ZnO NPs的表征与细胞摄取
验证ZnO NPs的物理特性及其被PC12细胞摄取的能力。
通过TEM和动态光散射表征ZnO NPs的尺寸和形态;通过TEM观察细胞内ZnO NPs的分布,通过流式细胞术检测SSC强度,并通过AAS测量细胞总锌含量。
Zinc oxide nanoparticles effectively regulate autophagic cell death by activating autophagosome formation and interfering with their maturation.
包含体外细胞模型PC12,以及ZnO NPs摄取、锌离子释放、ROS检测、细胞活力、自噬流分析、Western blot、免疫沉淀、信号通路抑制剂等多层级实验,并进行了功能验证和机制验证。
PC12细胞系(大鼠肾上腺嗜铬细胞瘤细胞) 分化后的PC12细胞
ZnO NPs浓度:15 μg/mL ZnO NPs暴露时间:2-24小时 自噬抑制剂3-MA(2 mM) JNK抑制剂SP600125(10 μM) 锌离子螯合剂TPEN(4 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ZnO NPs的物理特性及其被PC12细胞摄取的能力。
通过TEM和动态光散射表征ZnO NPs的尺寸和形态;通过TEM观察细胞内ZnO NPs的分布,通过流式细胞术检测SSC强度,并通过AAS测量细胞总锌含量。
检测ZnO NPs在细胞内释放游离锌离子并诱导ROS产生的过程。
使用Fluor™Zn-520探针和共聚焦显微镜检测细胞内锌离子水平及与溶酶体的共定位;使用DCFH-DA探针检测ROS水平。
确定ZnO NPs诱导PC12细胞死亡的主要模式。
使用PI染色和CCK-8检测细胞活力,并使用多种细胞死亡抑制剂(Z-VAD-FMK、Nec-1、NSA、3-MA、CQ、Fer-1、Lip-1)预处理,观察对细胞死亡的影响。
检测ZnO NPs诱导自噬体积累及自噬流是否受损。
通过Western blot检测LC3B-II、Beclin 1、p62表达;通过MDC染色检测自噬体水平;使用CQ处理以评估自噬流;通过TEM观察自噬体超微结构。
验证ZnO NPs是否激活MAPK通路并参与细胞死亡。
通过Western blot检测p38、ERK、JNK及其磷酸化水平;使用SP600125、SB203580、PD98059抑制JNK、p38和ERK,观察对细胞毒性的影响。
验证JNK激活是否通过Bcl-2磷酸化调控自噬诱导。
使用SP600125抑制JNK,检测LC3B-II水平、GFP-LC3 puncta形成、Bcl-2磷酸化水平,并通过免疫沉淀检测Bcl-2/Beclin 1复合物的解离。
探究ZnO NPs阻断自噬流的具体机制,是否由溶酶体功能障碍或融合受阻引起。
使用LysoTracker Red和LysoSensor Green检测溶酶体数量和pH;检测LAMP1、LAMP2、Rab7蛋白表达;使用SP600125抑制JNK后检测p62水平。
验证锌离子和ROS是否参与ZnO NPs诱导的自噬流阻断及正反馈调节。
使用TPEN螯合锌离子,检测MDC染色和p62水平;使用3-MA或SP600125抑制自噬后检测锌离子和ROS水平;使用NAC清除ROS后检测JNK、LC3B和p62水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与药物处理 | 氧化锌纳米颗粒 | Macklin | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Keygen Biotech | -- |
| 胰蛋白酶 | Keygen Biotech | -- | |
| 新生牛血清 | EVERY GREEN | -- | |
| 神经生长因子 | Sigma | -- | |
| 锌离子检测 | TSQ | AAT Bioquest | -- |
| Fluor™Zn-520 | AAT Bioquest | -- | |
| 溶酶体检测 | LysoSensor™ Green DND-189 | Yeasen Biotech | -- |
| LysoTracker Red DND-99 | Yeasen Biotech | -- | |
| 细胞毒性检测 | 碘化丙啶 | Solarbio | -- |
| 细胞核染色 | Hoechst 33258 | Solarbio | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA | Sigma-Aldrich | -- |
| ROS清除 | N-乙酰半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | -- |
| 锌离子螯合 | TPEN | Sigma-Aldrich | -- |
| 自噬体检测 | 单丹磺酰尸胺 | Sigma-Aldrich | -- |
| 铁死亡抑制 | Ferrostatin-1 | Sigma-Aldrich | -- |
| Liproxstatin-1 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Western blot | LC3B抗体 | Sigma-Aldrich | -- |
| 自噬抑制 | 氯喹 | MedChemExpress | -- |
| 凋亡抑制 | Z-VAD-FMK | MedChemExpress | -- |
| 自噬抑制 | 3-甲基腺嘌呤 | Selleckchem | -- |
| 坏死性凋亡抑制 | Necrostatin 1 | Selleckchem | -- |
| Necrosulfonamide | Selleckchem | -- | |
| JNK抑制 | SP600125 | Selleckchem | -- |
| p38抑制 | SB203580 | Selleckchem | -- |
| ERK抑制 | PD98059 | Selleckchem | -- |
| Western blot | p38抗体 | Wanleibio | -- |
| ERK1/2抗体 | Wanleibio | -- | |
| JNK抗体 | Wanleibio | -- | |
| Rab7抗体 | Biosynthesis Biotechnology | -- | |
| p62抗体 | Proteintech | -- | |
| Beclin 1抗体 | Proteintech | -- | |
| Bcl-2抗体 | Proteintech | -- | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | -- | |
| p-ERK抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| p-p38抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| p-JNK抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| p-Bcl-2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| LAMP-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| LAMP-2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Keygen Biotech | -- |
| Western blot | BeyoECL Star | Beyotime Biotechnology | -- |
| 硝酸纤维素膜 | -- | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记的二抗 | -- | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G磁珠 | Bimake | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Bimake | -- |
| 细胞摄取检测 | RNAi-Mate | GenePharma | -- |
| 细胞转染 | GFP-LC3质粒 | -- | -- |
| TEM检测 | 日立-7500透射电子显微镜 | Hitachi | -- |
| 原子吸收光谱 | 原子吸收光谱仪 | Persee | TAS-990 |
| 细胞活力检测 | ELx800酶标仪 | BioTek Instruments | -- |
| 显微镜观察 | 共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| 流式细胞术 | BD FACS Melody™流式细胞仪 | BD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | PC12细胞系(ATCC),培养条件,NGF浓度和分化时间 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and exposure |
| ZnO NPs暴露 | ZnO NPs浓度(15 μg/mL),暴露时间,预处理方式 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and exposure; figure legends |
| 细胞死亡分析 | 细胞活力检测方法(CCK-8),PI染色,抑制剂预处理时间和浓度 阅读提示:Materials and methods: Cell viability, Flow cytometry; Figure 4 legends |
| 自噬流分析 | LC3B, p62, Beclin 1表达检测;MDC染色;CQ处理浓度和时间 阅读提示:Materials and methods: Western blotting, Flow cytometry; Figure 4 legends |
| 信号通路分析 | JNK, ERK, p38磷酸化检测;抑制剂SP600125, SB203580, PD98059浓度和预处理时间 阅读提示:Materials and methods: Western blotting; Figure 5 legends |
| 溶酶体功能检测 | LysoTracker Red和LysoSensor Green染色;LAMP-2表达检测 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry, Western blotting; Figure 7 legends |
| 锌离子和ROS检测 | Fluor™Zn-520探针;DCFH-DA探针;TPEN和NAC处理浓度和时间 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry; Figure 8 legends |