患者样本收集和临床病理特征分析
收集胃癌组织样本,获取患者临床病理参数和随访数据。
收集120例胃癌组织样本,记录年龄、性别、肿瘤位置、分化、浸润深度、淋巴结转移、远处转移和TNM分期,并进行随访。
Positive prognostic value of HER2-HER3 co-expression and p-mTOR in gastric cancer patients.
包含120例胃癌组织样本的IHC和qRT-PCR检测,以及针对HER3、HER2-HER3、mTOR等的荟萃分析,但缺乏体内或体外功能验证。
胃癌组织样本(120例) 荟萃分析队列(包含多项胃癌研究)
120例胃癌组织样本,来自安徽医科大学第一附属医院2010-2011年接受全胃或部分胃切除术的患者,无术前化疗或放疗 IHC染色评分标准:HER2和HER3按0-3+评分,2+和3+视为阳性;mTOR和p-mTOR按Histo评分,>2为阳性 qRT-PCR引物序列(表1) 荟萃分析纳入标准:IHC评估蛋白表达,提供临床病理参数和OS信息
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集胃癌组织样本,获取患者临床病理参数和随访数据。
收集120例胃癌组织样本,记录年龄、性别、肿瘤位置、分化、浸润深度、淋巴结转移、远处转移和TNM分期,并进行随访。
检测胃癌组织中HER2, HER3, Akt, p-Akt, mTOR, p-mTOR的表达水平。
对组织切片进行IHC染色,使用特定抗体,评估染色结果并评分。
验证HER2, HER3, Akt, mTOR在胃癌、癌旁和正常组织中的mRNA表达差异。
提取总RNA,逆转录为cDNA,进行qRT-PCR扩增,以β-actin为内参,用2-ΔCt法分析。
评估HER蛋白和通路蛋白表达与总生存期的关系。
使用Kaplan-Meier方法生成生存曲线,log-rank检验比较差异,Cox回归进行单因素和多因素分析。
综合评估HER3, Akt, p-Akt, mTOR, p-mTOR表达与临床病理参数和OS的关联。
检索PubMed, Ovid, Web of Science, Cochrane数据库,筛选符合标准的研究,提取数据,使用STATA 11.0进行统计分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | HER2抗体 | Bioss | bs-0125R |
| HER3抗体 | Bioss | bs-1454R | |
| Akt抗体 | Abcam | Y89 | |
| p-Akt抗体 | Abcam | EP2109 | |
| mTOR抗体 | Abcam | Y391 | |
| p-mTOR抗体 | Abcam | EPR426(2) | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript逆转录酶 | Takara | -- | |
| SYBR Green混合液 | Takara Bio | -- | |
| 统计分析 | SPSS 16.0 | SPSS Inc. | -- |
| 荟萃分析 | STATA 11.0 | StataCorp LP | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本 | 120例胃癌组织样本,来自安徽医科大学第一附属医院,2010-2011年,接受全胃或部分胃切除术,无术前放化疗。 阅读提示:Methods中'Patients and samples'部分 |
| 免疫组化 | 抗体种类、稀释度、品牌和货号;染色评分标准。 阅读提示:Methods中'Immunohistochemistry'和'Evaluation of immunohistochemistry'部分 |
| qRT-PCR | 引物序列,内参基因(β-actin),分析方法(2-ΔCt法)。 阅读提示:Methods中'Quantitative reverse transcription-PCR'部分和表1 |
| 生存分析 | 统计方法,如Kaplan-Meier、log-rank检验、Cox回归。 阅读提示:Methods中'Statistical analysis'部分 |
| 荟萃分析 | 检索数据库、检索式、纳入和排除标准、提取数据项、统计模型选择标准。 阅读提示:Methods中'Meta-analysis'部分 |