动物模型与样本采集
获取成年牦牛端脑不同区域组织,用于后续表达分析。
从甘肃省甘南藏族自治州合作市兴发牦牛藏羊繁育中心购买3头3岁健康成年牦牛,体重550-720kg,在海拔3000m环境下饲养。通过颈静脉注射巴比妥类药物处死,取出全脑,分离小脑皮质、海马、杏仁核、嗅叶、基底节、丘脑、下丘脑、小脑、额叶、胼胝体等组织。
Expression and distribution of neuroglobin and hypoxia-inducible factor-1α in the adult yak telencephalon.
包含IHC、qRT-PCR和Western blot三种方法检测Ngb和Hif-1α表达,但仅使用3只动物,且主要进行表达分析,缺少功能验证或机制验证。
成年牦牛端脑组织 小脑皮质、海马、杏仁核、小脑、胼胝体等脑区
动物数量:3头3岁成年牦牛 组织分区:小脑皮质、海马、杏仁核、嗅叶、基底节、丘脑、下丘脑、小脑、额叶、胼胝体 qRT-PCR内参基因:β-actin Western blot抗体浓度:Ngb 1:800,Hif-1α 1:500,β-actin 1:3000
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取成年牦牛端脑不同区域组织,用于后续表达分析。
从甘肃省甘南藏族自治州合作市兴发牦牛藏羊繁育中心购买3头3岁健康成年牦牛,体重550-720kg,在海拔3000m环境下饲养。通过颈静脉注射巴比妥类药物处死,取出全脑,分离小脑皮质、海马、杏仁核、嗅叶、基底节、丘脑、下丘脑、小脑、额叶、胼胝体等组织。
检测Ngb和Hif-1α在各脑区组织中的mRNA表达水平。
使用TRIzol试剂提取总RNA,经反转录合成cDNA,采用SYBR Green Pro Taq HS试剂盒在Quant Studio 5仪器上进行qRT-PCR,以β-actin作为内参,使用2−ΔΔCt方法计算相对表达量。
检测Ngb和Hif-1α在各脑区组织中的蛋白表达水平。
取冷冻组织称重,加入含PMSF的RIPA裂解液在冰上匀浆,离心收集上清,进行SDS-PAGE电泳,转膜后与一抗(Ngb、Hif-1α、β-actin)孵育,再与HRP标记的二抗孵育,ECL显色,用Image J软件分析信号。
确定Ngb和Hif-1α在端脑各区域的细胞定位。
组织样本用4%多聚甲醛固定,石蜡包埋,切片(厚度4μm),进行HE染色和免疫组织化学染色。使用HRP-DAB底物显色,苏木素复染,阴性对照用PBS替代一抗。
评估Ngb和Hif-1α表达差异的显著性。
使用SPSS 22.0进行单因素方差分析(ANOVA),并用Duncan多重比较检验,p<0.05表示显著。数据以均值±标准差表示。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| qRT-PCR | AG RNAex Pro RNA提取试剂盒 | Accurate Biotechnology (Hunan) Co. Ltd. | -- |
| SYBR Green Pro Taq HS试剂盒 | Accurate Biotechnology (Hunan) Co. Ltd. | -- | |
| Evo M-MLV反转录试剂盒 | Accurate Biotechnology (Hunan) Co. Ltd. | -- | |
| TRIzol试剂 | Accurate Biotechnology | -- | |
| Quant Studio 5 | -- | -- | |
| Western blot | 兔抗Ngb多克隆抗体 | Bioss Co. Ltd. | bs-1859R |
| 兔抗HIF-1α多克隆抗体 | Bioss Co. Ltd. | bs-0737R | |
| 兔抗β-肌动蛋白多克隆抗体 | Bioss Co. Ltd. | bs-0737R | |
| 山羊抗兔IgG/HRP | Bioss Co. Ltd. | bs-0295G-HRP | |
| RIPA组织或细胞快速裂解液 | Bio topped | -- | |
| PVDF膜(0.22μm) | Solarbio Co. Ltd. | -- | |
| 4×蛋白上样缓冲液(DTT) | Solarbio Co. Ltd. | -- | |
| Rainbow 245广谱蛋白marker | Solarbio Co. Ltd. | 11-245KD | |
| ECL超敏发光液 | Solarbio Co. Ltd. | -- | |
| ECL蛋白质印迹仪(GE AI600) | GE | AI600 | |
| 免疫组织化学 | 免疫组织化学染色试剂盒 | Beijing Zhongshan Golden Bridge Biotechnology Co. Ltd. | -- |
| HRP-DAB试剂盒 | Beijing Zhongshan Golden Bridge Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| Western blot分析 | Image J软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物与样本采集 | 动物数量(3头)、年龄(3岁)、体重(550-720kg)、海拔(3000m)、组织区域(包括小脑皮质、海马、杏仁核、嗅叶、基底节、丘脑、下丘脑、小脑、额叶、胼胝体) 阅读提示:参见Methods 2.1 Animals and setting |
| qRT-PCR | 引物序列及退火温度(Ngb: 60.0°C, Hif-1α: 59.8°C, β-actin: 60.2°C)、反应体系(SYBR Green Pro Taq、Rox等)、扩增程序(50°C 2min, 95°C 2min, 40循环) 阅读提示:参见Methods 2.1.3 Total RNA isolation and qRT-PCR 和 Table 1 |
| Western blot | 抗体浓度(Ngb 1:800, Hif-1α 1:500, β-actin 1:3000)、二抗浓度(1:4000)、转膜条件(110V, 60min)、封闭条件(5% milk/PBST, 4°C过夜) 阅读提示:参见Methods 2.1.4 Western-blotting |
| 免疫组织化学 | 一抗孵育条件(37°C, 2h)、二抗孵育条件(37°C, 15min)、抗原修复(0.125%胰蛋白酶30min)、封闭(正常羊血清,室温15min) 阅读提示:参见Methods 2.1.5 Immunohistochemical staining |