检测miR-135a、BMI1和KLF4在OS组织和细胞中的表达
评估miR-135a及其潜在靶标在骨肉瘤中的表达水平及其相关性。
采用RT-qPCR检测OS细胞系(Saos-2、MG-63)和原代成骨细胞中miR-135a、BMI1和KLF4的表达;采用免疫组化检测人OS组织和正常骨组织中BMI1、KLF4和Ki67的表达。
miR-135a Reduces Osteosarcoma Pulmonary Metastasis by Targeting Both BMI1 and KLF4.
研究包含体外细胞实验(RT-qPCR、Transwell、EdU、免疫荧光、Western blot、双荧光素酶报告)和体内动物实验(异种移植模型、FMT成像、HE染色、IHC),并进行了功能验证和机制验证,证据层级独立。
骨肉瘤细胞系 Saos-2 和 MG-63 异种移植裸鼠模型 人骨肉瘤组织样本和正常骨组织
miR-135a在OS组织和细胞中的表达水平(RT-qPCR验证) BMI1和KLF4是否为miR-135a的直接靶标(双荧光素酶报告基因实验) miR-135a过表达对OS细胞侵袭和增殖的影响(Transwell和EdU实验) miR-135a在体内对肿瘤生长和肺转移的抑制作用(异种移植模型)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估miR-135a及其潜在靶标在骨肉瘤中的表达水平及其相关性。
采用RT-qPCR检测OS细胞系(Saos-2、MG-63)和原代成骨细胞中miR-135a、BMI1和KLF4的表达;采用免疫组化检测人OS组织和正常骨组织中BMI1、KLF4和Ki67的表达。
验证miR-135a过表达或敲低BMI1/KLF4是否影响OS细胞的增殖和侵袭能力。
对Saos-2细胞分别进行LV-miR-135a转导、siRNA转染(si-BMI1、si-KLF4、si-B+K)或PTC-209处理,然后进行EdU增殖实验和Transwell侵袭实验。
在动物模型中验证miR-135a的肿瘤抑制作用及其对肺转移的影响。
将Saos-2细胞皮下接种于裸鼠,成瘤后随机分组,分别给予miR-135 mimic、si-B+K、NC、PTC-209或DMSO治疗,监测肿瘤生长,并通过FMT成像检测MMP活性,通过HE染色评估肺转移结节数量。
确认miR-135a是否直接结合BMI1和KLF4的3'UTR并抑制其表达。
利用双荧光素酶报告基因实验,将miR-135a mimic或miR-NC与含有BMI1或KLF4野生型或突变型3'UTR的质粒共转染Saos-2细胞,检测荧光素酶活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| α-MEM培养基 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 药物处理 | PTC-209 | MedChemExpress | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| miRNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 实时荧光定量PCR | IQ5多色实时PCR检测系统 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| Transwell侵袭实验 | 基质胶(基质膜基质) | Corning | -- |
| EdU实验 | Cell-Light™ EdU Apollo®488体外成像试剂盒 | Life Technologies | -- |
| 免疫荧光 | DAPI染液 | Cell Signalling Technology | -- |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| MMPSense 680探针 | PerkinElmer | -- | |
| 免疫组化/组织学 | Pannoramic MIDI数字切片扫描仪 | 3DHISTECH | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 磷酸酶和蛋白酶抑制剂 | Keygen | -- | |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Bioss | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| GLOMAX 20/20发光检测仪 | Promega | -- | |
| 抗体 | KLF4抗体 (#BS90773) | BioWorld | BS90773 |
| BMI1抗体 (#10832-1-AP) | Proteintech | 10832-1-AP | |
| MMP2抗体 (#bs-0412R) | Bioss | bs-0412R | |
| MMP9抗体 (#bs-4593R) | Bioss | bs-4593R | |
| Ki67抗体 (#ab15580) | Abcam | ab15580 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、培养条件 阅读提示:Materials and Methods: Cell Lines and Culture |
| 细胞转染 | siRNA浓度、转染试剂、转染时间 阅读提示:Materials and Methods: Cell Transfection, Transduction, and Compounds |
| 体外功能实验 | Transwell实验中的基质胶浓度、细胞密度、孵育时间;EdU实验中的孵育时间 阅读提示:Materials and Methods: Transwell Invasion Assay, 5-Ethynyl-20-Deoxyuridine (EdU) Assay |
| 体内实验 | 动物品系、性别、周龄、细胞接种数量、分组、给药途径、给药剂量、给药频率、治疗周期 阅读提示:Materials and Methods: In Vivo Growth and Bioimaging Analysis |
| 双荧光素酶报告基因 | 细胞数量、质粒浓度、转染试剂、检测时间 阅读提示:Materials and Methods: Dual-Luciferase Reporter |