体外PPARγ结合与反式激活实验
评估YR4-42对PPARγ的结合亲和力和反式激活能力,并与其他PPARγ激动剂比较。
使用LanthaScreen竞争性结合实验检测YR4-42与PPARγ的结合亲和力;使用基于细胞的报告基因实验检测PPARγ、PPARα和PPARδ的反式激活活性。
A novel specific peroxisome proliferator-activated receptor γ (PPARγ) modulator YR4-42 ameliorates hyperglycaemia and dyslipidaemia and hepatic steatosis in diet-induced obese mice.
包含体外生化与细胞实验(结合、反式激活、共激活因子招募)、细胞功能实验(脂肪生成、葡萄糖消耗、磷酸化)、体内动物模型(DIO小鼠)及基因表达分析,多层级验证。
3T3-L1脂肪细胞 高脂饮食诱导肥胖(DIO)C57BL/6J小鼠 293E细胞(用于报告基因实验) 中国仓鼠卵巢细胞(用于突变体反式激活实验)
PPARγ结合亲和力Ki值:YR4-42为5744 nmol/L,罗格列酮38 nmol/L,吡格列酮860 nmol/L 3T3-L1脂肪细胞分化:10 μmol/L化合物处理7天(分化期)或2天(成熟细胞) TNFα诱导的PPARγ Ser273磷酸化:10 μmol/L化合物预孵育45分钟,50 ng/mL TNFα处理30分钟 DIO小鼠给药:YR4-42(50 mg/kg)和吡格列酮(25 mg/kg)口服灌胃,每天一次,持续38天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估YR4-42对PPARγ的结合亲和力和反式激活能力,并与其他PPARγ激动剂比较。
使用LanthaScreen竞争性结合实验检测YR4-42与PPARγ的结合亲和力;使用基于细胞的报告基因实验检测PPARγ、PPARα和PPARδ的反式激活活性。
评估YR4-42是否通过招募PPARγ共激活因子(TRAP220和PGC1α)来激活PPARγ。
使用LanthaScreen TR-FRET PPARγ共激活因子实验检测YR4-42诱导TRAP220和PGC1α与PPARγ相互作用的能力。
评估YR4-42对脂肪生成、葡萄糖消耗以及PPARγ Ser273磷酸化的影响。
在3T3-L1细胞分化过程中或成熟脂肪细胞中处理化合物,通过油红O染色和细胞内甘油三酯测定评估脂肪生成;通过葡萄糖氧化酶法评估葡萄糖消耗;通过Western blot检测PPARγ Ser273磷酸化。
评估YR4-42对高脂饮食诱导肥胖小鼠的血糖、血脂和肝脏脂肪变性的影响,并与吡格列酮比较。
DIO-C57BL/6J小鼠随机分为三组,分别口服0.5% CMC-Na(载体)、吡格列酮(25 mg/kg)和YR4-42(50 mg/kg)38天,期间监测体重、血糖、血脂,并进行胰岛素耐量试验,结束时检测血浆和肝脏生化指标。
评估YR4-42对肌肉、脂肪组织和肝脏中PPARγ靶基因表达的影响,以揭示其作用机制。
收集小鼠组织(肌肉、棕色脂肪组织、肝脏),通过实时PCR检测与葡萄糖和脂质代谢相关的基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| PPAR结合实验 | LanthaScreen PPARα/γ/δ竞争性结合分析试剂盒 | Life Technologies | PV4894 |
| PPAR共激活因子实验 | PPARγ共激活因子分析试剂盒 | Life Technologies | PV4548 |
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤 | -- | -- | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| Western blot | 抗PPARγ抗体 | Cell Signaling Technology | #2435 |
| 抗磷酸化PPARγ(Ser273)抗体 | Bioss | bs-4888R | |
| 抗β肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 辣根过氧化物酶偶联二抗 | ZSGB-BIO | -- | |
| 实时荧光定量PCR | SYBR Premix Ex Taq II | TaKaRa Bio | -- |
| 脂质测定 | 血浆甘油三酯和总胆固醇试剂盒 | BioSino | -- |
| 游离脂肪酸检测试剂盒 | Sekisui Medical | -- | |
| 细胞内甘油三酯测定 | Applygen试剂盒 | Applygen | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Applygen | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Life Technologies | -- |
| 双荧光素酶检测 | 萤火虫和海肾荧光素酶底物 | Vigorous | -- |
| 动物实验 | 高脂饮食(60%热量来自脂肪) | Research Diets | -- |
| 标准饲料 | Research Diets | -- | |
| 0.5%羧甲基纤维素钠 | -- | -- | |
| 分子模拟 | Discovery Studio 2017 | BIOVIA | -- |
| 戴尔Precision T5500工作站 | DELL | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PPARγ结合与反式激活实验 | 结合实验采用LanthaScreen竞争性结合试剂盒(PV4894),浓度范围10 pmol/L至1 mmol/L;反式激活实验使用293E细胞共转染质粒,化合物浓度范围10 nmol/L至50 μmol/L。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.5节及图1C |
| 脂肪细胞分化与功能实验 | 3T3-L1细胞分化:使用含1.0 μM地塞米松、0.5 mM IBMX、10 μg/mL胰岛素的分化诱导培养基处理2天,随后维持培养基(含10 μg/mL胰岛素)培养10天;脂肪生成实验化合物浓度10 μmol/L处理7天;成熟脂肪细胞处理2天;葡萄糖消耗实验:10 μmol/L化合物处理24小时。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.4节及图2A-E |
| PPARγ Ser273磷酸化检测 | 成熟3T3-L1脂肪细胞用10 μmol/L化合物预孵育45分钟,后加50 ng/mL TNFα处理30分钟,收集细胞裂解,Western blot检测PPARγ和pPPARγ Ser273。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.4节及图2F |
| 体内药效实验 | DIO小鼠随机分为三组(n=12/组):载体(0.5% CMC-Na)、吡格列酮(25 mg/kg)和YR4-42(50 mg/kg),口服灌胃,持续38天;高脂饮食持续提供。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.7节及图3 |
| 基因表达分析 | 小鼠肌肉、棕色脂肪组织和肝脏中基因表达通过实时PCR测定,样本量n=4-6;引物序列见补充信息3。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.4和2.7节、图4及Supplementary Information 3 |