GX1受体检测与迁移抑制验证
检测GX1受体在共培养内皮细胞中的表达,并验证GX1对迁移的抑制作用
使用生物素标记的GX1通过Western blot检测受体表达,通过细胞免疫荧光观察受体定位;通过伤口愈合和Transwell实验检测GX1对共培养内皮细胞迁移的影响。
Novel peptide GX1 inhibits angiogenesis by specifically binding to transglutaminase-2 in the tumorous endothelial cells of gastric cancer.
包含体外共培养细胞模型、患者组织芯片、蛋白质组学鉴定、功能实验(增殖、迁移、凋亡)及机制验证(GTP结合活性、下游通路),多层独立证据支持结论。
共培养人脐静脉内皮细胞(co-HUVECs) 胃癌组织芯片(90例)
GX1受体鉴定:co-IP结合质谱分析,TGM2作为候选受体 TGM2表达与共定位:Western blot、免疫荧光、免疫组化验证 TGM2功能验证:siRNA敲低后检测增殖、迁移、凋亡变化 GX1机制验证:GTP结合活性、NF-κB和HIF1α表达 临床相关性:TGM2高表达与胃癌患者预后不良相关
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测GX1受体在共培养内皮细胞中的表达,并验证GX1对迁移的抑制作用
使用生物素标记的GX1通过Western blot检测受体表达,通过细胞免疫荧光观察受体定位;通过伤口愈合和Transwell实验检测GX1对共培养内皮细胞迁移的影响。
通过蛋白质组学方法鉴定GX1的特异性结合蛋白
利用co-IP富集GX1结合蛋白,经SDS-PAGE和Coomassie蓝染色分离,质谱分析鉴定候选蛋白,并通过Western blot验证TGM2与GX1的特异性结合。
验证TGM2在胃癌血管内皮细胞中的表达及与GX1受体的共定位
通过Western blot检测不同细胞系中TGM2表达,通过免疫荧光和免疫组化检测细胞和组织中GX1受体与TGM2的共定位。
评估TGM2表达与胃癌患者临床病理参数及预后的关系
使用胃癌组织芯片进行免疫组化染色,分析TGM2表达与临床参数的相关性,并通过Kaplan-Meier生存分析评估预后意义。
验证TGM2对共培养内皮细胞增殖、迁移和凋亡的影响
使用siRNA敲低TGM2,通过CCK-8、伤口愈合、Transwell和流式细胞术检测细胞功能变化。
验证GX1对凋亡和迁移的抑制效应是否依赖于TGM2
在TGM2敲低后,检测GX1对凋亡和迁移的影响是否减弱或逆转。
探索GX1影响TGM2功能的分子机制
检测GX1对TGM2总蛋白、膜定位、GTP结合活性及下游NF-κB和HIF1α表达的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞基质 | ScienCell Research Laboratories | 1001 |
| 胎牛血清 | ScienCell Research Laboratories | 0025 | |
| 内皮细胞生长补充剂 | ScienCell Research Laboratories | 1052 | |
| 青霉素/链霉素溶液 | ScienCell Research Laboratories | 0503 | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | 11875119 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099-141 | |
| 青霉素/链霉素溶液 | HyClone | SV30010 | |
| 肽合成 | GX1肽 | GL Biochem | CGNSNPKSC |
| URP肽 | GL Biochem | CNKSPSGNC | |
| 免疫共沉淀 | M-280链霉亲和素磁珠 | Invitrogen | 11205D |
| RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B | |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | 04693159001 | |
| 蛋白提取与免疫印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 | |
| 硝酸纤维素膜 | GE Amersham Protran | 10600001 | |
| ECL化学发光试剂 | Thermo Fisher Scientific | 34094 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A1978 | |
| TGM2抗体 | RD | AF4376 | |
| Caveolin-1抗体 | ImmunoWay | YT0686 | |
| NF-κB抗体 | ImmunoWay | YT3108 | |
| HIF1α抗体 | Millipore | MAB5382 | |
| 辣根过氧化物酶标记链霉亲和素 | Bioss | bs-0437P-HRP | |
| 过氧化物酶标记山羊抗小鼠IgG | ZSGB-BIO | ZB-5305 | |
| 过氧化物酶标记山羊抗兔IgG | ZSGB-BIO | ZB-2301 | |
| 绵羊IgG辣根过氧化物酶标记抗体 | RD | HAF016 | |
| 质谱分析 | Q-Exactive质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | DOJINDO | CK04 |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | 556547 |
| 免疫荧光 | 磷酸盐缓冲液 | HyClone | AC12557265 |
| 抗TGM2抗体 | Abcam | ab2386 | |
| 荧光素标记山羊抗小鼠IgG | ZSGB-BIO | ZB-0312 | |
| Cy5标记链霉亲和素 | BioLegend | 405205 | |
| DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚) | Bioworld | BS5010 | |
| Vybrant DiD细胞标记液 | Invitrogen | V22889C | |
| 免疫组化 | 胃癌组织芯片 | SOBC | HStmA180Su09 |
| CD31抗体 | Abcam | ab28364 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| RNA提取与PCR | TaKaRa MiniBEST通用RNA提取试剂盒 | TaKaRa | 9767 |
| PrimeScript RT试剂盒 | TaKaRa | RR036A | |
| SYBR Premix Ex Taq II | TaKaRa | RR820A | |
| 细胞迁移实验 | Transwell板 | Corning | -- |
| 培养插入2孔 | ibdi | 80206 | |
| 免疫电镜 | 兔抗TGM2抗体 | Abcam | ab109200 |
| 1.4 nm金颗粒标记抗兔IgG | Nanoprobes | -- | |
| HQ银增强试剂盒 | Nanoprobes | -- | |
| 超薄切片机(Leica EM UC6) | Leica | -- | |
| 钻石刀 | Diatome | -- | |
| JEM-1230电子显微镜 | JEOL LTD | -- | |
| GTP结合实验 | GTP-琼脂糖珠 | Sigma-Aldrich | G9768 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基组成、共培养模型构建条件(SGC-7901浓度、TCM制备) 阅读提示:Materials and methods: Cell lines and cell culture |
| GX1受体鉴定 | co-IP实验步骤、生物素标记肽浓度、磁珠类型、质谱分析条件 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation, Mass spectrum analysis |
| 功能实验 | GX1处理浓度(0.1 mg/ml)和时间(24或48小时)、细胞密度、检测时间点 阅读提示:Materials and methods: Cell Counting Kit-8 test, Flow cytometry, In vitro cell migration assay |
| TGM2敲低 | siRNA序列、转染试剂、敲低效率验证 阅读提示:Materials and methods: Transfection of co-HUVECs with siRNAs |
| 机制实验 | GTP结合测定条件、GX1处理时间、检测下游分子的方法 阅读提示:Materials and methods: TGM2 GTP binding assay, RNA extraction and real-time PCR, Protein extraction and Western blotting |