临床样本分析
评估ZNF280A在LUAD组织中的表达水平及其临床意义。
对92例LUAD组织和70例正常组织进行IHC染色,分析ZNF280A表达与临床病理参数的相关性,并进行Kaplan-Meier生存分析。
ZNF280A promotes lung adenocarcinoma development by regulating the expression of EIF3C.
包含临床样本IHC分析、体外细胞功能实验(增殖、凋亡、周期、迁移)、体内异种移植瘤模型及机制验证(微阵列、qPCR、WB、挽救实验)。
A549细胞系 NCI-H1299细胞系 SPC-A-1细胞系 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
临床样本:92例LUAD组织和70例正常组织(组织芯片) 细胞系:A549和NCI-H1299(高表达ZNF280A) 体内模型:BALB/c裸鼠皮下注射NCI-H1299-shZNF280A或shCtrl细胞,每组10只 药物处理:shRNA敲低ZNF280A或EIF3C,ZNF280A过表达质粒 细胞接种量:5×10^6 cells/只(小鼠)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ZNF280A在LUAD组织中的表达水平及其临床意义。
对92例LUAD组织和70例正常组织进行IHC染色,分析ZNF280A表达与临床病理参数的相关性,并进行Kaplan-Meier生存分析。
验证敲低ZNF280A对LUAD细胞增殖、凋亡、周期和迁移的影响。
在A549和NCI-H1299细胞中通过慢病毒载体敲低ZNF280A,进行MTT、流式细胞术、划痕实验和Transwell实验。
验证敲低ZNF280A对肿瘤生长的影响。
将敲低或对照的NCI-H1299细胞皮下注射至裸鼠,观察肿瘤体积、重量及Ki67表达。
鉴定ZNF280A调控LUAD的下游分子。
对NCI-H1299-shZNF280A和shCtrl进行微阵列分析,筛选差异表达基因,结合IPA网络分析和验证实验确定EIF3C。
验证EIF3C敲低对LUAD细胞表型的影响。
在NCI-H1299细胞中敲低EIF3C,进行增殖、克隆形成、凋亡和迁移实验。
验证EIF3C是否介导ZNF280A对LUAD的促进作用。
在NCI-H1299细胞中单独过表达ZNF280A或同时敲低EIF3C,检测细胞增殖、克隆形成、凋亡和迁移变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| McCoy's 5A培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher | 13778075 |
| 免疫组织化学 | ZNF280A抗体 | BIOSS | bs-12839R |
| 组织芯片 | Shanghai Outdo Biotech | HLugA180Su05 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Sigma | -- |
| RNA质量检测 | Nanodrop 2000/2000C分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 逆转录 | Promega M-MLV试剂盒 | Promega | -- |
| qPCR | SYBR Green预混液 | Vazyme | -- |
| Biosystems 7500序列检测系统 | -- | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Millipore | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | HyClone-Pierce | -- | |
| SDS-PAGE凝胶 | Invitrogen | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Amersham | -- | |
| 细胞增殖 | MTT试剂 | GenView | -- |
| 酶标仪 | Tecan | -- | |
| Celigo细胞分析仪 | Nexcelom | -- | |
| 细胞凋亡 | Annexin V-APC凋亡检测试剂盒 | eBioscience | 88-8007 |
| 细胞周期 | 碘化丙啶染色液 | -- | -- |
| 流式分析 | FACScan流式细胞仪 | -- | -- |
| 细胞迁移 | 96孔划痕器 | VP scientific | -- |
| 微阵列 | PrimeView人基因表达芯片 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 动物实验 | IVIS Spectrum活体成像系统 | Perkin Elmer | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 组织芯片:包含92例LUAD和70例正常组织;IHC评分标准:阳性百分比和染色强度 阅读提示:Materials and methods: IHC staining; Results: ZNF280A is upregulated in LUAD tissues |
| 体外细胞实验 | 细胞系:A549和NCI-H1299(高表达ZNF280A);敲低效率验证:qPCR和Western blot;处理时间:72小时 阅读提示:Materials and methods: Cell lines and cell transfection, RNA interference and plasmids packaging; Results: ZNF280A knockdown inhibited LUAD development in vitro |
| 体内异种移植瘤实验 | 动物:BALB/c裸鼠,4周龄,雌性,每组10只;细胞接种量:5×10^6细胞/只;观察周期:22-34天;肿瘤体积计算公式:π/6×L×W^2 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments; Results: ZNF280A knockdown inhibited tumor growth of LUAD in vivo |
| 机制研究 | 微阵列分析差异基因筛选标准:P<0.05,|Fold Change|>1.3;EIF3C表达验证:IHC、qPCR、Western blot 阅读提示:Materials and methods: Microarray analysis; Results: The potential of EIF3C as the downstream of ZNF280A |
| 挽救实验 | 分组:Control、ZNF280A过表达、NC(OE+KD)、ZNF280A+shEIF3C;转染效率验证 阅读提示:Materials and methods: RNA interference and plasmids packaging; Results: EIF3C knockdown alleviated ZNF280A overexpression induced promotion of LUAD |