构建ASPH野生型及突变体并验证活性
验证ASPH野生型与羟化酶突变体(H679A)的酶活性差异,为后续功能研究提供基础。
构建ASPH野生型(WT)和酶活性突变体(H679A)并转染至HCC细胞系(MHCC-97L、EHBC-512、Huh-7),通过体外Asp β-羟化酶活性实验检测α-KG消耗。
Hydroxylase Activity of ASPH Promotes Hepatocellular Carcinoma Metastasis Through Epithelial-to-Mesenchymal Transition Pathway.
包含体外细胞迁移/粘附实验、酶活性检测、动物肝内及肺转移模型、临床队列预后分析等多层级证据,并进行机制验证。
Huh-7人肝癌细胞系 MHCC-97L人肝癌细胞系 BALB/c裸鼠肝内和肺转移模型 HCC患者训练队列(n=213)和验证队列(n=103)
野生型ASPH与羟化酶突变体H679A的差异效应 羟化酶抑制剂DIPY(1 μM)和DMOG(100 nM)的使用 FE1抗体对ASPH羟化酶活性的中和作用及浓度(100 μg/ml) 裸鼠模型中每组的动物数量(n=25) 临床样本中FE1免疫组化染色强度评分标准(<10% vs >10%)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ASPH野生型与羟化酶突变体(H679A)的酶活性差异,为后续功能研究提供基础。
构建ASPH野生型(WT)和酶活性突变体(H679A)并转染至HCC细胞系(MHCC-97L、EHBC-512、Huh-7),通过体外Asp β-羟化酶活性实验检测α-KG消耗。
确定ASPH羟化酶活性是否影响HCC细胞的迁移和粘附能力。
通过transwell实验和细胞粘附实验检测过表达WT或H679A的HCC细胞迁移和粘附能力,并使用羟化酶抑制剂(DIPY、DMOG)和shRNA敲低ASP进一步验证。
验证特异性抗体FE1能否阻断ASPH羟化酶活性并抑制细胞迁移。
制备特异性识别ASPH催化结构域的FE1抗体,检测其对酶活性的中和作用及对细胞迁移的影响。
研究ASPH羟化酶活性是否诱导EMT相关基因和蛋白表达变化。
通过PCR阵列和实时PCR检测EMT相关基因表达,并通过免疫印迹和免疫染色检测蛋白水平变化。
识别ASPH直接相互作用的下游分子,并验证波形蛋白是否介导ASPH促迁移作用。
通过pull-down和质谱鉴定与ASPH相互作用的蛋白,用免疫共沉淀验证内源相互作用,并通过互补实验评估波形蛋白的功能。
在动物模型中验证ASPH羟化酶活性是否促进HCC的肝内和远处转移。
建立原位肝内和皮下肺转移裸鼠模型,注射过表达WT、H679A或敲低ASPH的HCC细胞,统计转移发生率及转移结节数。
评估肿瘤组织ASPH羟化酶活性与HCC患者术后预后的关系。
使用FE1抗体对训练队列(n=213)和验证队列(n=103)的HCC组织芯片进行免疫组化染色,根据染色强度分组,并分析其与复发和生存的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 分子克隆和突变 | 体外诱变系统 | Promega | -- |
| 分子克隆 | pFLAG-CMV载体 | Sigma | -- |
| pCMV-HA载体 | Clontech | -- | |
| 免疫印迹 | 抗ASPH抗体 | Proteintech | -- |
| 抗GFP标签抗体 | Abmart | M20004 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Abmart | M25063 | |
| 抗myc抗体 | Santa Cruz | sc-40 | |
| 抗E-钙黏蛋白抗体 | BD Biosciences | 610404 | |
| 抗α-连环蛋白抗体 | Cell Signalling | 2131 | |
| 抗γ-连环蛋白抗体 | Cell Signalling | 2309 | |
| 抗波形蛋白抗体 | Abcam | ab8978 | |
| 抗β-连环蛋白抗体 | Bioss | bs-1165R | |
| 抗AXIN1抗体 | Bioss | bs-2439R | |
| 抗NICD抗体 | Bioss | bs-1335R | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 594二抗 | Molecular Probes | A-21145 |
| Hoechst 33342 | Molecular Probes | H-1399 | |
| 酶活性检测 | 人凝血因子IX第一个EGF样结构域 | China Peptides | -- |
| α-酮戊二酸检测试剂盒 | Biovision | -- | |
| 细胞粘附实验 | 基质胶 | BD Bioscience | -- |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| 分光光度计 | Molecular Device | -- | |
| 蛋白互作 | FLAG HA串联亲和纯化试剂盒 | Sigma | -- |
| 统计分析 | SPSS统计软件(版本18.0) | SPSS Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系及构建体 | 细胞系是否包含MHCC-97L、EHBC-512、Huh-7,以及ASPH野生型或突变体H679A的稳定转染 阅读提示:Methods 2.1 |
| 羟化酶活性检测 | α-KG消耗实验的条件(底物、铁离子、α-KG浓度、pH值、反应时间) 阅读提示:Methods 2.3 |
| 细胞迁移和粘附实验 | 细胞数量、Matrigel包被浓度(细胞密度4×10^5/ml)、迁移时间(未明确,但需参考实验描述) 阅读提示:Methods 2.4 |
| 体内转移模型 | 动物周龄和性别(4周龄雄性BALB/c裸鼠)、细胞注入数量(1×10^6)、观察时间(3个月) 阅读提示:Methods 2.5 |
| FE1抗体处理 | FE1抗体的浓度(100 μg/ml)、处理时间(未明确) 阅读提示:Figure 2e and 2f |
| 临床队列分析 | FE1染色强度分组标准(<10%为弱,>10%为强)、随访频率和终点定义 阅读提示:Methods 2.7 |