建立2D单层和3D球形培养模型
比较不同培养条件下A549细胞的生物学特性。
A549细胞在6 cm平皿(2D)和96孔圆底板(3D)中培养4天,形成单层或球形。
Elevation of Chemosensitivity of Lung Adenocarcinoma A549 Spheroid Cells by Claudin-2 Knockdown through Activation of Glucose Transport and Inhibition of Nrf2 Signal.
包含2D/3D培养模型、siRNA敲低、基因表达分析、荧光探针检测、Transwell通透性实验及功能验证(化疗敏感性),多层次验证机制。
CLDN2 siRNA敲低效率及特异性 球形培养模型的形成及直径(1860.0 ± 12.9 μm) 葡萄糖缺乏、fasentin(10 μM)和萝卜硫素(10 μM)的处理浓度和时间 DXR处理的浓度梯度和时间(24小时) Transwell实验中2-NBDG的通量和TER测定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较不同培养条件下A549细胞的生物学特性。
A549细胞在6 cm平皿(2D)和96孔圆底板(3D)中培养4天,形成单层或球形。
评估3D培养对葡萄糖代谢相关基因表达的影响。
通过实时PCR和Western blot检测GLUT1、GLUT3、HK1、PFK1、LDH-A、G6PD等表达。
确认CLDN2敲低对球形细胞中紧密连接结构的影响。
通过siRNA转染敲低CLDN2,免疫荧光和电镜观察CLDN2定位及紧密连接结构。
探究CLDN2敲低是否影响葡萄糖转运、代谢酶和Nrf2通路。
实时PCR和Western blot检测葡萄糖转运蛋白、代谢酶及Nrf2靶基因表达。
模拟葡萄糖缺乏条件,检测其对葡萄糖转运蛋白和Nrf2表达的影响。
用低葡萄糖培养基或fasentin处理2D细胞,检测代谢酶和Nrf2表达,并测量葡萄糖和乳酸含量。
探究葡萄糖缺乏对线粒体功能的影响。
使用JC-1和MitoROS 580检测线粒体膜电位和ROS产生,测量GSH/GSSG比值。
验证CLDN2是否作为葡萄糖的屏障,影响细胞对葡萄糖的吸收。
Transwell实验检测2-NBDG通量和TER,并测量球形细胞中葡萄糖、2-NBDG和乳酸含量。
验证CLDN2敲低通过Nrf2信号影响DXR敏感性。
用DXR处理球形细胞,检测细胞活力,并观察fasentin和萝卜硫素的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| 96孔平底板 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 96孔圆底板 | Sumilon, Sumitomo | -- | |
| 细胞活力测定 | Premix WST-1细胞增殖检测系统 | Takara-Bio | -- |
| CellTiter-Glo 3D细胞活力检测试剂盒 | Promega | -- | |
| 药物处理 | 阿霉素 | Fujifilm Wako Pure Chemical | -- |
| RNA提取 | TRI试剂 | Molecular Research Center | -- |
| 逆转录 | ReverTra Ace试剂盒 | Toyobo | -- |
| RT-qPCR | THUNDERBIRD qPCR混合物 | Toyobo | -- |
| Western blot | C-DiGit印迹扫描仪 | LI-COR Biotechnology | -- |
| 转染 | ScreenFect A | Fujifilm Wako Pure Chemical | -- |
| RNA提取 | NucleoSpin RNA | Takara-Bio | -- |
| 微阵列 | Clariom S人源检测 | Filgen | -- |
| 免疫细胞化学 | CytoVista 3D细胞培养透明/染色试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Block Ace封闭液 | Dainippon Sumitomo Pharma | -- | |
| Alexa Fluor 555偶联二抗 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| LSM 700共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 电子显微镜 | 超薄切片机 | Leica | -- |
| 铅染液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 透射电子显微镜(JEM-1400Plus) | JEOL | -- | |
| CCD相机(EM-14830RUBY2) | JEOL | -- | |
| 代谢物测量 | 葡萄糖检测试剂盒-WST | Dojindo Laboratories | -- |
| 乳酸检测试剂盒-WST | Dojindo Laboratories | -- | |
| 线粒体检测 | MitoROS 580 | AAT Bioquest | -- |
| JC-1碘化物 | Takara-Bio | -- | |
| 荧光检测 | BZ-X810 | Keyence | -- |
| 屏障功能测量 | 带聚酯膜插入物的Transwell板 | Corning Incorporated | -- |
| 电压表 | -- | -- | |
| 荧光检测 | Infinite F200 PRO酶标仪 | Tecan | -- |
| 统计分析 | KaleidaGraph 4.5.1软件 | Synergy Software | -- |
| Western blot | 抗GLUT1抗体 | Abeomics | 10-7548 |
| 抗GLUT3抗体 | ProteinTech | 20403-1-AP | |
| 抗HK1抗体 | Rockland Immunochemicals | 200-4159S | |
| 抗PFK1抗体 | Rockland Immunochemicals | 200-1156S | |
| 抗PK1抗体 | Rockland Immunochemicals | 200-1178S | |
| 抗LDH-A抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-137243 | |
| 抗G6PD抗体 | ProteinTech | 25413-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-1615 | |
| 抗HIF-1α抗体 | Bioss Antibodies | bs-0737R | |
| 抗Nrf2抗体 | GeneTex | GTX102572 | |
| 抗CLDN2抗体 | Thermo Fisher Scientific | 51-6100 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | A549细胞来源(RIKEN BRC);2D和3D培养条件(培养基、培养时间4天);3D球形周长约1860 μm 阅读提示:Materials and Methods, 4.1 Cell Culture |
| 基因敲低 | siRNA序列(未提供);转染试剂ScreenFect A;转染时间96小时 阅读提示:Materials and Methods, 4.4 Microarray Analysis(转染步骤) |
| 药物处理 | fasentin浓度(10 μM,或25 μM用于线粒体检测);萝卜硫素浓度(10 μM);DXR浓度梯度及处理时间(24小时) 阅读提示:Results sections 2.4-2.7; Materials and Methods, 4.1和4.8 |
| 葡萄糖和代谢物测量 | 细胞内葡萄糖、乳酸和GSH/GSSG测量方法(试剂盒品牌) 阅读提示:Materials and Methods, 4.7 Intracellular Glutathione, Glucose and Lactate Contents |
| 屏障功能测量 | Transwell板规格(0.4 μm孔径,12 mm直径);2-NBDG浓度(100 μM);TER测量;通透性实验孵育时间(30或60分钟) 阅读提示:Materials and Methods, 4.9 Measurement of Barrier Function of TJs |
| 统计分析 | 重复次数(至少三次);统计方法(ANOVA、Tukey检验、Student's t-test);显著性阈值p < 0.05 阅读提示:Materials and Methods, 4.10 Statistical Analysis |