检测miR-148b在肾癌组织及细胞系中的表达
评估miR-148b在肾癌组织和细胞系中的表达水平,以确定其潜在意义。
通过RT-qPCR检测12对肾透明细胞癌组织及配对癌旁组织中miR-148b的表达,以及在786-O、OS-RC-2和293T细胞系中的表达。
MicroRNA-148b enhances proliferation and apoptosis in human renal cancer cells via directly targeting MAP3K9.
包含细胞系功能实验(增殖、凋亡、细胞周期)、荧光素酶报告验证靶基因、Western blot验证信号通路,以及临床组织样本检测,但缺乏体内动物实验。
786-O人肾癌细胞系 OS-RC-2人肾癌细胞系 293T正常肾细胞系 肾透明细胞癌患者组织样本
miR-148b mimics和NC mimics浓度为50 nM 转染后48小时检测 786-O和OS-RC-2细胞系 肾癌组织样本及配对癌旁组织 质粒构建及突变位点
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估miR-148b在肾癌组织和细胞系中的表达水平,以确定其潜在意义。
通过RT-qPCR检测12对肾透明细胞癌组织及配对癌旁组织中miR-148b的表达,以及在786-O、OS-RC-2和293T细胞系中的表达。
研究miR-148b过表达对肾癌细胞增殖、凋亡和细胞周期的影响。
将miR-148b mimics或NC mimics转染至786-O和OS-RC-2细胞,48小时后分别进行CCK-8、EdU、细胞周期和凋亡分析。
确定MAP3K9是否为miR-148b的直接靶基因。
使用TargetScan预测MAP3K9为靶基因,随后在293T细胞中进行双荧光素酶报告实验,比较野生型和突变型MAP3K9 3'UTR报告质粒的活性。
探讨miR-148b是否通过MAP3K9影响MAPK/JNK信号通路。
通过Western blot检测过表达miR-148b后MAP3K9、pJNK和总JNK的蛋白水平,RT-qPCR检测MAP3K9 mRNA水平。
评估MAP3K9和pJNK在肾癌组织中的表达水平及其与miR-148b的相关性。
通过Western blot检测5对肾癌组织及配对癌旁组织中MAP3K9和pJNK的蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific | -- |
| DMEM高糖培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco; Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific | -- |
| 荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告检测试剂盒 | Promega Corp. | E1910 |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SYBR-Green qRT-PCR试剂盒 | Takara Bio Inc. | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq试剂 | Takara Bio Inc. | -- | |
| CFX96实时PCR系统 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 抗磷酸化SAPK/JNK兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 4671 | |
| 抗MAP3K9兔多克隆抗体 | Bioss | bs-10424R | |
| 抗β-微管蛋白小鼠单克隆抗体 | Transgen | HC101 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Proteintech | SA00001-1 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物试剂盒 | Millipore | WBKLS0100 | |
| ChemiDoc XRS+成像系统 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- | |
| CCK-8 assay | CCK-8试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| Bio-Tek Synergy 2酶标仪 | Bio-Tek Instruments, Inc. | -- | |
| EdU assay | EdU DNA增殖检测试剂盒 | RiboBio | -- |
| DAPI | Sangon Biotech Co., Ltd. | -- | |
| 荧光显微镜(Eclipse TE300) | Nikon | -- | |
| 细胞周期分析 | RNase A | Sangon Biotech Co., Ltd. | -- |
| 碘化丙啶 | Sangon Biotech Co., Ltd. | -- | |
| FACSVantage SE流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 凋亡检测 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒I | BD Pharmingen | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 5 | GraphPad Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 肾透明细胞癌组织及配对癌旁组织的数量(12对)、患者年龄(68.80±9.7岁)、性别比例(男8女4)、收集时间(2013年11月至2014年4月)。 阅读提示:Materials and methods: Clinical specimens |
| 细胞培养与转染 | 786-O、OS-RC-2、293T细胞系来源;培养基(RPMI-1640或DMEM高糖);血清浓度(10% FBS);转染试剂(Lipofectamine 3000);miR-148b mimics和NC mimics浓度(50 nM)。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection |
| 质粒构建 | MAP3K9 3'UTR野生型和突变型质粒的构建方法,包括克隆位点(BamHI和EcoRI)、突变序列(TGCACTGA替换为GATCAGTG)。 阅读提示:Materials and methods: Bioinformatics analysis and plasmid construction |
| 荧光素酶报告实验 | 293T细胞培养于24孔板;共转染miR-148b mimics(50 nM)、质粒(0.5 μg)及pRL-SV40(20 ng);Lipofectamine 3000用量(2.5 μl);孵育时间(48小时)。 阅读提示:Materials and methods: Dual luciferase reporter assay |
| 细胞功能检测 | CCK-8、EdU、细胞周期和凋亡检测中接种细胞密度(2×10^4、1×10^5、5×10^5)、转染后时间(48小时)、检测试剂及仪器。 阅读提示:Materials and methods: Cell counting kit-8 (CCK-8) assay, 5-Ethynyl-2′-deoxyuridine (EdU) assay, Cell cycle analysis, Apoptosis assay |