MBP肽的内化与定位分析
验证合成的致痛性MBP肽能否与施万细胞表面结合并内化
使用荧光标记的MBP80-99肽(FITC/TMR)孵育原代大鼠施万细胞,通过荧光显微镜观察其定位;用未标记肽竞争实验验证特异性;构建MBP-WT-mCherry和MBP-H89G-mCherry表达载体并观察突变对突起定位的影响
Amino acid sequence conservation of the algesic fragment of myelin basic protein is required for its interaction with CDK5 and function in pain.
研究包含体外施万细胞培养、免疫共沉淀、磷酸化实验、动物行为学测试及组织学分析等多个独立证据层级,并进行了机制验证。
大鼠原代施万细胞 大鼠坐骨神经损伤模型 大鼠坐骨神经内注射髓鞘碱性蛋白肽模型
MBP84-104肽段的序列保守性(H89G突变)对CDK5结合及致痛作用的影响 CDK5/p25对MBP84-104肽段中Thr96和Thr99的磷酸化 Roscovitine处理对MBP肽-CDK5共定位的影响 大鼠坐骨神经内注射MBP肽(60 μg溶于5 μl PBS)后机械性异常性疼痛的von Frey测试
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证合成的致痛性MBP肽能否与施万细胞表面结合并内化
使用荧光标记的MBP80-99肽(FITC/TMR)孵育原代大鼠施万细胞,通过荧光显微镜观察其定位;用未标记肽竞争实验验证特异性;构建MBP-WT-mCherry和MBP-H89G-mCherry表达载体并观察突变对突起定位的影响
确定MBP-WT-mCherry表达激活的信号通路
对表达MBP-WT-mCherry的施万细胞和对照进行RNA-seq,鉴定差异表达基因和上游调控通路,并与体内注射MBP84-104肽后的基因表达数据比较
找出与MBP片段结合的细胞内蛋白
用mCherry抗体免疫沉淀MBP-WT-mCherry复合物,通过质谱鉴定共纯化蛋白,并用免疫印迹验证CDK5的结合;比较WT和H89G突变体的结合差异
验证CDK5与MBP在细胞内的共定位
共表达MBP-WT-mCherry和CDK5-ZsGreen1,用共聚焦显微镜分析共定位;另外用外源性TMR标记MBP80-99处理表达CDK5-ZsGreen1的细胞观察共定位
验证CDK5/p25能否磷酸化MBP84-104肽段
将MBP84-104-WT、H89G、SCR、pT96、pT99肽与纯化的CDK5/p25共孵育,检测γ-33P掺入;测定ATP向ADP转化以评估激酶活性
验证CDK5抑制剂能否破坏MBP-CDK5相互作用
对共表达MBP-WT-mCherry和CDK5-ZsGreen1的施万细胞用roscovitine处理,观察荧光定位变化
验证MBP序列突变对致痛作用的影响
将MBP84-104-WT、-SCR、-H89G、-T96A/T99A肽注射入大鼠坐骨神经,进行von Frey测试评估机械性异常性疼痛,并检测DRG中Il-6和Atf3表达
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫沉淀 | mCherry抗体 | Abcam | ab183628 |
| 免疫印迹 | 抗CDK5抗体 | Cell Signaling Technologies | 12134 |
| 抗CDK5抗体 | Bioss Antibody | bs-0559R | |
| 神经免疫染色 | 抗层粘连蛋白抗体 | Sigma | L9393 |
| 免疫组织化学 | 抗IL-6抗体 | R&D Systems | AF506 |
| 抗ATF3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-188 | |
| 抗降解MBP抗体 | Millipore | AB5864 | |
| 免疫印迹 | MBP抗体 | Biolegend | 808401 |
| 药物处理 | Roscovitine | Cayman Chemical | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Primocin | Invivogen | -- | |
| 多聚-D-赖氨酸 | EMD Millipore | -- | |
| 毛喉素 | EMD Millipore | -- | |
| 阿糖胞苷 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 转染筛选 | 杀稻瘟菌素S | Invivogen | -- |
| RNA-seq | TRI试剂 | Zymo Research | -- |
| Direct-zol microRNA系统 | Zymo Research | -- | |
| ND-1000分光光度计 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| NEBNext Poly(A) mRNA磁分离模块 | New England Biolabs | -- | |
| NEBNext rRNA去除试剂 | New England Biolabs | -- | |
| NEBNext Ultra Directional II RNA文库制备试剂盒 | New England Biolabs | -- | |
| High Output v2试剂盒 | Illumina | -- | |
| NextSeq 500 DNA测序仪 | Illumina | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白G磁珠 | -- | -- |
| Complete Ultra蛋白酶抑制剂 | Roche | -- | |
| 质谱分析 | 胰蛋白酶 | Promega | -- |
| LTQ-Orbitrap XL质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫印迹 | NuPAGE 4-12% Bis-Tris蛋白凝胶 | Life Technologies | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| SuperSignal West Dura底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ChemiDoc XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫细胞化学 | Prolong Gold封片剂 | Life Technologies | -- |
| 磷酸化实验 | [γ-33P] ATP | Perkin Elmer | -- |
| multiscreen磷酸纤维素P81板 | EMD Millipore | -- | |
| ATP水解实验 | 通用荧光激酶检测系统 | Sigma | -- |
| 动物实验 | Hamilton微量注射器 | -- | -- |
| Beuthanasia IP | Schering-Plough Animal Health | -- | |
| 神经免疫染色 | Alexa 488标记二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Alexa 594标记二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 施万细胞分离自出生1-3天的Sprague-Dawley大鼠;培养条件(DMEM, 10% FBS, 100 μg/ml primocin, 21 μg/ml牛垂体提取物, 4 μM Forskolin);转染使用1 μg DNA和Lipofectamine 3000 阅读提示:Methods: Cell culture, Transfection of Schwann cells |
| 免疫沉淀与质谱 | 细胞裂解缓冲液(20 mM Tris-HCl pH8.0, 150 mM NaCl, 1% Triton X100, 2 mM EDTA);mCherry抗体10 μg孵育16小时;蛋白G磁珠 阅读提示:Methods: Immunoprecipitation, Mass spectroscopy |
| 磷酸化实验 | CDK5/p25复合物浓度10 nM,底物肽500 μM,[γ-33P] ATP 1.25 nmol,反应30分钟 阅读提示:Methods: Protein phosphorylation assays, ATP hydrolysis assay |
| 动物行为测试 | 雌性SD大鼠(8-10周龄,200-225g);肽注射剂量60 μg/5 μl PBS;von Frey测试使用up-and-down方法;测试天数1-7天 阅读提示:Methods: Animal models, Von Frey test |
| RT-PCR | RNA提取用TRIzol,cDNA合成用SuperScript kit;qPCR使用Taqman探针,检测Il-6和Atf3,内参GAPDH 阅读提示:Methods: RT-PCR, Figure 7 |