PLOD2 是宫颈癌中有效的预后标志物并与免疫浸润相关

PLOD2 Is a Potent Prognostic Marker and Associates with Immune Infiltration in Cervical Cancer.

作者信息Guang Li, Xuefeng Wang, Guobing Liu
PMID34258263
发布时间2021-06-28
DOI10.1155/2021/5512340

实验完整度

中

包含数据库分析、免疫组化和Western blot验证,但主要依赖生物信息学,缺乏体内外功能实验。

主要模型

宫颈癌细胞系(HeLa) 正常宫颈细胞系(HUCEC) 宫颈癌组织样本(15例CESC和19例正常宫颈组织)

重点核对

PLOD2在CESC中的表达水平(mRNA和蛋白) PLOD2表达与患者预后的关系(OS、DFS或RFS) PLOD2相关功能通路富集(如胶原纤维组织) PLOD2与免疫细胞浸润的相关性

摘要

背景:PLOD2 在多种肿瘤中过表达,并在肿瘤发生中发挥重要作用。然而,PLOD2 在宫颈癌(CESC)中的预后价值仍不清楚。方法:从 Oncomine、GEPIA、UALCAN 和 Kaplan-Meier Plotter 数据库中收集 PLOD2 表达和 CESC 患者的生存数据;使用免疫组织化学(IHC)验证 PLOD2 在 CESC 中的表达;使用 STRING 和 DAVID 数据库进行基因集富集分析;使用 TIMER 和 TISIDB 数据库研究 PLOD2 与癌症免疫浸润的相关性。结果:我们发现 PLOD2 的表达水平在多种癌症中升高,Oncomine 数据库中的荟萃分析显示,与正常组织相比,PLOD2 在 CESC 中显著上调(P < 0.001)。此外,PLOD2 的高表达与 CESC 患者的总生存期(OS)和无病生存期(DFS)较差密切相关(OS HR = 1.73,P = 0.029;DFS HR = 2.60,P = 0.018)。功能注释表明,差异表达的 PLOD2 主要与蛋白质消化吸收途径和胶原纤维组织过程相关。免疫浸润分析显示,PLOD2 与 CESC 中的 B 细胞、CD4+ T 细胞、2 型辅助性 T 细胞(Th2)和嗜酸性粒细胞高度相关。结论:PLOD2 与不良预后呈正相关,可能被认为是 CESC 患者的新型诊断和预后标志物。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
PLOD2在宫颈癌中的表达水平、预后价值及与免疫浸润的关系如何?
核心机制
PLOD2可能通过影响细胞外基质(如胶原纤维组织)和蛋白质消化吸收途径,促进肿瘤进展,并与免疫浸润相关。
主要证据
基于多种数据库分析及免疫组化、Western blot验证,发现PLOD2在CESC中高表达,且高表达与较差OS和DFS相关,并与免疫细胞浸润相关。
研究意义
PLOD2可能作为CESC的诊断和预后标志物,为改善患者生存和预后准确性提供潜在靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

数据库表达分析

评估PLOD2在CESC与正常组织中的表达差异。

使用Oncomine和GEPIA数据库分析PLOD2的mRNA表达水平,并进行荟萃分析验证。

2

蛋白表达验证

验证PLOD2蛋白在宫颈癌组织和细胞系中的表达。

通过免疫组化(IHC)检测19例正常宫颈组织和15例CESC组织中的PLOD2表达,并通过Western blot检测HeLa和HUCEC细胞中的表达。

3

预后分析

评估PLOD2表达与CESC患者预后的相关性。

使用Kaplan-Meier Plotter和GEPIA数据库进行生存分析,包括OS、RFS和DFS。

4

功能富集分析

探索PLOD2及相互作用基因的生物学功能和信号通路。

使用STRING构建蛋白质相互作用网络,使用DAVID进行GO和KEGG富集分析。

5

免疫浸润分析

分析PLOD2表达与肿瘤免疫浸润的相关性。

使用TIMER和TISIDB数据库分析PLOD2与多种免疫细胞(B细胞、CD4+ T细胞、Th2细胞等)浸润的相关性。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
兔抗PLOD2抗体BIOSSbs-12731R
RIPA裂解缓冲液----
Pierce™ BCA蛋白测定试剂盒Thermo Fisher Scientific--
聚偏二氟乙烯膜Sigma-Aldrich--
抗体Solarbio--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
免疫组化实验
组织样本来源、抗体稀释度、染色评分标准
阅读提示:Methods 2.3 IHC Staining and Evaluation
Western blot实验
细胞系、蛋白提取方法、抗体信息
阅读提示:Methods 2.7 Western Blot
预后分析
数据库版本、截断值、统计方法
阅读提示:Methods 2.2 GEPIA Database Analysis, 2.4 Kaplan-Meier Plotter Database, Results 3.4
功能富集分析
基因列表来源、软件参数
阅读提示:Methods 2.5 Bioinformatic Analysis and Functional Enrichment
免疫浸润分析
数据库版本、免疫细胞类型定义
阅读提示:Methods 2.6 Immune Infiltration Analysis