临床组织样本中POLE2表达检测及临床相关性分析
检测ESCC组织中POLE2表达水平并评估其与临床病理特征及预后的关系。
采用免疫组化染色检测105对ESCC组织及配对癌旁组织中POLE2表达,结合病理数据进行统计分析,并通过Kaplan-Meier生存分析评估其与总生存期的关系。
POLE2 knockdown reduce tumorigenesis in esophageal squamous cells.
包含临床组织样本IHC分析、体外细胞功能实验(增殖、凋亡、迁移)、体内异种移植瘤模型以及分子机制验证(凋亡抗体芯片和Western blot)。
ESCC组织样本(105对肿瘤及配对癌旁组织) ESCC细胞系Eca-109和TE-1 BALB/c裸鼠异种移植模型
POLE2在肿瘤组织中的高表达与临床病理特征及预后相关性分析(Kaplan-Meier生存分析) shRNA敲低效率验证(qPCR和Western blot) 细胞功能实验:MTT增殖、集落形成、流式凋亡、伤口愈合及Transwell迁移 体内异种移植瘤模型:肿瘤体积、重量、生物发光成像及Ki67染色 凋亡抗体阵列及Western blot检测PI3K/Akt、Cyclin D1通路蛋白变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测ESCC组织中POLE2表达水平并评估其与临床病理特征及预后的关系。
采用免疫组化染色检测105对ESCC组织及配对癌旁组织中POLE2表达,结合病理数据进行统计分析,并通过Kaplan-Meier生存分析评估其与总生存期的关系。
构建并验证POLE2稳定敲低的ESCC细胞系,用于后续功能实验。
设计靶向POLE2的shRNA并构建慢病毒载体,感染Eca-109和TE-1细胞,通过qPCR和Western blot验证敲低效率,并通过荧光检测评估转染效率。
评估POLE2敲低对ESCC细胞增殖、凋亡和迁移的影响。
通过MTT实验和集落形成实验检测细胞增殖和集落形成能力;流式细胞术检测凋亡率;伤口愈合和Transwell实验检测细胞迁移能力。
探索POLE2敲低影响细胞凋亡的分子机制。
使用Human Apoptosis Antibody Array检测Eca-109细胞中43种凋亡相关蛋白的表达变化,并通过Western blot验证PI3K/Akt、Cyclin D1等通路蛋白。
验证POLE2敲低对体内肿瘤形成的影响。
将敲低POLE2或对照的Eca-109细胞皮下注射到BALB/c裸鼠,定期测量肿瘤体积和重量,并进行生物发光成像和Ki67染色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | POLE2抗体 | BIOSS | BS-14356R |
| 二抗IgG | Abcam | AB6721 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | SV30087 | |
| 慢病毒构建 | T4 DNA连接酶 | -- | -- |
| TOP10大肠杆菌感受态细胞 | TIANGEN | CB104-03 | |
| 质粒提取试剂盒 | TIANGEN | DP117 | |
| qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录试剂盒 | Vazyme | -- | |
| AceQ qPCR SYBR Green预混液 | Vazyme | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Cell Signal Technology | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | HyClone-Pierce | 23225 | |
| 羊抗兔IgG | Beyotime | A0208 | |
| ECL plus TM蛋白质印迹系统试剂盒 | Amersham | RPN2232 | |
| POLE2抗体 | Abcam | AB180214 | |
| Akt抗体 | CST | 4685 | |
| p-Akt抗体 | Bioss | BS5193R | |
| MAPK9抗体 | Abcam | AB76125 | |
| Cyclin D1抗体 | CST | 2978 | |
| PIK3CA抗体 | Abcam | AB40776 | |
| GAPDH抗体 | Bioworld | AP0063 | |
| MTT实验 | MTT试剂 | Genview | JT343 |
| 96孔板 | Corning | 3599 | |
| 集落形成实验 | 吉姆萨染液 | -- | -- |
| 凋亡实验 | Annexin V-APC | -- | -- |
| Transwell实验 | Transwell小室 | -- | -- |
| 凋亡抗体阵列 | 人凋亡抗体阵列试剂盒 | -- | AB134001 |
| ChemiDoc XRS化学发光检测系统 | HyClone-Pierce | 23225 | |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| Ki67染色 | Ki67抗体 | Abcam | AB16667 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | POLE2表达评分标准,高低分界(中位数),样本量(105对),病理特征统计(年龄、性别、肿瘤分期、淋巴结转移等) 阅读提示:Methods 免疫组化部分及 Results 表1-3 |
| 细胞培养及敲低 | 细胞系(Eca-109和TE-1),培养基(DMEM+10%FBS),CO2浓度5%,敲低序列,慢病毒构建,转染效率,敲低效率(qPCR和Western blot确认) 阅读提示:Methods 细胞培养、慢病毒载体、qPCR、Western blot及Fig.1c-e |
| 体外功能实验 | MTT细胞密度、MTT浓度和检测波长;集落形成细胞密度和培养时间;凋亡检测染色试剂和流式分析;伤口愈合初始细胞密度和观察时间;Transwell细胞密度、孔径和培养时间 阅读提示:Methods MTT、集落形成、凋亡、伤口愈合、Transwell部分 |
| 分子机制验证 | 凋亡抗体阵列试剂盒型号,蛋白提取时间,抗体阵列孵育条件;Western blot抗体种类、稀释倍数、蛋白上样量 阅读提示:Methods 人凋亡抗体阵列、Western blot及Fig.4 |
| 动物实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)和年龄(4周),细胞注射数量(4×10^6),观察时间(15-25天),肿瘤测量方法,生物发光成像条件,Ki67染色抗体浓度 阅读提示:Methods 动物异种移植模型、Ki67染色及Fig.5 |