构建体内和体外模型
建立肾缺血再灌注损伤模型和细胞氧糖剥夺/复氧模型,用于研究Tisp40在TEC焦亡中的作用。
对C57BL/6和Tisp40敲除小鼠进行双侧肾蒂夹闭30分钟,再灌注不同时间;TCMK-1细胞用无糖培养基缺氧处理24小时,复氧不同时间。
Tisp40 Induces Tubular Epithelial Cell GSDMD-Mediated Pyroptosis in Renal Ischemia-Reperfusion Injury via NF-κB Signaling.
包含体外细胞实验(OGD/R刺激TCMK-1细胞)和体内动物实验(Tisp40敲除小鼠),并进行了功能验证(过表达/敲低/敲除)和机制验证(NF-κB通路抑制剂)。
C57BL/6小鼠肾缺血再灌注损伤模型 Tisp40敲除小鼠肾缺血再灌注损伤模型 TCMK-1细胞氧糖剥夺/复氧模型
缺血时间30分钟,再灌注时间0-48小时 OGD 24小时,复氧时间0-8小时 Tisp40敲低使用siRNA-Tisp40(100 nM)处理12小时 Tisp40过表达细胞系TCMK-1/Tisp40 NF-κB抑制剂PTL处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立肾缺血再灌注损伤模型和细胞氧糖剥夺/复氧模型,用于研究Tisp40在TEC焦亡中的作用。
对C57BL/6和Tisp40敲除小鼠进行双侧肾蒂夹闭30分钟,再灌注不同时间;TCMK-1细胞用无糖培养基缺氧处理24小时,复氧不同时间。
评估模型建立情况和TEC焦亡程度。
通过HE染色、TUNEL染色、CCK-8、LDH释放测定、western blot检测GSDMD-N表达。
明确Tisp40表达与GSDMD介导的焦亡之间的关系。
通过western blot、RT-qPCR检测不同时间点Tisp40和GSDMD-N表达,并用Pearson相关分析评估两者的相关性。
验证Tisp40过表达或敲低对TEC焦亡的影响。
使用TCMK-1/Tisp40过表达细胞系和siRNA-Tisp40敲低,在OGD/R刺激下检测LDH释放、IL-1β/IL-18水平(ELISA)、NLRP3和caspase-1表达(RT-qPCR/western blot)、以及细胞焦亡(流式细胞术)。
验证Tisp40敲除对小鼠肾IRI和焦亡的影响。
使用Tisp40敲除小鼠和野生型小鼠建立IRI模型,通过HE染色、IHC、RT-qPCR、western blot检测肾损伤和焦亡相关指标。
探究Tisp40调控焦亡是否通过NF-κB通路。
在TCMK-1/Tisp40细胞中,用NF-κB抑制剂PTL处理,检测p65、p-p65、caspase-1表达,并通过流式细胞术和免疫荧光检测细胞焦亡和GSDMD-N表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | TCMK-1细胞 | American Type Culture Collection | CCL-139 |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNA iMAX | Invitrogen | -- |
| 细胞培养 | pUC57-Tisp40 | -- | -- |
| pLVX-mCMV-ZsGreen-IRES-Puro | Wuhan Viral therapy Technologies Co., Ltd. | -- | |
| 分子克隆 | EcoRI | NEB | -- |
| SpeI | NEB | -- | |
| T4 DNA连接酶 | Transgen BioTech | BM121 | |
| 琼脂糖凝胶回收试剂盒 | Omega | D2500 | |
| JM109感受态细胞 | Wuhan Viral therapy Technologies Co., Ltd. | -- | |
| 慢病毒包装 | 慢病毒包装试剂盒 | Wuhan Viral therapy Technologies Co., Ltd. | R003 |
| HE染色 | HE染色试剂盒 | Beyotime | -- |
| TUNEL检测 | TUNEL试剂盒 | Roche | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0038 |
| 酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| LDH释放检测 | LDH释放检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | 第一链cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | K1622 |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | Abcam | ab197742 |
| IL-18 ELISA试剂盒 | Abcam | ab216165 | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 免疫组织化学 | 正常山羊血清 | Gibco | 16210072 |
| 抗pro-IL-1β抗体 | Abcam | ab205924 | |
| 抗IL-1β抗体 | Abcam | ab9722 | |
| 抗IL-18抗体 | Abcam | ab71495 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Invitrogen | A32731 | |
| 免疫荧光 | 驴血清 | Sigma-Aldrich | -- |
| 抗GSDMD-N抗体 | Bioss | bs-14287R | |
| DAPI | Roche | -- | |
| 荧光显微镜 | Leica | -- | |
| 蛋白质提取 | 核质提取试剂盒 | Nanjing KeyGen Biotech. Co., Ltd. | KGP150 |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Invitrogen | -- |
| Western blotting | 抗Tisp40抗体 | Santa | sc-54800 |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | ab214185 | |
| 抗caspase-1抗体 | Abcam | ab138483 | |
| 抗p65抗体 | Abcam | ab32536 | |
| 抗磷酸化p65抗体 | Abcam | ab86299 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8224 | |
| HRP标记的二抗 | Abcam | ab6789 | |
| Odyssey红外成像系统9120型 | LI-COR Biotechnology | Model 9120 | |
| 统计分析 | SPSS软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、周龄、体重、分组、缺血时间、再灌注时间 阅读提示:Materials and Methods 中 Animals and Surgical Protocols |
| 细胞模型 | 细胞系、OGD/R处理条件(OGD时间、复氧时间)、siRNA浓度和处理时间 阅读提示:Materials and Methods 中 Cell Culture |
| Tisp40过表达 | 慢病毒载体、MOI、感染时间 阅读提示:Materials and Methods 中 Establishment of Tisp40-Overexpression Cell Line |
| NF-κB抑制剂实验 | PTL浓度和处理时间 阅读提示:Results 中 Tisp40 Regulated GSDMD-Mediated TECs Pyroptosis via NF-κB Pathway,原文未明确说明具体浓度和时间 |
| 检测指标 | HE染色损伤评分标准、TUNEL阳性细胞计数方法、western blot抗体稀释比、ELISA检测波长 阅读提示:Materials and Methods 中 HE Staining、TUNEL Assay、ELISA、Western Blotting |