体内肾IRI模型建立与Nrf1和焦亡标志物检测
观察肾缺血再灌注后肾小管上皮细胞焦亡程度及Nrf1表达变化,确定Nrf1是否参与焦亡过程
对C57BL/6小鼠进行肾缺血30分钟并再灌注6、12、24小时,通过TUNEL染色、IHC、Western blot和qRT-PCR检测Nrf1和GSDMD-N的表达。
Identification of MicroRNA-92a-3p as an Essential Regulator of Tubular Epithelial Cell Pyroptosis by Targeting Nrf1 via HO-1.
包含体内小鼠肾IRI模型和体外TCMK-1细胞OGD/R模型,并进行了Nrf1过表达、miR-92a-3p抑制及HO-1抑制剂干预等功能验证和机制验证。
C57BL/6小鼠肾缺血再灌注损伤模型 TCMK-1细胞OGD/R模型 Nrf1过表达的TCMK-1细胞系 293T细胞双荧光素酶报告系统
C57BL/6小鼠(8周龄,雄性,20-25g)肾缺血30分钟和再灌注6、12、24小时 TCMK-1细胞OGD处理24小时后再复氧2、4、8小时 antagomir miR-92a-3p或antagomir NC(10mg/kg尾静脉注射) ZnPPIX(HO-1抑制剂)浓度10μg/μl,处理24小时 Nrf1过表达慢病毒感染MOI=20
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察肾缺血再灌注后肾小管上皮细胞焦亡程度及Nrf1表达变化,确定Nrf1是否参与焦亡过程
对C57BL/6小鼠进行肾缺血30分钟并再灌注6、12、24小时,通过TUNEL染色、IHC、Western blot和qRT-PCR检测Nrf1和GSDMD-N的表达。
验证体外OGD/R诱导的TCMK-1细胞中Nrf1表达变化及焦亡情况
TCMK-1细胞经OGD处理24小时后复氧2、4、8小时,通过CCK-8、Western blot和qRT-PCR检测细胞活力和Nrf1、GSDMD-N表达。
验证Nrf1过表达对OGD/R诱导的TCMK-1细胞焦亡的影响
使用慢病毒构建Nrf1稳定过表达的TCMK-1细胞系,经OGD/R处理后通过Western blot检测焦亡相关蛋白、CCK-8检测活力、LDH释放和ELISA检测IL-1β/IL-18。
验证miR-92a-3p是否直接靶向Nrf1
通过生物信息学预测,并利用双荧光素酶报告基因实验在293T细胞中验证miR-92a-3p对Nrf1-3'UTR的直接结合。
验证抑制miR-92a-3p是否能减轻OGD/R诱导的TEC氧化应激和焦亡
TCMK-1细胞转染antagomir miR-92a-3p后经OGD/R处理,检测SOD、MDA、IL-1β、IL-18及Nrf1、NLRP3、GSDMD-N、caspase-1的表达。
验证体内抑制miR-92a-3p是否能减轻肾IRI所致的肾小管损伤和焦亡
小鼠经尾静脉注射antagomir miR-92a-3p后实施IRI,通过HE染色、TUNEL、IHC、Western blot检测肾损伤和焦亡标志物,并检测BUN和SCr水平。
验证Nrf1过表达的保护作用是否通过HO-1介导
在Nrf1过表达的TCMK-1细胞中联合使用HO-1抑制剂ZnPPIX,检测ROS水平、细胞焦亡(流式细胞术)、焦亡相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | TCMK-1细胞 | American Type Culture Collection | CCL-139 |
| Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- | |
| 药物处理 | 锌原卟啉IX | Wako Pure Chemical Industries | -- |
| 细胞转染 | pUC57-Nrf1质粒 | -- | -- |
| 载体构建 | pLVX-mCMV-ZsGreen-IRES-Puro载体 | Wuhan Viral Therapy Technologies Co., Ltd | -- |
| 分子克隆 | EcoRI限制酶 | NEB | -- |
| SpeI限制酶 | NEB | -- | |
| T4 DNA连接酶 | TransGen BioTech | BM121 | |
| 琼脂糖凝胶回收试剂盒 | Omega | -- | |
| JM109感受态细胞 | Wuhan Viral Therapy Technologies Co., Ltd | -- | |
| 细胞转染 | 慢病毒包装试剂盒 | Wuhan Viral Therapy Technologies Co., Ltd | -- |
| TUNEL检测 | TUNEL试剂盒 | Roche | 11684817910 |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测试剂盒 | Beyotime | C0038 |
| LDH释放检测 | LDH释放检测试剂盒 | Beyotime | C0017 |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Revert Aid第一链cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | K1622 | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | Abcam | ab197742 |
| IL-18 ELISA试剂盒 | Abcam | ab216165 | |
| 氧化应激检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | S0033M |
| MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131M | |
| SOD检测试剂盒 | Beyotime | S0109 | |
| 肾功能检测 | 尿素氮B检测试剂盒 | Wako | -- |
| LabAssayTM肌酐检测试剂盒 | Wako | -- | |
| 流式分析 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | 558064 |
| 免疫组化 | 正常山羊血清 | Gibco, Thermo Fisher Scientific, Inc. | 16210072 |
| 抗IL-1β抗体 | Abcam | ab9722 | |
| 抗IL-18抗体 | Abcam | Ab71495 | |
| 抗GSDMD-N抗体 | Bioss | bs-14287R | |
| 抗Nrf1抗体 | Abcam | ab175932 | |
| 免疫荧光 | 驴血清 | Sigma-Aldrich | D9663 |
| 二抗 | Invitrogen | A32731 | |
| DAPI | Roche | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8224 | |
| 抗HO-1抗体 | Abcam | ab68477 | |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | ab214185 | |
| 抗caspase-1抗体 | Abcam | ab138483 | |
| HRP偶联二抗 | Abcam | ab6789 | |
| Odyssey红外成像系统 | LI-COR Biotechnology | -- | |
| 统计分析 | SPSS 22.0软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | C57BL/6小鼠(8周龄,雄性,20-25g),缺血30分钟和再灌注时间(6、12、24小时),每组n=6 阅读提示:参见Materials and Methods之Animals and Surgical Protocols |
| 细胞模型 | TCMK-1细胞(ATCC CCL-139),OGD处理24小时及复氧时间(2、4、8小时),每组n=3 阅读提示:参见Materials and Methods之Cell Culture and Transfection |
| 药物处理 | ZnPPIX浓度(10μg/μl)处理24小时 阅读提示:参见Materials and Methods之Cell Culture and Transfection |
| 基因操作 | 慢病毒感染MOI=20,构建Nrf1过表达稳定细胞系 阅读提示:参见Materials and Methods之Establishment of Nrf1-Overexpression Cell Line |
| 体内给药 | antagomir miR-92a-3p或antagomir NC(10mg/kg)尾静脉注射,缺血前或再灌注时? 阅读提示:参见Materials and Methods之Animals and Surgical Protocols |