细胞毒性评估
确定Nano-Ni和Nano-TiO2对HaCaT细胞的毒性剂量,选择非毒性浓度进行后续实验。
使用MTS和SRB实验检测不同浓度(0-50 μg/mL)纳米颗粒处理24小时后的细胞活力。
Effects of metal nanoparticles on tight junction-associated proteins via HIF-1α/miR-29b/MMPs pathway in human epidermal keratinocytes.
包含细胞实验(HaCaT)、剂量/时间反应、抑制剂和miRNA模拟物功能验证、蛋白和mRNA检测等。
人表皮角质形成细胞HaCaT
Nano-Ni浓度:10和20 μg/mL Nano-Ni处理时间:12、24、48、72小时 HIF-1α抑制剂CAY10585浓度:30 μM,预处理2小时 miR-29b-3p模拟物转染浓度:30 nM,转染24小时 Nano-TiO2作为对照
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Nano-Ni和Nano-TiO2对HaCaT细胞的毒性剂量,选择非毒性浓度进行后续实验。
使用MTS和SRB实验检测不同浓度(0-50 μg/mL)纳米颗粒处理24小时后的细胞活力。
观察Nano-Ni对MMP-2和MMP-9 mRNA表达和酶活性的剂量和时间依赖性影响。
通过RT-qPCR检测MMP-2/9 mRNA水平,明胶酶谱法检测活性。
检测Nano-Ni对MMP抑制剂TIMP-1和TIMP-2 mRNA表达的影响。
RT-qPCR检测TIMP-1和TIMP-2 mRNA。
评估Nano-Ni对紧密连接蛋白ZO-1、occludin、claudin-1表达的影响。
通过Western blot检测蛋白水平,免疫荧光染色检测ZO-1定位和表达。
确定Nano-Ni是否诱导HIF-1α核积聚。
Western blot检测核提取物中的HIF-1α。
分析Nano-Ni对miR-29b表达的影响。
RT-qPCR检测miR-29b水平。
验证HIF-1α是否介导Nano-Ni诱导的miR-29b下调和MMP-2/9上调。
使用HIF-1α抑制剂CAY10585预处理细胞,然后检测miR-29b、MMP-2/9活性及HIF-1α核积聚。
验证miR-29b是否调节Nano-Ni诱导的MMP-2/9表达和紧密连接蛋白下调。
将miR-29b-3p mimic转染入HaCaT细胞,然后暴露于Nano-Ni,检测MMP-2/9表达和活性及紧密连接蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Mediatech | -- |
| 胎牛血清 | Mediatech | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 细胞毒性检测 | MTS试剂盒 | Promega | -- |
| SRB试剂盒 | Sigma | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| M-MLV逆转录酶 | Promega | -- | |
| 寡聚胸腺嘧啶引物 | Sigma | -- | |
| RT-qPCR | iTaq通用SYBR Green超混液 | Bio-Rad | -- |
| TaqMan microRNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| TaqMan通用预混液II | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解缓冲液 | Santa Cruz | -- |
| NE-PER核和胞浆提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | -- |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Scientific | -- | |
| CL-Xposure胶片 | Thermo Scientific | -- | |
| 免疫荧光 | LAB-TEK II腔室玻片 | Nalge Nunc International | -- |
| Alexa Fluor 488偶联山羊抗兔IgG | Invitrogen | -- | |
| 含DAPI的Prolong Gold抗淬灭封片剂 | Invitrogen | -- | |
| 纳米颗粒 | 镍纳米颗粒 | Inabata & Co., Ltd. | -- |
| 二氧化钛纳米颗粒 | Inabata & Co., Ltd. | -- | |
| Western blot | HIF-1α抗体 | BD | 610959 |
| ZO-1抗体 | Bioss Antibodies | bs-1329R | |
| occludin抗体 | Novus Biologicals | NBP1-77037 | |
| claudin-1抗体 | Cell Signaling Technology | 13255 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 58169 | |
| 明胶酶谱法 | 明胶 | Acros Organics | -- |
| HIF-1α抑制 | CAY10585 | BioVision | -- |
| miRNA转染 | mirVana miRNA模拟物 (has-miR-29b-3p) | Thermo Fisher Scientific | MC10103 |
| 阴性对照#1 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 纳米颗粒表征 | 磷酸盐缓冲液 | -- | -- |
| 细胞培养板 | 6孔板 | Corning | -- |
| 96孔板 | -- | -- | |
| 细胞毒性检测 | Synergy HT多功能酶标仪 | BioTek | -- |
| RNA提取 | 分光光度计 | Beckman Coulter | -- |
| RT-qPCR | Bio-Rad iQ5多色实时PCR检测系统 | Bio-Rad | -- |
| 免疫荧光 | 荧光显微镜 | Nikon | -- |
| 数据分析 | SigmaPlot 13.0 | Systat Software | -- |
| ImageJ | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系(HaCaT)、培养基(DMEM+10% FBS)、培养条件(37°C,5% CO2)、处理浓度(0、10、20 μg/mL Nano-Ni或Nano-TiO2)、处理时间(12、24、48、72小时) 阅读提示:Methods - Cell culture and treatment |
| 细胞毒性检测 | 细胞活力检测方法(MTS和SRB)、处理时间(24小时)、浓度范围(0-50 μg/mL) 阅读提示:Methods - Cytotoxicity assays, Figure legend 1 |
| MMP-2/9和TIMP-1/2表达检测 | RT-qPCR引物序列、PCR循环条件、内参基因(β-actin) 阅读提示:Methods - RNA extraction and quantitative real-time PCR, Results |
| MMP-2/9活性检测 | 明胶酶谱法条件(凝胶浓度、明胶浓度、孵育液成分) 阅读提示:Methods - Gelatin zymography assay |
| 紧密连接蛋白检测 | 抗体信息(ZO-1、occludin、claudin-1) 阅读提示:Methods - Western blot, Results |
| HIF-1α核积聚检测 | 核蛋白提取方法(NE-PER试剂) 阅读提示:Methods - Protein extraction and Western blot |
| miR-29b表达检测 | RT-qPCR方法(TaqMan) 阅读提示:Methods - RNA extraction and quantitative real-time PCR |
| HIF-1α抑制实验 | CAY10585浓度(30 μM)和预处理时间(2小时) 阅读提示:Methods - Cell culture and treatment, Results |
| miR-29b过表达实验 | miR-29b-3p mimic浓度(30 nM)和转染时间(24小时) 阅读提示:Methods - Cell culture and treatment, Results |