非营养性甜味剂可通过接合基因转移促进抗生素耐药性的传播

Nonnutritive sweeteners can promote the dissemination of antibiotic resistance through conjugative gene transfer

作者信息Zhigang Yu, Yue Wang, Ji Lu, Philip L Bond, Jianhua Guo
PMID33589766
期刊ISME J
发布时间2021-07
DOI10.1038/s41396-021-00909-x

实验完整度

构建了三个接合转移模型(种内、种间、临床相关),结合微流控单细胞实时成像、ROS检测、膜通透性测定、转录组分析及功能验证(ROS清除剂实验),多层级证据支持机制结论。

主要模型

大肠杆菌 K-12 LE392(含RP4质粒)与大肠杆菌 K-12 MG1655(种内接合) 大肠杆菌 K-12 LE392(含RP4质粒)与假单胞菌 P. alloputida(种间接合) 大肠杆菌 K-12 MG1655(含pMS6198A质粒)与大肠杆菌 J53(临床相关接合) 假单胞菌 P. alloputida(含gfp-RP4质粒)与野生型 P. alloputida(单细胞实时成像)

重点核对

甜味剂暴露浓度(0.003-300 mg/L)及处理时间(8小时) 接合培养基(PBS或LB)及温度(25°C或37°C) ROS清除剂(硫脲)的添加及浓度 细胞膜通透性检测中PI染色浓度(20 µM)及处理时间(2小时) 供体菌预暴露对膜通透性和接合频率的影响(3 mg/L SUC预暴露2小时)

摘要

抗菌素耐药性(AMR)对全球人类健康和生物安全构成威胁。通过接合质粒转移传播抗生素耐药基因(ARGs)是耐药性进化的主要因素。尽管糖精、三氯蔗糖、阿斯巴甜和安赛蜜等常用非营养性甜味剂被允许作为安全的食品添加剂,但最近有研究表明它们与抗生素引起的肠道菌群变化类似。由于抗生素可促进抗生素耐药基因(ARGs)的传播,我们假设这些非营养性甜味剂也可能具有类似作用。在此,我们首次证明糖精、三氯蔗糖、阿斯巴甜和安赛蜜可在三个已建立的接合模型(相同和不同种系菌株之间)中促进质粒介导的接合转移。在单细胞水平上可视化了实时动态接合过程。暴露于测试化合物的细菌表现出活性氧(ROS)产生增加、SOS反应和基因转移增强。此外,在暴露于测试化合物下,两种亲本细菌的细胞膜通透性均增加。在甜味剂处理下,参与ROS解毒、SOS反应和细胞膜通透性的基因表达显著上调。总之,暴露于非营养性甜味剂会增强细菌的接合。我们的发现为AMR的传播提供了见解,并表明非营养性甜味剂的存在具有潜在风险。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
非营养性甜味剂(糖精、三氯蔗糖、阿斯巴甜、安赛蜜)能否促进细菌质粒介导的抗生素耐药基因接合转移,其机制是什么?
核心机制
非营养性甜味剂(除糖精在部分模型中)诱导活性氧(ROS)产生增加和SOS反应,并增加细胞膜通透性(尤其是供体菌),同时上调RP4质粒上接合相关基因(如traG、traC1、traC2、pil基因)的表达,从而促进质粒接合转移。
主要证据
通过三个接合模型(种内、种间、临床相关)证实甜味剂促进接合频率;微流控单细胞成像显示转移速率增加;ROS检测显示ROS产生增加,加入ROS清除剂硫脲后接合频率降低;膜通透性检测显示供体菌膜通透性增加且与接合频率相关;转录组分析显示相关基因上调。
研究意义
非营养性甜味剂在环境相关和临床相关浓度下均可促进ARGs的水平转移,提示其在环境和人体内可能加剧抗生素耐药性的传播,需评估其潜在生态和健康风险。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立接合转移模型

验证非营养性甜味剂是否能在不同环境条件下促进质粒接合转移。

建立了三个接合模型:模型I(种内和种间接合,供体E. coli LE392含RP4质粒,受体分别为E. coli MG1655和P. alloputida,PBS中25°C 8小时);模型II(临床相关接合,供体E. coli MG1655含pMS6198A,受体E. coli J53,LB中37°C 2小时);模型III(微流控单细胞实时成像,供体P. alloputida含gfp-RP4质粒,受体P. alloputida野生型)。

2

单细胞水平实时可视化接合过程

在单细胞水平上观察甜味剂是否加速质粒接合转移进程。

使用荧光标记(gfp-RP4质粒)和微流控系统(B04A微流控板,ONIX, CellASIC, Merck),通过共聚焦显微镜延时成像监测接合过程,并对转接合子数量进行定量分析。

3

测量ROS产生和SOS反应

探究甜味剂是否通过诱导氧化应激和SOS反应促进接合。

使用DCFDA试剂盒检测ROS水平,通过流式细胞仪分析。检测亲本菌株在甜味剂处理下的ROS变化,并加入ROS清除剂硫脲验证ROS的作用。同时通过RNA-seq分析ROS解毒和SOS相关基因的表达。

4

测定细胞膜通透性

探究甜味剂是否通过增加细胞膜通透性促进接合。

使用PI染色检测供体和受体菌的细胞膜通透性。通过预暴露实验(供体或受体单独暴露于3 mg/L SUC 2小时)区分供体和受体膜通透性对接合的影响。同时分析膜相关基因表达。

5

转录组分析接合相关基因表达

揭示甜味剂对RP4质粒接合相关基因和全局调控基因表达的影响。

对供体E. coli LE392和受体P. alloputida在甜味剂处理下进行RNA-seq,分析RP4质粒上编码接合转移蛋白、DNA转移复制(Dtr)和配对形成(Mpf)系统的基因表达变化,同时分析细菌染色体上相关基因。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证接合转移频率
验证细胞膜通透性
验证单细胞动态过程

产品清单

实验环节名称品牌货号
LB肉汤培养基----
糖精Sigma-Aldrich--
三氯蔗糖Sigma-Aldrich--
阿斯巴甜Sigma-Aldrich--
安赛蜜Sigma-Aldrich--
DCFDA细胞ROS检测试剂盒Abcam--
CytoFLEX S流式细胞仪Beckman Coulter--
碘化丙啶染料Life Technologies--
GeneJET质粒小提试剂盒Life Technologies--
铂金绿色热启动PCR预混液Invitrogen--
铂金GC增强剂Invitrogen--
PowerWater® DNA提取试剂盒MoBio--
RNeasy小提试剂盒QIAGEN--
HiSeq 2500测序仪Illumina--
B04A微流控板(ONIX, CellASIC)Merck--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
接合实验
供体菌株、受体菌株、质粒(RP4或pMS6198A)、接合培养基(PBS或LB)、温度(25°C或37°C)、时间(8小时或2小时)、甜味剂浓度(0.003-300 mg/L)、供体/受体比例(1:1)、细胞密度(108 CFU/mL)、选择性平板抗生素浓度(种内:Amp/Kan/Chl/Tet;种间:Amp/Kan/Chl/Tet;临床:Amp/sodium azide)
阅读提示:Methods: 'Mobile plasmid-mediated conjugative transfer models'; Results: 'Nonnutritive sweeteners promote conjugative transfer'
ROS检测
菌液浓度(约106 CFU/mL)、DCFDA浓度(20 µM)、孵育时间(30分钟)和温度(37°C)、甜味剂处理时间(2小时)和温度(室温)、阳性对照(3% H2O2)和阴性对照(Milli-Q水)、流式细胞仪激发和发射波长(488/525 nm)
阅读提示:Methods: 'Measurement of reactive oxygen species (ROS)'
细胞膜通透性检测
菌液浓度(约106 CFU/mL)、甜味剂处理时间(2小时)和温度(25°C)、PI浓度(终浓度20 µM)、孵育时间(15分钟)和温度(25°C)、受损细胞对照(80°C加热2小时)、流式细胞仪激发和发射波长(488/561 nm)
阅读提示:Methods: 'Measurement of cell membrane permeability'
转录组分析
甜味剂浓度(3 mg/L)、处理时间(2小时)、生物学重复(三重复)、RNA提取方法(RNeasy Mini Kit)、测序平台(Illumina HiSeq 2500)、差异表达基因筛选标准(FDR-adjusted p < 0.05)
阅读提示:Methods: 'RNA extraction, genome-wide RNA sequencing, and transcriptomic analysis'
单细胞实时成像
供体(P. alloputida含gfp-RP4质粒)、受体(野生型P. alloputida)、OD600(0.7-0.8)、微流控板(B04A)、压力(5 psi 1分钟加载,1 psi甜味剂导入)、IPTG浓度(100 µM)、温度(25°C)、成像时间(2-3小时)
阅读提示:Methods: 'Mobile plasmid-mediated conjugative transfer models'(模型III); Results: 'Real-time visualization of conjugative plasmid transfer'
MIC测定
菌液浓度(约105 CFU/mL)、接体积(75 µL LB+75 µL菌液)、抗生素浓度梯度、孵育时间(20小时)和温度(30°C)、重复数(3次)、MIC90定义
阅读提示:Methods: 'Determination of MICs against antibiotics'