BmTip60的功能鉴定
验证BmTip60是否具有乙酰转移酶活性,并鉴定其表达模式。
通过系统发育分析、蛋白乙酰化检测、组织分布和亚细胞定位预测,以及BmN细胞中过表达BmTip60检测总蛋白乙酰化水平。
Tip60 Phosphorylation at Ser 99 Is Essential for Autophagy Induction in Bombyx mori.
包含体外细胞系(BmN)过表达、突变体功能验证、体内幼虫药物处理、免疫荧光、Western blot等多层级证据,并进行磷酸化位点突变验证。
BmN细胞(家蚕卵巢细胞系) 家蚕幼虫(Dazao品系)脂肪体
饥饿处理:5L3D幼虫禁食24小时 20E注射:10 μg/幼虫,处理24小时 AMPK激活剂二甲双胍:30 μg/幼虫 AMPK抑制剂compound C:5 μg/幼虫 BmTip60 Ser99突变体(S99A和S99D)在BmN细胞中的过表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证BmTip60是否具有乙酰转移酶活性,并鉴定其表达模式。
通过系统发育分析、蛋白乙酰化检测、组织分布和亚细胞定位预测,以及BmN细胞中过表达BmTip60检测总蛋白乙酰化水平。
检测在自噬发生的发育阶段BmTip60蛋白水平及修饰状态。
通过Western blot检测脂肪体中BmTip60、BmAtg8-PE和BmSqstm1的水平,并用免疫荧光观察BmTip60的分布和密度。
探究饥饿和20E是否影响BmTip60蛋白水平。
对5L3D幼虫进行饥饿处理或注射20E,检测BmTip60蛋白水平、自噬标志物和BmE75a mRNA。
验证AMPK信号是否介导BmTip60蛋白迁移(磷酸化)。
通过注射AMPK激活剂二甲双胍或抑制剂compound C,检测BmTip60上移条带的变化;并用λ-磷酸酶处理验证上移条带为磷酸化形式。
验证BmTip60 Ser99磷酸化对自噬的诱导是否必需。
构建BmTip60的S99A和S99D突变体,在BmN细胞中过表达,检测磷酸化水平、自噬标志物及EGFP-BmAtg8 puncta形成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Grace昆虫培养基 | Sigma-Aldrich | G9771 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10100-147 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Vazyme | R401-01 |
| 反转录 | M-MLV逆转录试剂 | Takara | 639522 |
| 质粒构建 | Nco I限制酶 | NEB | R3193 |
| Kpn I限制酶 | NEB | R3142 | |
| 细胞转染 | FuGENE HD转染试剂 | Promega | E2311 |
| 细胞培养 | 12孔板 | Guangzhou Jet Bio-Filtration Co., Ltd. | TCP-010-006 |
| 药物处理 | 20-羟基蜕皮酮 | Sigma-Aldrich | H5142 |
| Compound C | Sigma-Aldrich | P5499 | |
| 免疫沉淀 | NP-40裂解液 | Beyotime Biotechnology Co., Ltd. | P0013F |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | ThermoFisher Scientific | 78429 | |
| V5抗体 | Abcam | ab27671 | |
| 琼脂糖珠 | Thermo Fisher Scientific | 20421 | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology Co., Ltd. | P0013B |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology Co., Ltd. | P0012 |
| Western blot | BmTip60抗体 | Bioss | bs-13686R |
| 泛磷酸丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸抗体 | Abcam | ab15556 | |
| 微管蛋白抗体 | Beyotime Biotechnology Co., Ltd. | AT819 | |
| 成像 | Tanon-5200成像仪 | Tanon | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime Biotechnology Co., Ltd. | P0096 |
| Alexa Fluor-488偶联二抗 | Thermo Fisher Scientific | A11008 | |
| DAPI | Beyotime Biotechnology Co., Ltd. | C1006 | |
| Olympus FV300显微镜 | Olympus | -- | |
| LysoTracker染色 | LysoTracker Red DND-99 | Thermo Fisher Scientific | L7528 |
| FV3000共聚焦显微镜 | Olympus | -- | |
| 磷酸酶处理 | λ-磷酸酶 | Sigma-Aldrich | P9614 |
| 定点突变 | Taq DNA聚合酶 | Takara | R10T1 |
| DpnI限制酶 | NEB | R0176 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物饲养与细胞培养 | 家蚕品系为Dazao,饲养于25°C、14小时光照/10小时黑暗;BmN细胞培养基为Grace's insect medium(含10%热灭活胎牛血清)。 阅读提示:Materials and Methods 4.1 Silkworms and Cells |
| 饥饿与20E处理 | 5L3D幼虫饥饿处理24小时;20E注射剂量10 μg/幼虫,处理24小时;每组10只,三次生物学重复。 阅读提示:Materials and Methods 4.3 Starvation and 20E Treatment |
| AMPK药物处理 | 二甲双胍注射剂量30 μg/幼虫,注射至5L3D;compound C注射剂量5 μg/幼虫,注射至IW前12小时;处理24小时;每组10只,三次生物学重复。 阅读提示:Materials and Methods 4.4 Chemical Treatments |
| 细胞转染 | BmN细胞在12孔板中培养24小时后,转染1 μg质粒,转染48小时;转染试剂FuGENE HD。 阅读提示:Materials and Methods 4.2 Plasmid Construction and Transfection |
| 磷酸化检测 | BmTip60点突变:S99A和S99D,在BmN细胞中过表达48小时,免疫沉淀后用泛磷酸化抗体检测;λ-磷酸酶处理脂肪体总蛋白。 阅读提示:Materials and Methods 4.5, 4.8, 4.9 |