SLC34A2上调和SLC4A4下调与甲状腺乳头状癌的侵袭、转移及MAPK信号通路相关

SLC34A2 Up-regulation And SLC4A4 Down-regulation Correlates With Invasion, Metastasis, And The MAPK Signaling Pathway In Papillary Thyroid Carcinomas.

作者信息Fengyan Huang, Haitao Wang, Juan Xiao, Chunchun Shao, Yong Zhou, Wei Cong, Maosong Gong, Jingfu Sun, Liqun Shan, Zhanyu Hao, Lihua Wang, Shouluan Ding, Zhigang Yu, Jianing Liu, Hongying Jia
PMID34405007
期刊J Cancer
发布时间2021-07-13
DOI10.7150/jca.56730

实验完整度

基于临床样本进行多种分子实验(RT-PCR、Western blot、IHC)验证表达,并利用公共数据库进行生物信息学分析,但缺乏功能获得/丧失实验及动物模型验证。

主要模型

甲状腺乳头状癌患者肿瘤组织 相邻正常甲状腺组织 GEO和TCGA数据库队列

重点核对

样本来源:48例PTC患者肿瘤及相邻正常甲状腺组织 蛋白表达判定:Western blotting,以肿瘤/正常比值>1.0为高表达,<1.0为低表达 尿碘浓度分组:<100 μg/L(碘缺乏),100-299 μg/L(碘适宜),≥300 μg/L(碘过量) MAPK蛋白检测:p-ERK、p-JNK、p-P38等抗体及稀释度

摘要

甲状腺乳头状癌(PTC)是过去十年中检测到的最快速增长的内分泌系统恶性肿瘤之一。不幸的是,超过25%的PTC患者具有侵袭性和随后的转移特征;这些特征通常提示预后不良。最近,越来越多的证据表明溶质载体(SLC)转运蛋白可能在人类癌症的发生、侵袭和转移中发挥关键作用。然而,SLC转运蛋白在PTC患者中的表达及临床病理学意义仍未确定。在本研究中,我们旨在阐明SLC转运蛋白的差异表达如何影响临床病理学特征,并确定可能涉及的调控信号通路。通过生物信息学方法,从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中筛选出三个差异表达的SLC转运蛋白。结果表明,高SLC34A2和低SLC4A4蛋白表达的患者表现出更高比例的包膜侵犯和甲状腺外转移。Logistic回归分析显示,肿瘤中高SLC34A2表达被确定为包膜侵犯[比值比(OR)=11.400,95%置信区间(CI)=1.733-74.995,P=0.011]和甲状腺外转移(OR=4.920,95%CI=1.234-19.623,P=0.024)的独立危险因素,而肿瘤中低SLC4A4表达仅被确定为甲状腺外转移的独立危险因素(OR=8.568,95%CI=1.186-61.906,P=0.033)。具体而言,对于有包膜侵犯和甲状腺外转移的肿瘤,SLC34A2蛋白表达染色在滤泡上皮细胞的细胞质中显著增强,相反,SLC4A4表达在细胞膜和细胞核中显著减弱。有趣的是,高SLC34A2和低SLC4A4蛋白表达均与PTC患者的高尿碘浓度显著相关。在机制上,与相邻的正常甲状腺相比,p-ERK在侵袭性肿瘤中显著上调17.8%;对于转移性肿瘤,p-ERK、p-JNK和p-P38分别显著上调29.2%、67.1%和38.9%。重要的是,SLC4A4与p-JNK(r=-0.696,P=0.004)和p-P38(r=-0.534,P=0.049)呈负相关。总之,我们提出上调的SLC34A2(主要在细胞质中)和下调的SLC4A4(主要在细胞膜和细胞核中)可能与PTC的甲状腺外转移密切相关,这或许可归因于过量碘摄入。此外,SLC4A4的这种作用可能通过激活JNK/P38 MAPK信号通路实现。未来需要体内和体外的功能获得或丧失实验来验证这些发现,并进一步阐明更深入的分子机制。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
SLC转运蛋白在甲状腺乳头状癌中的差异表达及其临床病理学意义,以及可能涉及的调控信号通路是什么?
核心机制
低SLC4A4表达可能通过激活JNK/P38 MAPK信号通路促进甲状腺外转移;高SLC34A2可能不通过MAPK通路,而通过其他通路(如AKT、NF-κB等)促进包膜侵犯和甲状腺外转移。
主要证据
Western blotting显示SLC4A4与p-JNK(r=-0.696)和p-P38(r=-0.534)显著负相关;p-ERK在侵袭和转移肿瘤中上调,p-JNK和p-P38在转移肿瘤中上调。
研究意义
研究结果为SLC转运蛋白在PTC侵袭和转移中的作用提供了新视角,有助于深入探索分子机制、识别临床生物标志物和发现新的治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

生物信息学筛选差异表达SLC转运蛋白

利用公共数据库筛选与PTC相关的差异表达SLC转运蛋白。

通过GEO四个数据集(GSE3678, GSE29265, GSE50901, GSE33630)筛选差异表达基因,与TCGA数据结合进行表达和生存分析,最终选择SLC34A2、SLC4A4和SLC25A15进行后续验证。

2

验证候选基因表达

验证生物信息学筛选结果在临床样本中的准确性。

使用RT-PCR和Western blotting检测8对配对样本中SLC34A2、SLC4A4和SLC25A15的mRNA和蛋白表达。

3

临床病理特征关联分析

评估SLC34A2和SLC4A4蛋白表达与PTC患者临床病理特征的关系。

对48例PTC患者的肿瘤组织进行Western blotting检测,并分析蛋白表达与包膜侵犯、甲状腺外转移、淋巴结转移、尿碘浓度等特征的相关性。

4

蛋白定位分析

确定SLC34A2和SLC4A4蛋白在PTC组织中的亚细胞定位。

使用免疫组织化学染色观察SLC34A2和SLC4A4在有包膜侵犯和甲状腺外转移的PTC组织中的表达定位。

5

MAPK通路激活分析

评估MAPK信号通路(ERK、JNK、P38)的磷酸化状态与PTC侵袭和转移的关系。

通过Western blotting检测p-ERK、p-JNK、p-P38在侵袭性和转移性肿瘤中的表达,并与相邻正常组织比较。

6

相关性分析

分析SLC34A2和SLC4A4表达与MAPK通路磷酸化蛋白的相关性。

使用Spearman相关分析计算SLC34A2、SLC4A4与p-ERK、p-JNK、p-P38之间的相关性。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RNA提取试剂盒ServicebioG3013
反转录合成试剂盒ServicebioG3330
LightCycler 480 系统Roche Diagnostics--
SLC34A2一抗CSTD6W2G
SLC4A4一抗Abcamab187511
SLC25A5一抗Abcamab228604
ERK一抗Biossbsm-33337M
p-ERK一抗Biossbs-1522R
JNK一抗ElabscienceE-AB-60070
p-JNK一抗BosterBM4380
P38一抗ElabscienceE-AB-32459
p-P38一抗ElabscienceE-AB-21027
β-actin一抗Zhongshan Golden Bridge17AV0412
辣根过氧化物酶标记二抗Zhongshan Golden BridgeZB-2301
化学发光试剂MilliporeWBKLSO100
AlphaView SA软件----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
样本收集与伦理
样本来源:山东大学第二医院甲状腺外科,2019年7月至12月,48例PTC患者;纳入标准包括初治、未接受术前治疗、无肝肾功能障碍等
阅读提示:Materials and Methods, Study population selected
RT-PCR
使用RNA试剂盒提取总RNA,反转录试剂盒合成cDNA,RT-PCR在LightCycler 480系统进行,引物序列已提供,GAPDH为内参,2^-ΔΔCt法计算相对表达
阅读提示:Materials and Methods, Tissue RNA isolation and real-time PCR
Western blotting
蛋白提取使用含磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液,BCA法测定浓度,SDS-PAGE电泳,PVDF膜转膜,5%脱脂牛奶封闭,一抗稀释度如SLC34A2(1:1000)等
阅读提示:Materials and Methods, Tissue protein extraction and western blotting
免疫组化
组织固定于4%多聚甲醛,石蜡包埋,脱蜡水化,3%过氧化氢阻断内源性过氧化物酶,一抗稀释度1:10000,DAB显色,苏木素复染
阅读提示:Materials and Methods, Immunohistochemical staining
尿碘浓度评估
UIC检测方法参考文献,按WHO标准分组:<100 μg/L(缺乏),100-299 μg/L(适宜),≥300 μg/L(过量)
阅读提示:Materials and Methods, Iodine nutrition status evaluation