细胞培养与转染
建立ATF2沉默的Huh-7细胞模型并分组处理。
Huh-7细胞常规培养,转染空载体或siRNA-ATF2,24小时后应用索拉非尼。
Silencing activating transcription factor 2 promotes the anticancer activity of sorafenib in hepatocellular carcinoma cells.
包含体外细胞实验(Huh-7细胞)的增殖、凋亡、迁移、侵袭检测及分子机制验证(RT-qPCR和western blot),但未涉及动物模型或临床样本,证据层级单一。
Huh-7 人肝癌细胞系
Huh-7 细胞系,购自上海细胞库(中国) 6 组处理:对照组、空载体、索拉非尼(6.8 µM)、空载体+索拉非尼、siRNA-ATF2、siRNA-ATF2+索拉非尼 转染使用 Lipofectamine 2000,索拉非尼在 ATF2-siRNA 转染后 24 小时应用 细胞增殖(CCK-8)、凋亡(流式)、迁移(划痕)、侵袭(Transwell)检测 分子检测 RT-qPCR 和 western blot 检测 ATF2、JNK3、TNF-α 表达及磷酸化水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立ATF2沉默的Huh-7细胞模型并分组处理。
Huh-7细胞常规培养,转染空载体或siRNA-ATF2,24小时后应用索拉非尼。
评估索拉非尼和/或ATF2沉默对细胞增殖的影响。
CCK-8实验检测各组细胞活力。
评估索拉非尼和/或ATF2沉默对细胞凋亡的影响。
流式细胞术检测Annexin V-FITC/PI染色的凋亡细胞。
评估索拉非尼和/或ATF2沉默对细胞迁移能力的影响。
细胞划痕实验,测量愈合面积。
评估索拉非尼和/或ATF2沉默对细胞侵袭能力的影响。
Transwell实验检测侵袭细胞数。
检测ATF2、JNK3和TNF-α的表达及磷酸化水平变化。
RT-qPCR检测mRNA,western blot检测蛋白和磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone; GE Healthcare Life Sciences | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma-Aldrich; Merck Millipore | -- | |
| 药物处理 | 索拉非尼 | Selleck Chemicals | S7397 |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-异硫氰酸荧光素 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| 碘化丙啶 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 细胞侵袭检测 | 结晶紫 | Amresco, LLC | -- |
| 细胞迁移检测 | 光学显微镜 | Olympus Corporation | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂盒 | Baosheng Science & Technology Innovation Co. Ltd. | -- |
| RT-qPCR | 逆转录试剂盒 | Takara Biotechnology Co., Ltd. | 639522 |
| SYBR-Green qPCR预混液 | MedChemExpress | HY-K0501 | |
| 蛋白提取 | triplePrep试剂盒 | ReadyPrep; GE Healthcare Life Sciences | 28-9425-44 |
| Western blot | JNK3抗体 | Abcam | ab76572 |
| ATF2抗体 | BIOSS | bs-0518R | |
| GAPDH抗体 | ABclonal Biotech Co., Ltd. | A007 | |
| TNF-α抗体 | BIOSS | BA14901 | |
| 磷酸化JNK3抗体 | Abcam | ab76572 | |
| 磷酸化ATF2抗体 | BIOSS | BS-84449R | |
| 二抗 | Abcam | ab131368 | |
| 增强化学发光液 | GE Healthcare Life Sciences | RPN2133 | |
| 凝胶成像系统 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系(Huh-7),培养基(DMEM+10% FBS+1%青链霉素),转染试剂(Lipofectamine 2000),siRNA序列,转染后24小时加药,索拉非尼浓度(6.8 µM) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度(3×10^3细胞/孔),处理时间(48小时),CCK-8孵育时间(4小时),检测波长(560 nm) 阅读提示:Materials and methods: Cell Counting kit-8 assay; Figure 2 |
| 细胞凋亡检测 | 细胞接种密度(3×10^3细胞/孔),染色时间(30分钟),流式细胞仪检测,重复数(6) 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry; Figure 3 |
| 细胞迁移检测 | 细胞接种密度(3×10^3细胞/孔),处理时间(48小时),划痕后孵育时间(48小时),显微镜成像 阅读提示:Materials and methods: Cell migration; Figure 4 |
| 细胞侵袭检测 | 细胞接种密度(3×10^3细胞/孔),无血清饥饿时间(1天),下室FBS浓度(10%),固定液(4% PFA)和时间(20-30分钟),染色(0.1%结晶紫,5分钟),计数视野数(5) 阅读提示:Materials and methods: Transwell assay; Figure 5 |
| 分子表达检测 | 处理时间(48小时),RT-qPCR引物序列,QPCR条件,Western blot抗体稀释比例和货号,重复数(3) 阅读提示:Materials and methods: RT-qPCR and Western blot analysis; Figure 6 |