αKG对老年小鼠骨量的影响
评估αKG补充是否能增加老年小鼠的骨量
给18月龄小鼠饮用含0.25%或0.75%αKG的水1个月,通过microCT、组织形态计量学分析骨量参数。
Alpha-ketoglutarate ameliorates age-related osteoporosis via regulating histone methylations.
包含体内动物模型(小鼠和大鼠)实验、体外原代细胞实验、组学分析(RNA-seq)、分子机制验证(ChIP-qPCR、Western blot)及功能实验(增殖、迁移、成骨分化等),证据层级多样且功能与机制验证明确。
C57BL/6J小鼠 Sprague Dawley大鼠 骨髓间充质干细胞(MSCs)
αKG给药浓度(0.25%或0.75%溶于饮用水) 动物年龄(18个月小鼠、24个月大鼠) MSCs处理剂量(2 mM αKG) 成骨诱导时间(ALP测定7天,矿化检测21天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估αKG补充是否能增加老年小鼠的骨量
给18月龄小鼠饮用含0.25%或0.75%αKG的水1个月,通过microCT、组织形态计量学分析骨量参数。
验证αKG是否能减缓成年小鼠的年龄相关骨丢失
从2月龄开始给雌性小鼠0.25%αKG饮用水,至6月龄,通过microCT和组织学分析骨量保留情况。
评估αKG是否加速老年大鼠的骨缺损修复
对24月龄大鼠进行股骨钻孔缺损手术,术前2周开始给予0.75%αKG,术后2或4周进行microCT和组织学分析。
检测αKG对衰老MSCs增殖、迁移、集落形成和成骨分化的影响
从18月龄小鼠分离MSCs,使用不同浓度αKG处理,进行EdU实验、集落形成、划痕和transwell迁移实验、成骨诱导和染色。
验证αKG是否能减轻MSCs的衰老相关标志
用2 mMαKG处理衰老MSCs3天,检测衰老基因表达、核膜形态、DNA损伤、SA-β-gal和ROS水平。
探究αKG是否影响衰老MSCs中组蛋白甲基化水平
通过Western blot和免疫荧光检测αKG处理后的MSCs中H3K9me3、H3K27me3等组蛋白修饰水平,并在体内验证。
确定αKG是否通过组蛋白去甲基化上调BMP通路和Nanog表达
进行RNA-seq和GSEA分析,并通过ChIP-qPCR检测H3K9me3和H3K27me3在Bmp2、Bmp4和Nanog启动子区域的富集,使用JIB 04抑制去甲基化酶验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | α-酮戊二酸 | Sigma | K1128 |
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | 未明确说明 | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | HyClone | -- | |
| 100 cm2培养皿 | Corning | -- | |
| 成骨诱导 | 抗坏血酸 | Sigma | -- |
| β-甘油磷酸 | Sigma | -- | |
| 地塞米松 | Sigma | -- | |
| ALP活性检测 | 萘酚AS-BI磷酸盐 | Sigma | N2125 |
| 固蓝BB | Sigma | D9805 | |
| ALP活性检测试剂盒 | Beyotime | P0321 | |
| 矿化检测 | 茜素红S | Sigma-Aldrich | -- |
| 胶原染色 | Van Gieson染色试剂盒 | Solarbio | G1338 |
| β-半乳糖苷酶染色 | β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Beyotime | RG0039 |
| αKG水平检测 | αKG检测试剂盒 | Abcam | ab83431 |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Abcam | ab186027 |
| 增殖检测 | EdU掺入检测试剂盒 | Invitrogen | C10337 |
| 凋亡检测 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒I | BD Biosciences | 556547 |
| 迁移实验 | Transwell小室(8 μm) | Corning | 3422 |
| 免疫荧光 | 抗γH2A.X抗体 | CST | 9718S |
| 抗Lamin A/C抗体 | CST | 4777S | |
| 抗H3K9me3抗体 | Abcam | ab8898 | |
| 抗H3K27me3抗体 | CST | 9733S | |
| 含DAPI的抗淬灭封片剂 | VECTOR | H-1200 | |
| 免疫荧光双染 | 抗LepR抗体 | R&D | AF497 |
| 驴抗山羊FITC二抗 | Bioss | bs-0294D-FITC | |
| 驴抗兔Alexa Fluor 555二抗 | Beyotime | A0453 | |
| 显微镜成像 | IX81显微镜 | Olympus | -- |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq II | Takara | -- | |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Pierce | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| 抗H3抗体 | CST | 4499 | |
| 抗H3K4me3抗体 | CST | 9751 | |
| 抗H3K9ac抗体 | CST | 9649 | |
| 抗H3K27ac抗体 | CST | 8173 | |
| RNA-seq | NEBNext® Ultra™ RNA文库制备试剂盒 | NEB | -- |
| Illumina HiSeq 3000测序平台 | Illumina | -- | |
| ChIP | EZ-Zyme™染色质制备试剂盒 | Millipore | 17-375 |
| EZ-Magna ChIP™高灵敏染色质免疫沉淀试剂盒 | Millipore | 10-10461 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | 动物品系、年龄、性别;αKG给药浓度(0.25%或0.75%)和给药方式(饮用水) 阅读提示:Methods: Animals |
| 细胞培养 | MSCs分离方法;培养基组成;αKG处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 成骨分化 | 成骨诱导培养基成分;诱导时间;染色方法 阅读提示:Methods: Osteogenic induction and alkaline phosphatase activity assay, Mineralization assay |
| 衰老表型检测 | 衰老标志物检测方法;αKG处理浓度和时间;H2O2诱导浓度 阅读提示:Methods: Senescence-associated-β-galactosidase assay, Proliferation assay, Lifespan analysis |
| 组蛋白甲基化检测 | Western blot和免疫荧光检测条件;ChIP实验条件和抗体 阅读提示:Methods: Western blot, Immunofluorescence staining, ChIP assay |
| RNA-seq和GSEA | RNA提取和文库构建方法;测序平台;生物信息分析流程 阅读提示:Methods: RNA sequencing and GSEA |