建立体内APAP诱导肝损伤模型并检测p66Shc表达
确定APAP处理是否改变肝组织中p66Shc的表达。
C57BL/6小鼠腹腔注射APAP(300mg/kg)诱导肝损伤,24h后取肝组织,Western blot检测p66Shc蛋白水平。
circ-CBFB upregulates p66Shc to perturb mitochondrial dynamics in APAP-induced liver injury.
包含体内小鼠模型和体外细胞实验两个证据层级,并进行功能验证(敲低/过表达)和机制验证(miRNA靶向、泛素化、回复实验)。
C57BL/6小鼠APAP诱导肝损伤模型 AML12小鼠肝细胞系
APAP剂量:300 mg/kg(体内)和5 mM(体外) 给药方式:腹腔注射(体内);细胞处理(体外) 处理时间:24小时(体内和体外) 敲低序列:p66Shc、miR-185-5p、circ-CBFB的shRNA/siRNA序列 统计方法:t检验或单因素方差分析,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定APAP处理是否改变肝组织中p66Shc的表达。
C57BL/6小鼠腹腔注射APAP(300mg/kg)诱导肝损伤,24h后取肝组织,Western blot检测p66Shc蛋白水平。
评估p66Shc沉默是否影响APAP诱导的线粒体动力学紊乱和肝损伤。
通过尾静脉注射lentivirus-p66Shc-shRNA敲低p66Shc,7天后APAP处理,检测肝损伤指标(ALT/AST、H2O2、GSH、MDA)、组织学(H&E)、线粒体形态(TEM)和线粒体动力学相关蛋白(OMA1、OPA1、MFN2、DRP1)。
验证p66Shc在肝细胞中的作用及其对线粒体动力学的影响。
AML12细胞转染si-p66Shc或pcDNA-p66Shc,然后APAP处理,检测H2O2、蛋白表达(p66Shc、OMA1、OPA1等)、mtROS(MitoSOX)、凋亡(TUNEL)、线粒体形态(TOM20染色)和OMA1泛素化。
阐明p66Shc调节线粒体动力学的分子机制。
通过miRNA微阵列和生物信息学预测miR-185-5p为p66Shc上游调节因子;用qRT-PCR检测miR-185-5p表达;用agomir/antagomir改变miR-185-5p水平检测p66Shc蛋白;用双荧光素酶报告实验验证miR-185-5p直接靶向p66Shc-3'UTR;检测OMA1泛素化水平;用MG132和mito-TEMPO处理验证泛素化和mtROS的作用。
确定circ-CBFB是否作为ceRNA吸附miR-185-5p。
通过circRNA预测软件筛选候选circRNA,qRT-PCR验证APAP处理后circ-CBFB上调;通过核质分离、FISH、RNase R处理验证circ-CBFB的环状性和胞质定位;通过RNA pull-down、荧光素酶和RIP验证circ-CBFB与miR-185-5p的直接结合。
验证circ-CBFB通过miR-185-5p调节p66Shc和线粒体动力学。
AML12细胞共转染si-circ-CBFB和ant-185,APAP处理后检测蛋白表达(p66Shc、OMA1等)、线粒体碎片化(TOM20)和细胞损伤。
在体内验证circ-CBFB通过miR-185-5p调节APAP诱导的肝损伤。
小鼠分别注射lentivirus-circ-CBFB-shRNA和/或lentivirus-miR-185-5p-inhibitor,7天后APAP处理,检测肝损伤指标(ALT/AST、GSH、MDA)、组织学(H&E)、线粒体形态(TEM)和蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 药物处理 | MG132 | Selleck | -- |
| Mito-TEMPO | Sigma | -- | |
| Ruboxistaurin | Selleck | -- | |
| Western blot | p66Shc抗体 | BD Biosciences | 610878 |
| p-p66Shc抗体 | Bioss | bs-3410R | |
| CYP2E1抗体 | Proteintech | 19937-1-AP | |
| OMA1抗体 | Santa | sc-515788 | |
| OPA1抗体 | Proteintech | 27733-1-AP | |
| MFN2抗体 | Bioss | bs-23685R | |
| DRP1抗体 | Wanleibio | WL03028 | |
| p-DRP1抗体 | Abcam | ab193216 | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 60008-1-Ig | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| qRT-PCR | PrimeScript™ RT试剂盒 | TaKaRa | -- |
| SYBR Premix EX Taq™ ii | TaKaRa | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| MitoSOX染色 | MitoSOX Red | Invitrogen | -- |
| Hoechst 33342 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| TUNEL染色 | 凋亡检测试剂盒 | KeyGEN BioTECH | KGA704 |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 线粒体分离 | 哺乳动物线粒体分离试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| RNA免疫沉淀 | RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | Millipore | -- |
| 抗Argonaute 2抗体 | Abcam | ab32381 | |
| 正常小鼠IgG | Millipore | -- | |
| RNA pull-down | M-280链霉亲和素磁珠 | Invitrogen | -- |
| RNase R处理 | RNase R | GENESEED | -- |
| 核质分离 | PARIS试剂盒 | Invitrogen | -- |
| FISH | RNA FISH试剂盒 | GenePharma | -- |
| 荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因试剂盒 | TransGene Biotech | -- |
| 病理检测 | ALT/AST检测试剂盒 | Jiancheng Corp. | -- |
| GSH/MDA/H2O2检测试剂盒 | Jiancheng Corp. | -- | |
| 荧光显微镜 | 80i尼康显微镜 | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;APAP剂量(300mg/kg)、给药途径、处理时间;动物分组及样本量(12只/组);敲低病毒类型(lentivirus-shRNA)及注射剂量(1×10^9 viral particles/mouse)、注射途径(尾静脉)、预处理时间(7天) 阅读提示:Materials and methods: APAP-induced liver injury in vivo; Figure legends (Fig. 1) |
| 细胞培养与处理 | AML12细胞培养条件(DMEM:F12, 10% FBS, insulin, transferrin, selenium, dexamethasone);转染试剂(Lipofectamine 3000)及时间(48h);APAP浓度(5mM)及处理时间(24h) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection; Figure legends (Fig. 2) |
| Western blot | 裂解液、蛋白定量方法、上样量、一抗稀释比例、二抗来源、ECL显色方法 阅读提示:Materials and methods: Western blotting |
| 线粒体动力学检测 | TEM样本制备(固定、包埋、切片)、MitoSOX染色条件(10min, 37°C)、TUNEL试剂盒、TOM20染色 阅读提示:Materials and methods: Transmission electron microscopy, MitoSOX staining, TUNEL staining; Figure legends (Fig. 2) |
| RNA pull-down和RIP | biotin标记miR-185-5p mimic序列、突变序列;AGO2抗体;磁珠类型;裂解buffer 阅读提示:Materials and methods: RNA immunoprecipitation and pull-down assays |