丙泊酚暴露通过miR-124-3p/Sp1/Cdkn1b轴扰乱啮齿动物神经干细胞的分化

Propofol Exposure Disturbs the Differentiation of Rodent Neural Stem Cells via an miR-124-3p/Sp1/Cdkn1b Axis.

作者信息Jun Cao, Yan Li, Fanning Zeng, Xiaolei Liu, Tao Tao, Zaisheng Qin
PMID32984332
发布时间2020-08-27
DOI10.3389/fcell.2020.00838

实验完整度

包含体外细胞模型(大鼠原代NSCs)的功能验证(过表达miR-124-3p、敲低Sp1)、分子机制验证(荧光素酶报告基因、ChIP)及表型检测(免疫细胞化学、Western blot、qRT-PCR),证据层级独立且完整。

主要模型

大鼠胚胎(E16-E18)原代神经干细胞 HEK293T细胞

重点核对

丙泊酚处理浓度50 μM,处理时间6小时 NSCs分化诱导条件:DMEM/F12加10% FBS培养3天 miR-124-3p mimic转染浓度50 nM Sp1 shRNA慢病毒感染MOI 1:20 免疫细胞化学计数:每孔5个视野,每组4个重复孔,5次独立实验

摘要

越来越多的研究表明,丙泊酚可能导致神经毒性,其对神经干细胞(NSCs)的作用可能在丙泊酚相关的神经毒性中起关键作用。此前,我们发现丙泊酚可以促进NSCs增殖,并可以调节几种microRNA的表达。然而,丙泊酚暴露后microRNAs与NSCs发育之间的潜在机制仍不清楚。我们的数据首先观察到,暴露于丙泊酚的大鼠原代神经干细胞表现出细胞周期停滞状态,并倾向于分化为GFAP+或S100β+细胞。这一现象伴随着miR-124-3p表达降低,并且可以通过在NSCs中过表达miR-124-3p来逆转。通过生物信息学预测和荧光素酶实验,我们证实Sp1(特异性蛋白1)是miR-124-3p的靶基因,表明miR-124-3p可能通过Sp1调节NSCs的发育。此外,敲低Sp1可挽救丙泊酚对NSCs分化的影响。最后,我们通过染色质免疫沉淀实验证明Sp1可以结合cdkn1b启动子区域,表明Sp1通过cdkn1b直接影响NSC的细胞周期。总的来说,我们的研究强调了miR-124-3p/Sp1/cdkn1b轴在丙泊酚干扰NSCs分化中的重要性。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
丙泊酚暴露如何通过microRNA调控神经干细胞的分化,其潜在机制是什么?
核心机制
丙泊酚暴露下调miR-124-3p,解除对Sp1的抑制,Sp1直接结合cdkn1b启动子区域增强其转录,导致细胞周期停滞,并促使NSCs偏向分化为GFAP+或S100β+细胞。
主要证据
通过qRT-PCR证实丙泊酚下调miR-124-3p并上调Sp1和cdkn1b;荧光素酶报告基因实验证实miR-124-3p靶向Sp1的3'-UTR;ChIP实验证实Sp1结合cdkn1b启动子;过表达miR-124-3p或敲低Sp1可逆转丙泊酚对NSCs分化的影响。
研究意义
研究强调了miR-124-3p/Sp1/cdkn1b轴在丙泊酚干扰NSCs分化中的重要性,为阐明丙泊酚神经毒性的机制提供了线索,并为后续体内研究奠定基础。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

原代神经干细胞培养与鉴定

获取并验证大鼠胚胎神经干细胞

从E16-E18 SD大鼠胚胎皮层和海马分离NSCs,使用含bFGF的NSC基础培养基培养形成神经球,用Accutase消化后接种于多聚鸟氨酸和层粘连蛋白包被的培养皿,通过巢蛋白免疫荧光染色鉴定NSCs。

2

丙泊酚暴露与分化诱导

观察丙泊酚对NSCs分化的影响

NSCs用50 μM丙泊酚处理6小时后,更换为含10% FBS的DMEM/F12分化培养基培养3天,通过免疫细胞化学检测β-tubulin III和GFAP表达,量化分化比例。

3

检测miR-124-3p表达及功能验证

确定丙泊酚是否通过miR-124-3p影响NSCs分化

通过qRT-PCR检测不同miRNA表达,发现miR-124-3p下调;使用miR-124-3p mimic转染NSCs,检测GFAP+细胞比例变化,验证过表达miR-124-3p能否逆转丙泊酚效应。

4

靶基因预测与验证

预测并验证miR-124-3p的直接靶基因

使用miRWalk、miRanda、miRDB和TargetScan四个数据库预测miR-124-3p靶基因,取交集后进行GO富集分析,选择Sp1作为候选靶基因。利用双荧光素酶报告基因实验验证miR-124-3p与Sp1 3'-UTR的结合。

5

Sp1表达及功能验证

验证Sp1在丙泊酚诱导NSCs分化中的作用

通过qRT-PCR、免疫荧光和Western blot检测丙泊酚处理后Sp1表达变化;使用Sp1 shRNA慢病毒感染NSCs敲低Sp1,观察GFAP+细胞比例变化。

6

cdkn1b调控与细胞周期检测

阐明Sp1调控NSCs细胞周期和分化的下游机制

通过qRT-PCR和Western blot检测丙泊酚处理后cdkn1b表达;通过ChIP实验验证Sp1与cdkn1b启动子区域的结合;通过流式细胞术检测细胞周期分布。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证样本或模型特征
验证分子表达变化
验证细胞功能变化

产品清单

实验环节名称品牌货号
神经干细胞基础培养基Millipore--
碱性成纤维细胞生长因子R&D--
AccutaseMillipore--
多聚鸟氨酸Sigma-Aldrich--
层粘连蛋白Sigma-Aldrich--
杜氏改良Eagle培养基/F12----
小鼠抗β-微管蛋白III抗体Proteintech66375-1-Ig
兔抗GFAP抗体AbclonalA14673
兔抗巢蛋白抗体ABclonalA0484
Triton X-100Sigma-Aldrich--
牛血清白蛋白Solarbio--
FITC标记的山羊抗兔IgGBiossbs-0295G-FITC
Cy3标记的山羊抗小鼠IgGBiossbs-0296G-Cy3
Cy3标记的山羊抗兔IgGBiossbs-0295G-Cy3
DyLight 405标记的山羊抗小鼠IgG抗体AbbkineA23110
DAPI----
激光扫描共聚焦显微镜Olympus--
Lipofectamine 2000转染试剂Invitrogen--
双荧光素酶报告基因检测系统Promega--
多功能酶标仪BioTek--
miR-124-3p模拟物Genepharma--
TRIzol试剂Thermo Fisher Scientific--
PrimeScript RT试剂盒(带gDNA Eraser)TaKaRa--
RNAisoTaKaRa--
MirX miRNA第一链合成试剂盒Clontech--
TB Green Premix Ex Taq IITaKaRa--
MirX miRNA qRT-PCR SYBR试剂盒Clontech--
ABI 7500系统Applied Biosystems--
Sp1 shRNA慢病毒Obio Technology--
RIPA裂解液Beyotime--
PVDF膜Millipore--
湿转系统Bio-Rad--
兔抗Sp1抗体Abcamab13370
兔抗cdkn1b抗体Abcamab32034
兔抗GAPDH抗体Abcamab9485
兔抗β-微管蛋白抗体Abcamab6046
HRP标记的山羊抗兔IgG二抗Biossbs-0295G-HRP
增强化学发光试剂Millipore--
Pierce磁性ChIP试剂盒Thermo Fisher Scientific--
抗Sp1抗体Cell Signaling Technology9389
兔IgGThermo Fisher Scientific31887
2 × Taq Plus Master MixVazyme--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
NSC培养与丙泊酚暴露
NSC来源(SD大鼠胚胎E16-E18)、丙泊酚浓度50 μM、处理时间6小时
阅读提示:参见Materials and Methods 'Culture of NSCs and Propofol Exposure'
分化诱导
分化培养基(DMEM/F12+10% FBS)、分化时间3天
阅读提示:参见Materials and Methods 'NSCs' Differentiation'
miR-124-3p过表达
miR-124-3p mimic浓度50 nM、转染试剂
阅读提示:参见Materials and Methods 'miR-124-3p Overexpression'
Sp1敲低
Sp1 shRNA慢病毒、MOI 1:20、感染时间72小时
阅读提示:参见Materials and Methods 'Lentiviral Vector Transduction'
免疫细胞化学定量
计数视野(每孔5个视野)、重复孔数(4)和独立实验次数(5)
阅读提示:参见Materials and Methods 'Immunocytochemistry'