α-酮戊二酸通过调节组蛋白甲基化改善年龄相关性骨质疏松症

Alpha-ketoglutarate ameliorates age-related osteoporosis via regulating histone methylations.

作者信息Yuan Wang, Peng Deng, Yuting Liu, Yunshu Wu, Yaqian Chen, Yuchen Guo, Shiwen Zhang, Xiaofei Zheng, Liyan Zhou, Weiqing Liu, Qiwen Li, Weimin Lin, Xingying Qi, Guomin Ou, Cunyu Wang, Quan Yuan
PMID33154378
发布时间2020-11-05
DOI10.1038/s41467-020-19360-1

实验完整度

包含体内动物模型(小鼠和大鼠)实验、体外原代细胞实验、组学分析(RNA-seq)、分子机制验证(ChIP-qPCR、Western blot)及功能实验(增殖、迁移、成骨分化等),证据层级多样且功能与机制验证明确。

主要模型

C57BL/6J小鼠 Sprague Dawley大鼠 骨髓间充质干细胞(MSCs)

重点核对

αKG给药浓度(0.25%或0.75%溶于饮用水) 动物年龄(18个月小鼠、24个月大鼠) MSCs处理剂量(2 mM αKG) 成骨诱导时间(ALP测定7天,矿化检测21天)

摘要

年龄相关性骨质疏松症的特征是骨量和骨强度的下降,部分原因是衰老过程中骨髓间充质基质/干细胞(MSCs)的功能障碍。α-酮戊二酸(αKG)是三羧酸(TCA)循环中的重要中间代谢物。研究表明,αKG可延长线虫的寿命并维持胚胎干细胞(ESCs)的多能性。在此,我们显示给予αKG可增加老年小鼠的骨量,减轻与年龄相关的骨丢失,并加速老年啮齿动物的骨再生。αKG改善从老年小鼠来源的骨髓MSCs的衰老相关(SA)表型,并促进其增殖、集落形成、迁移和成骨潜能。机制上,αKG降低H3K9me3和H3K27me3的积累,随后上调BMP信号和Nanog表达。总之,我们的发现阐明了αKG在恢复MSCs活力及改善年龄相关性骨质疏松症中的作用,并在年龄相关疾病中具有潜在的治疗前景。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
αKG是否对年龄相关性骨质疏松有改善作用及其潜在机制。
核心机制
αKG通过降低衰老MSCs中H3K9me3和H3K27me3的积累,减少其在Bmp2、Bmp4和Nanog启动子上的富集,上调BMP信号和Nanog表达,从而恢复MSCs功能。
主要证据
体内实验显示αKG增加老年小鼠骨量和骨再生;体外实验显示αKG促进衰老MSCs增殖、迁移和成骨分化,并降低衰老标志;ChIP和western blot证实组蛋白甲基化变化和靶基因表达上调。
研究意义
为αKG作为年龄相关疾病治疗策略提供潜在应用价值。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

αKG对老年小鼠骨量的影响

评估αKG补充是否能增加老年小鼠的骨量

给18月龄小鼠饮用含0.25%或0.75%αKG的水1个月,通过microCT、组织形态计量学分析骨量参数。

2

αKG对年龄相关骨丢失的缓解作用

验证αKG是否能减缓成年小鼠的年龄相关骨丢失

从2月龄开始给雌性小鼠0.25%αKG饮用水,至6月龄,通过microCT和组织学分析骨量保留情况。

3

αKG对骨缺损愈合的促进作用

评估αKG是否加速老年大鼠的骨缺损修复

对24月龄大鼠进行股骨钻孔缺损手术,术前2周开始给予0.75%αKG,术后2或4周进行microCT和组织学分析。

4

αKG对衰老MSCs生物学功能的影响

检测αKG对衰老MSCs增殖、迁移、集落形成和成骨分化的影响

从18月龄小鼠分离MSCs,使用不同浓度αKG处理,进行EdU实验、集落形成、划痕和transwell迁移实验、成骨诱导和染色。

5

αKG对衰老表型的缓解作用

验证αKG是否能减轻MSCs的衰老相关标志

用2 mMαKG处理衰老MSCs3天,检测衰老基因表达、核膜形态、DNA损伤、SA-β-gal和ROS水平。

6

αKG对组蛋白甲基化的调节

探究αKG是否影响衰老MSCs中组蛋白甲基化水平

通过Western blot和免疫荧光检测αKG处理后的MSCs中H3K9me3、H3K27me3等组蛋白修饰水平,并在体内验证。

7

αKG对BMP信号通路和靶基因的调控

确定αKG是否通过组蛋白去甲基化上调BMP通路和Nanog表达

进行RNA-seq和GSEA分析,并通过ChIP-qPCR检测H3K9me3和H3K27me3在Bmp2、Bmp4和Nanog启动子区域的富集,使用JIB 04抑制去甲基化酶验证。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
α-酮戊二酸SigmaK1128
α-MEM培养基未明确说明--
胎牛血清Gibco--
青霉素/链霉素HyClone--
100 cm2培养皿Corning--
抗坏血酸Sigma--
β-甘油磷酸Sigma--
地塞米松Sigma--
萘酚AS-BI磷酸盐SigmaN2125
固蓝BBSigmaD9805
ALP活性检测试剂盒BeyotimeP0321
茜素红SSigma-Aldrich--
Van Gieson染色试剂盒SolarbioG1338
β-半乳糖苷酶染色试剂盒BeyotimeRG0039
αKG检测试剂盒Abcamab83431
ROS检测试剂盒Abcamab186027
EdU掺入检测试剂盒InvitrogenC10337
FITC Annexin V凋亡检测试剂盒IBD Biosciences556547
Transwell小室(8 μm)Corning3422
抗γH2A.X抗体CST9718S
抗Lamin A/C抗体CST4777S
抗H3K9me3抗体Abcamab8898
抗H3K27me3抗体CST9733S
含DAPI的抗淬灭封片剂VECTORH-1200
抗LepR抗体R&DAF497
驴抗山羊FITC二抗Biossbs-0294D-FITC
驴抗兔Alexa Fluor 555二抗BeyotimeA0453
IX81显微镜Olympus--
Trizol试剂Invitrogen--
PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser)Takara--
SYBR Premix Ex Taq IITakara--
NanoDrop 2000分光光度计Thermo Fisher Scientific--
CFX96实时荧光定量PCR仪Bio-Rad--
RIPA裂解液Pierce--
PVDF膜Millipore--
ECL化学发光试剂Millipore--
抗H3抗体CST4499
抗H3K4me3抗体CST9751
抗H3K9ac抗体CST9649
抗H3K27ac抗体CST8173
NEBNext® Ultra™ RNA文库制备试剂盒NEB--
Illumina HiSeq 3000测序平台Illumina--
EZ-Zyme™染色质制备试剂盒Millipore17-375
EZ-Magna ChIP™高灵敏染色质免疫沉淀试剂盒Millipore10-10461

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物实验
动物品系、年龄、性别;αKG给药浓度(0.25%或0.75%)和给药方式(饮用水)
阅读提示:Methods: Animals
细胞培养
MSCs分离方法;培养基组成;αKG处理浓度和时间
阅读提示:Methods: Cell culture
成骨分化
成骨诱导培养基成分;诱导时间;染色方法
阅读提示:Methods: Osteogenic induction and alkaline phosphatase activity assay, Mineralization assay
衰老表型检测
衰老标志物检测方法;αKG处理浓度和时间;H2O2诱导浓度
阅读提示:Methods: Senescence-associated-β-galactosidase assay, Proliferation assay, Lifespan analysis
组蛋白甲基化检测
Western blot和免疫荧光检测条件;ChIP实验条件和抗体
阅读提示:Methods: Western blot, Immunofluorescence staining, ChIP assay
RNA-seq和GSEA
RNA提取和文库构建方法;测序平台;生物信息分析流程
阅读提示:Methods: RNA sequencing and GSEA