年龄、体重、6-OHDA剂量、注射体积、注射坐标、注射速度、术后时间 阅读提示:Materials and Methods中的“Rat PD Model” |
| Nrf2过表达 | 细胞:质粒载体和转染条件;大鼠:AAV9-Nrf2滴度、注射体积、注射时间点 阅读提示:Materials and Methods中的“Nrf2 Overexpression in Rat Model” |
| 焦亡检测 | Western blot抗体、ELISA试剂盒、LDH检测试剂盒、流式细胞术试剂、样本处理细节 阅读提示:Materials and Methods中的“Western Blot”、“ELISA”、“LDH Release”、“Flow Cytometry” |
| 神经行为学评估 | 牵引试验具体方法、Morris水迷宫参数(训练天数、测试天数)、旷场试验参数 阅读提示:Materials and Methods中的“Neurobehavioral Functions” |
| 转录组测序 | RNA提取、文库构建试剂盒、测序平台、差异表达阈值(log2比值、P值)、富集分析软件 阅读提示:Materials and Methods中的“RNA Sequencing and Bioinformatics” |
| RT-qPCR | 引物序列、反转录试剂盒、PCR试剂盒、内参基因(GAPDH/U6) 阅读提示:Materials and Methods中的“Quantitative RT-PCR”及表1 |