鉴定PKC介导的lamin B3磷酸化位点
确定PKC是否直接磷酸化lamin B3以及具体磷酸化位点。
体外孵育重组GFP-LB3与cPKC或晚期胚胎提取物,通过Phos-tag凝胶电泳和质谱鉴定磷酸化位点。
PKC-mediated phosphorylation of nuclear lamins at a single serine residue regulates interphase nuclear size in Xenopus and mammalian cells.
包含体外磷酸化反应、磷酸化位点鉴定、胚胎显微注射突变体、FRAP分析、哺乳动物细胞培养和核大小量化等多个独立证据层级,并包含功能验证(突变体核大小变化)。
非洲爪蟾胚胎 HeLa细胞 Ptk2细胞 MRC-5细胞
LB3-S267磷酸化位点及其突变体对核大小的影响 FRAP实验中的核纤层动态 哺乳动物细胞系中PKC活性对核大小的调节 LA-S268突变体对核被膜定位和核大小的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定PKC是否直接磷酸化lamin B3以及具体磷酸化位点。
体外孵育重组GFP-LB3与cPKC或晚期胚胎提取物,通过Phos-tag凝胶电泳和质谱鉴定磷酸化位点。
测试LB3磷酸化位点突变对核大小的影响。
向单细胞胚胎共注射LB3 morpholino和GFP-LB3野生型或磷酸化突变体mRNA,发育至12期后测量核面积。
测定磷酸化对lamin B3动态的影响。
在爪蟾卵提取物中组装细胞核,补充GFP-LB3,进行FRAP实验,比较不同突变体的移动分数。
检测PKC活性是否影响哺乳动物细胞的核大小。
处理HeLa、Ptk2和MRC-5细胞以PMA或Gö6976,或转染组成性活性PKCα/β或siRNA敲低,测量核面积。
确认LA S268磷酸化位点对lamin A定位和核大小的影响。
在HeLa细胞中表达GFP-LA野生型或S268A/E突变体,分析其核分布和核大小。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 体外磷酸化反应 | Promega PepTag非放射性PKC检测试剂盒 | -- | V5330 |
| 蛋白分离 | Ni-NTA珠 | -- | -- |
| 凝胶电泳 | SuperSep Phos-tag凝胶 | -- | -- |
| Western blot | 抗GFP抗体 | -- | A-6455 |
| 抗肌动蛋白抗体 | Abgent | AM1965b | |
| 兔pan-PKC抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-10800 | |
| 小鼠Ran抗体 | -- | -- | |
| LB3抗体 | Assay Biotech | R12-2960 | |
| 小鼠抗lamin A抗体 | EnCor Biotechnology | MCA-4C4 | |
| 二抗(Alexa Fluor 488/568) | Molecular Probes | -- | |
| 药物处理 | PMA | -- | P8139 |
| Gö 6976 | -- | G1171 | |
| 白屈菜红碱氯化物 | -- | C2932 | |
| 麦胚凝集素 | -- | L9640 | |
| 细胞培养 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- |
| Lipofectamine RNAiMAX | Invitrogen | -- | |
| 显微注射 | mMessage mMachine试剂盒 | Ambion | -- |
| 显微镜 | 奥林巴斯BX51 | Olympus | -- |
| QIClick数码CCD相机 | -- | QIClick-F-M-12 | |
| 转盘共聚焦显微镜 | Olympus IX71 | -- | |
| iLas2系统 | BioVision Technologies | -- | |
| 质谱 | LTQ Orbitrap Velos Pro | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外磷酸化反应 | 重组GFP-LB3浓度、PKC浓度、反应时间和温度 阅读提示:Materials and Methods, In vitro PKC reactions |
| 爪蟾胚胎显微注射 | morpholino浓度和序列、mRNA浓度、注射量、胚胎发育阶段 阅读提示:Materials and Methods, Xenopus embryo microinjections |
| FRAP实验 | GFP-LB3浓度、光漂白参数(半径、激光功率、成像间隔)、提取物处理 阅读提示:Materials and Methods, FRAP experiments |
| 哺乳动物细胞处理 | 细胞系、培养基、转染方法、药物浓度和处理时间 阅读提示:Materials and Methods, Mammalian cell culture |
| 核大小量化 | 核面积测量方法、样本量、统计方法 阅读提示:Materials and Methods, Statistics |