评估TGF-β1对LOH敏感性的影响
检测TGF-β1预处理是否降低CRC细胞对LOH的敏感性。
三种CRC细胞系(HCT-116、CL187、SW620)用不同浓度TGF-β1处理3天,然后暴露于递增浓度的LOH 3天,通过MTT法评估细胞活力。
Transforming growth factor-β1 contributes to oxaliplatin resistance in colorectal cancer via epithelial to mesenchymal transition.
研究包含体外细胞实验(MTT、Western blot、免疫荧光、流式凋亡、彗星实验),验证了TGF-β1诱导EMT及其对DNA损伤和凋亡的影响,但缺乏动物模型或临床样本验证。
HCT-116细胞系 CL187细胞系 SW620细胞系
TGF-β1处理浓度:3和5 ng/ml LOH处理浓度:0-50 μM 处理时间:TGF-β1 3天,LOH 3天 细胞系:HCT-116、CL187、SW620 检测方法:MTT、Western blot、免疫荧光、流式凋亡、彗星实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测TGF-β1预处理是否降低CRC细胞对LOH的敏感性。
三种CRC细胞系(HCT-116、CL187、SW620)用不同浓度TGF-β1处理3天,然后暴露于递增浓度的LOH 3天,通过MTT法评估细胞活力。
排除TGF-β1本身对细胞形态和活力的直接影响。
观察TGF-β1处理3天和30天后HCT-116细胞形态,并通过MTT法检测细胞活力。
确认TGF-β1是否诱导CRC细胞发生EMT。
Western blot和免疫荧光检测EMT标志物(E-cadherin、N-cadherin、Snail)的表达。
检测TGF-β1是否减弱LOH诱导的DNA损伤。
碱性彗星实验检测DNA损伤水平。
检测TGF-β1是否抑制LOH诱导的细胞凋亡。
Annexin V-FITC/PI双染流式细胞术检测凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | McCoy's 5A培养基 | Sigma-Aldrich; Merck KGaA | -- |
| 杜尔贝科改良 eagle 培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| Leibovitz-15培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 重组人TGF-β1 | PeproTech, Inc. | -- |
| 奥沙利铂 | HengRui Therapeutics, Inc. | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 多孔板分光光度计 | Tecan US, Inc. | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| 亮抑酶肽 | -- | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Boster | -- | |
| E-钙黏蛋白抗体 | ProteinTech Group, Inc. | 20874-1-AP | |
| N-钙黏蛋白抗体 | BD Transduction Laboratories | 610920 | |
| Snail抗体 | Cell Signaling Technology | 3895 | |
| GAPDH抗体 | Sigma-Aldrich; Merck KGaA | G8795 | |
| 马抗小鼠免疫球蛋白 | Cell Signaling Technology, Inc. | 7076 | |
| 山羊抗兔免疫球蛋白 | Cell Signaling Technology, Inc. | 7077 | |
| 电化学发光试剂 | TransGen Biotech, Inc. | -- | |
| 免疫荧光 | 腔室玻片 | BD-falcon; BD Biosciences | -- |
| 杜尔贝科磷酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| Triton 100 | -- | -- | |
| 正常山羊血清 | Vector Laboratories, Inc. | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| Alexa Fluor 594二抗 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | A-11012 | |
| FITC标记二抗 | Bioss | bs-0926G-FITC | |
| 含DAPI的Prolong Gold抗淬灭剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | P-36931 | |
| 荧光显微镜 | Olympus Corporation | -- | |
| 流式凋亡 | Annexin V-FITC/PI双染试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| FACScan流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 彗星实验 | 彗星实验试剂盒 | Trevigen | -- |
| 低熔点琼脂糖 | Trevigen | -- | |
| 彗星载玻片 | Trevigen | -- | |
| 裂解液 | Trevigen | -- | |
| SYBR Green I | Dingguo Biotechnology Co. | -- | |
| 数据分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| Flow Jo软件 | -- | -- | |
| Comet Score软件 | -- | -- | |
| 统计分析 | JMP软件 | SAS Institute Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:ATCC;培养基和血清浓度;培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and reagents |
| 药物处理 | TGF-β1浓度(0,3,5 ng/ml等)和溶剂;LOH浓度(0-50 μM)和溶剂(5%葡萄糖);处理时间(3天+3天) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and reagents; Cell viability and proliferation assays |
| MTT法 | 细胞密度(3×10^3/孔);MTT浓度(0.5 mg/ml);孵育时间(4小时);测量波长(570 nm) 阅读提示:Materials and methods: Cell viability and proliferation assays |
| Western blot | 抗体种类、稀释比例和货号;蛋白上样量(80 μg);膜类型 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis |
| 免疫荧光 | 细胞密度;固定和通透条件;抗体浓度;孵育时间 阅读提示:Materials and methods: Cell immunofluorescence staining |
| 凋亡检测 | 细胞密度(5×10^4/孔);Annexin V和PI用量;孵育时间(30分钟);检测仪器 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometric analyses for apoptosis |
| 彗星实验 | 细胞处理;琼脂糖浓度;裂解时间;电泳条件;分析细胞数(100个/组) 阅读提示:Materials and methods: Alkaline comet assay |
| 统计分析 | 统计方法(ANOVA, t-test, Wilcoxon);重复次数(至少3次);显著性水平(P<0.05) 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |