建立缺氧细胞模型
模拟缺氧环境,观察LEC的形态变化和EMT特征
使用150 μM CoCl2处理SRA01/04细胞12、24和48小时,观察细胞形态,并通过Western blot和免疫细胞化学检测EMT标志物Keratin和Fibronectin的表达。
Notch1 signaling induces epithelial-mesenchymal transition in lens epithelium cells during hypoxia.
包含体外细胞实验(CoCl2处理、质粒转染、Transwell、划痕实验)和分子检测(Western blot、免疫细胞化学),但缺少体内模型和功能验证的因果证据,因此判定为中。
人晶状体上皮细胞系SRA01/04
缺氧模型为150 μM CoCl2处理SRA01/04细胞 CoCl2处理时间梯度为12、24、48小时 NICD1过表达质粒p3×FLAG-CMV-7-NICD1转染3 μg,转染24小时 Transwell侵袭实验中细胞接种密度为4×10^4细胞/孔,侵袭48小时 划痕愈合实验在转染后24小时测量划痕宽度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟缺氧环境,观察LEC的形态变化和EMT特征
使用150 μM CoCl2处理SRA01/04细胞12、24和48小时,观察细胞形态,并通过Western blot和免疫细胞化学检测EMT标志物Keratin和Fibronectin的表达。
验证缺氧条件下HIF-1α、Notch1、Snail1和E-cadherin的表达变化
通过Western blot检测CoCl2处理48小时后SRA01/04细胞中HIF-1α、Notch1、Snail1和E-cadherin的蛋白表达水平。
验证Notch1对Snail1和E-cadherin表达的影响以及细胞功能的改变
使用p3×FLAG-CMV-7-NICD1质粒转染SRA01/04细胞,以空载体和未转染细胞作为对照,通过Western blot检测Notch1、Snail1和E-cadherin的表达,并通过Transwell侵袭和划痕愈合实验检测细胞侵袭和迁移能力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素G | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 免疫细胞化学 | Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 小鼠抗角蛋白抗体 | Thermo Fisher | -- | |
| 兔抗纤连蛋白抗体 | Thermo Fisher | -- | |
| Alexa Fluor 488偶联的山羊抗小鼠二抗 | Thermo Fisher | -- | |
| Alexa Fluor 594偶联的山羊抗兔二抗 | Thermo Fisher | -- | |
| DAPI | Thermo Fisher | -- | |
| 尼康Eclipse 80i显微镜 | Nikon | -- | |
| 质粒转染 | p3×FLAG-CMV-7-NICD1质粒 | Addgene | -- |
| p3×FLAG-CMV-7质粒 | Sigma | -- | |
| Lipofectamine™ LTX试剂 | Invitrogen | -- | |
| Western blot | 细胞裂解液 | Beyotime | -- |
| SDS-PAGE凝胶电泳 | -- | -- | |
| Notch1抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| Snail抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| E-cadherin抗体 | Bioss | -- | |
| 角蛋白抗体 | Bioss | -- | |
| 纤连蛋白抗体 | Bioss | -- | |
| GAPDH抗体 | Bioss | -- | |
| 辣根过氧化物酶偶联二抗 | Bioss | -- | |
| 增强化学发光 | Thermo | SuperSignal | |
| DNR生物成像系统 | DNR | -- | |
| Transwell侵袭实验 | 24孔Transwell小室(8 μm孔径) | Corning | -- |
| Matrigel基质胶 | -- | -- | |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| 划痕愈合实验 | 6孔板 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | SRA01/04细胞培养于含10%胎牛血清、10 U/l青霉素G和100 mg/l链霉素的RPMI-1640培养基;缺氧模拟使用150 μM CoCl2。 阅读提示:Methods 中的 Cell culture 部分 |
| 免疫细胞化学 | 细胞固定于4%多聚甲醛,0.5% Triton X-100透化,BSA封闭;一抗稀释度:Keratin 1:500、Fibronectin 1:500;二抗稀释度1:500;DAPI 5 μg/ml;使用Nikon Eclipse 80i显微镜(20倍)观察。 阅读提示:Methods 中的 Immunocytochemistry 部分 |
| Western blot | 一抗稀释度:Notch1 1:1000,Snail 1:1000,E-cadherin、Keratin、Fibronectin、GAPDH 1:500;二抗稀释度1:2000;使用增强化学发光检测。 阅读提示:Methods 中的 Western blot and antibodies 部分 |
| 质粒转染 | 转染p3×FLAG-CMV-7-NICD1质粒3 μg,使用Lipofectamine LTX试剂,转染24小时;对照为空载体p3×FLAG-CMV-7。 阅读提示:Methods 中的 Plasmid and transfection 部分 |
| Transwell侵袭实验 | 使用8 μm孔径的24孔Transwell小室,上室铺基质胶50 μl,接种4×10^4细胞,下室含10% FBS,侵袭48小时。 阅读提示:Methods 中的 Transwell invasion assay 部分 |
| 划痕愈合实验 | 使用10 μl移液枪头划痕,24小时后测量划痕宽度。 阅读提示:Methods 中的 Wound healing assay 部分 |