表达模式与IMF含量关联分析
检测miR-125a-5p在不同肌肉组织中的表达水平及其与IMF含量的关系。
采集7头Liangshan猪(3头用于实验)不同肌肉组织,测定IMF含量,利用qRT-PCR检测miR-125a-5p、DGAT2和ELOVL6的表达。
MicroRNA-125a-5p Affects Adipocytes Proliferation, Differentiation and Fatty Acid Composition of Porcine Intramuscular Fat.
包括体外前脂肪细胞培养、功能获得与缺失实验、双荧光素酶报告基因、线粒体含量测定和脂肪酸组成分析等多个实验层级,并进行靶基因验证。
猪肌内前脂肪细胞(分离自Liangshan猪背最长肌) 猪肌肉组织(包括舌肌、腹外斜肌等)
动物:雌性Liangshan猪,3头,体重50-65 kg,屠宰时180日龄 前脂肪细胞分离:LDM,0.2% II型胶原酶消化,70和200 μm筛网过滤 细胞培养:DMEM/F12,10% FBS,37°C,5% CO2 转染:mimics 50 nM,inhibitors 100 nM,使用Lipofectamine2000 分化诱导:1 nM DEX,5 ng/mL胰岛素,0.5 mM IBMX,培养8天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测miR-125a-5p在不同肌肉组织中的表达水平及其与IMF含量的关系。
采集7头Liangshan猪(3头用于实验)不同肌肉组织,测定IMF含量,利用qRT-PCR检测miR-125a-5p、DGAT2和ELOVL6的表达。
检验miR-125a-5p是否调节猪肌内前脂肪细胞增殖。
将mimics、inhibitors或NC转染至前脂肪细胞,通过EdU和CCK-8检测增殖,并用qRT-PCR检测细胞周期相关基因表达。
评估miR-125a-5p对分化过程的影响及机制。
分化诱导8天后,进行油红O染色、甘油三酯测定、脂联素免疫荧光及脂肪生成标志基因表达分析。同时检测线粒体含量和相关基因表达。
验证KLF13和ELOVL6是否为miR-125a-5p的直接靶基因。
利用TargetScan预测靶基因,通过双荧光素酶报告实验验证miR-125a-5p与KLF13和ELOVL6 3'-UTR的结合。
检测miR-125a-5p对猪肌内脂肪细胞脂肪酸组成的影响。
将分化后的细胞转染mimics或NC 8天,收集细胞样本分析脂肪酸组成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Hyclone | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Hyclone | -- | |
| 细胞分离 | II型胶原酶 | Invitrogen | -- |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| 分化诱导 | 地塞米松 | Sigma | -- |
| 胰岛素 | Sigma | -- | |
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤 | Sigma | -- | |
| 转染 | Lipofectamine2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| miR-125a-5p模拟物 | RIBOBIO | -- | |
| miR-125a-5p抑制剂 | RIBOBIO | -- | |
| 阴性对照 | RIBOBIO | -- | |
| 增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| EdU试剂盒 | RIBOBIO | -- | |
| 染色 | 油红O | -- | -- |
| 免疫荧光 | 抗脂联素抗体 | Bioss | bs-0471R |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| qRT-PCR | SYBR Premix Ex Taq试剂盒 | TaKaRa | -- |
| CFX96实时定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 双荧光素酶报告实验 | psiCHECK-2载体 | TsingKe Biotech | -- |
| 双荧光素酶报告系统 | Promega | -- | |
| 脂肪酸分析 | 分光光度计 | -- | -- |
| 显微镜 | 奥林巴斯IX53显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物与肌肉组织采集 | 猪种(Liangshan猪)、性别(雌性)、屠宰体重(50-65 kg)、日龄(180天)及肌肉组织类型 阅读提示:Materials and Methods, 3.1 Muscle Samples Collection |
| 前脂肪细胞分离与培养 | 分离组织(LDM)、胶原酶消化浓度(0.2%)、消化时间(2小时)、筛网(70和200 μm)、培养密度(6×10^5每60 mm皿) 阅读提示:Materials and Methods, 3.2 Porcine Intramuscular Preadipocytes Isolation and Culture |
| 分化诱导 | 诱导培养基成分(1 nM DEX、5 ng/mL胰岛素、0.5 mM IBMX)、分化时间(8天) 阅读提示:Materials and Methods, 3.2 |
| 细胞转染 | mimics浓度50 nM、inhibitors浓度100 nM、转染试剂(Lipofectamine2000)和转染时间 阅读提示:Materials and Methods, 3.3 Cells Transfection |
| 脂肪酸组成分析 | 样本量(50 mg细胞)、转染处理时间(8天)、脂肪酸提取方法(索氏提取) 阅读提示:Materials and Methods, 3.10 Measurement of IMF and Fatty Acid Composition |