体外细胞系筛选与增殖反应评估
比较不同转移潜能的SCC细胞系对IL-22和CSA的增殖反应,以确定最易受影响的肿瘤阶段。
对五种SCC细胞系(A431、T1、T8、MET1、MET4)进行血清饥饿同步后,用10%FBS或IL-22处理,计数并比较增殖;在完全培养基中用CSA、IL-22及联合处理24小时,评估增殖变化。
Ruxolitinib inhibits cyclosporine-induced proliferation of cutaneous squamous cell carcinoma.
包含体外细胞增殖和信号通路实验、体内异种移植模型、患者组织基因表达分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
A431人皮肤鳞状细胞癌细胞系 T1、T8、MET1、MET4皮肤鳞状细胞癌细胞系 A431异种移植裸鼠模型 器官移植受者皮肤鳞状细胞癌患者样本
IL-22处理浓度100 ng/ml,CSA处理浓度50 ng/ml,处理时间24小时 裸鼠A431细胞皮内接种2×10^4个细胞,随机分组,CSA剂量20 mg/kg每日,IL-22剂量4 μg/天每周5天 鲁索替尼高剂量100 mg/kg/d,低剂量10 mg/kg/d,口服灌胃,与CSA联用 肿瘤体积测量和PCNA免疫组化评估增殖 NanoString和微阵列分析患者样本中的基因表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较不同转移潜能的SCC细胞系对IL-22和CSA的增殖反应,以确定最易受影响的肿瘤阶段。
对五种SCC细胞系(A431、T1、T8、MET1、MET4)进行血清饥饿同步后,用10%FBS或IL-22处理,计数并比较增殖;在完全培养基中用CSA、IL-22及联合处理24小时,评估增殖变化。
阐明IL-22促进SCC增殖的下游信号机制。
A431细胞经IL-22处理后,在不同时间点检测STAT3磷酸化水平和细胞计数;通过qPCR检测JAK1、STAT1、STAT3等下游基因表达。
验证细胞系发现是否在患者肿瘤中重现,并评估JAK/STAT表达与临床特征的相关性。
对45个FFPE样本(正常、浅表SCC、浸润性SCC、PNI SCC、OTR SCC)进行NanoString基因表达分析,比较IL-22和JAK/STAT相关基因表达;对另外的微阵列数据(8个SCC、5个TSCC、10个正常)进行分析,并利用STRING数据库进行功能富集。
验证CSA和IL-22在体内对肿瘤生长的影响,并评估鲁索替尼的抑制作用。
将A431细胞接种于裸鼠,随机分组,分别用IL-22、CSA、IL-22+CSA或溶剂处理,测量肿瘤体积;另一实验分组用CSA、高/低剂量鲁索替尼、联合或不联合CSA处理,并检测肿瘤增殖标志物PCNA和信号蛋白表达。
测试鲁索替尼及STAT1/STAT3抑制剂对SCC细胞增殖的抑制作用,并验证其是否能逆转CSA的促增殖效应。
A431细胞用鲁索替尼梯度浓度处理,测定增殖;用鲁索替尼±CSA处理,检测蛋白表达;用STAT1抑制剂S14-95和STAT3抑制剂HO-3867单独或联合处理,±CSA,计数细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | 文中未明确说明 | -- |
| 胎牛血清 | 文中未明确说明 | -- | |
| DermaLife K细胞培养基 | Lifeline Cell Technology | -- | |
| 药物处理 | 环孢素A | MilliporeSigma | -- |
| 白介素-22 | R&D Systems | -- | |
| 鲁索替尼 | MedChemExpress | -- | |
| STAT1α特异性抑制剂S14-95 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| STAT3抑制剂HO-3867 | MedChemExpress | -- | |
| 细胞增殖检测 | 台盼蓝 | 文中未明确说明 | -- |
| 细胞计数 | Countess自动细胞计数器 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | RLT裂解缓冲液 | Qiagen | -- |
| RNeasy微型试剂盒 | Qiagen | -- | |
| TRIzol试剂 | Invitrogen | -- | |
| RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | -- | |
| RNA定量 | NanoDrop 2000C紫外分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| GeneQuant Pro RNA/DNA计算器 | Pharmacia | -- | |
| qPCR | SuperScript III Platinum SYBR Green一步法qRT-PCR试剂盒 | Invitrogen | -- |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | 文中未明确说明 | -- |
| M-PER哺乳动物蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DC蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| STAT3抗体 | CST | 9139S | |
| 磷酸化STAT3(Ser727)抗体 | CST | 9134S | |
| 磷酸化STAT3(Tyr705)抗体 | CST | 9145S | |
| STAT1抗体 | CST | 14994S | |
| 磷酸化STAT1抗体 | Thermo Fisher Scientific | 44-382G | |
| IL-22RA抗体 | Bioss Inc. | bs-2624R | |
| GAPDH抗体 | CST | 2118S | |
| β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab119716 | |
| Pierce ECL底物蛋白质印迹检测系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Opti-C4N底物试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| RNA提取(FFPE) | Agencourt FormaPure试剂盒 | Beckman Coulter | -- |
| RNA质量评估 | Agilent 2200 TapeStation生物分析仪 | Agilent | -- |
| 基因表达分析 | nCounter分析系统 | NanoString Technologies | -- |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| IL-22(小鼠) | GenScript | Z03243-1 | |
| 环孢素A(小鼠) | Perrigo | -- | |
| 免疫组织化学 | PCNA抗体 | Abcam | PC10 |
| 生物素化兔抗小鼠二抗 | Vector Laboratories | PK6102 | |
| 抗兔二抗 | Vector Laboratories | PK6101 | |
| 亲和素-生物素过氧化物酶复合物 | Vector Laboratories | -- | |
| 微阵列分析 | Affymetrix人类基因组U95A GeneChip | Affymetrix Inc. | -- |
| HP GeneArray扫描仪 | Hewlett-Packard Company | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和处理 | 细胞系来源和培养条件(培养基、血清浓度、CO2和温度);IL-22和CSA的处理浓度及时间;血清饥饿的持续时间。 阅读提示:Methods中'Cell lines and culture'和'Proliferation assay'部分 |
| 体外增殖实验 | 血清饥饿时间、处理浓度(IL-22 100 ng/ml, CSA 50 ng/ml)、处理时间(24小时)、细胞计数方法。 阅读提示:Methods中'Proliferation assay'部分及Figure 1和图注 |
| 信号通路分析 | IL-22处理时间点(15、30、60分钟)和浓度;Western blot抗体(STAT3, p-STAT3, STAT1, p-STAT1, IL-22RA);qPCR引物序列和归一化基因(GAPDH、β-actin)。 阅读提示:Methods中'Western blots'和'qPCR'部分,以及Figure 1D、1E |
| 患者样本分析 | 样本类型(FFPE或新鲜组织)、样本量(n值)、诊断分组标准(BWH分期)、基因集(IL-22/JAK/STAT相关基因)和数据分析方法(NanoString nSolver、limma、STRING)。 阅读提示:Methods中'FFPE samples'、'RNA extraction from FFPE'、'NanoString analysis'和'Microarray analysis'部分 |
| 动物实验 | 小鼠品系(裸鼠)、年龄和性别;细胞接种数量(2×10^4)和方式(皮内注射);处理分组和剂量(CSA 20 mg/kg, IL-22 4 μg/天,鲁索替尼高剂量100 mg/kg/d、低剂量10 mg/kg/d);给药方式(i.p.或口服);处理时间(从第7天开始);肿瘤体积测量方法。 阅读提示:Methods中'Murine studies'部分,以及Figure 3和7的图注 |
| 免疫组化 | 抗体和稀释倍数(PCNA、IL-22RA 1:100);抗原修复条件(Tris base pH9, 100°C, 30分钟);封片及显色步骤。 阅读提示:Methods中'Immunohistochemistry'部分 |