体内表型分析
评估Aggf1单倍剂量不足对心脏肥大和心力衰竭的影响
对WT和Aggf1+/−小鼠进行TAC手术或假手术,6周后通过H&E染色、超声心动图、HW/BW和LW/BW比值、心肌细胞横截面积、ANF水平、TUNEL染色和Western blot分析凋亡及内质网应激标志物。
A non-canonical pathway regulates ER stress signaling and blocks ER stress-induced apoptosis and heart failure.
包含多个独立证据层级:体内小鼠模型(TAC、ISO、Aggf1+/−)、细胞模型(H9C2)、患者样本,且有功能验证(凋亡、心功能)和机制验证(荧光素酶、ChIP、siRNA)。
C57BL/6小鼠TAC模型 Aggf1+/−小鼠 H9C2大鼠心肌成肌细胞系 扩张型心肌病(DCM)患者心脏样本
TAC手术诱导压力超负荷模型,雄性C57BL/6小鼠(12周龄,20-25g) AGGF1蛋白治疗剂量:0.25 mg/kg BW,静脉注射,每周两次,共4周 ISO诱导细胞肥大模型:30 mg/kg BW/天,持续28天(体内);H9C2细胞处理48小时 Ago-miR-183-5p剂量:100 nmol/kg,心肌内注射;miR-183-5p抑制剂:200 nmol/kg 样本量:每组n=12(TAC模型)或n=10(miRNA处理),通过nQuery Advisor确定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Aggf1单倍剂量不足对心脏肥大和心力衰竭的影响
对WT和Aggf1+/−小鼠进行TAC手术或假手术,6周后通过H&E染色、超声心动图、HW/BW和LW/BW比值、心肌细胞横截面积、ANF水平、TUNEL染色和Western blot分析凋亡及内质网应激标志物。
验证AGGF1下调与心力衰竭患者内质网应激信号升高的关联
收集8例扩张型心肌病患者和3例正常对照的心脏样本,通过免疫组化、Western blot和qRT-PCR检测AGGF1和内质网应激标志物。
评估AGGF1蛋白或基因治疗对心脏肥大和心力衰竭的治疗效果
对TAC小鼠进行AGGF1蛋白静脉注射(0.25 mg/kg BW,每周两次,共4周)或心肌内注射AAV9-AGGF1病毒,通过H&E、超声心动图、HW/BW等评估心脏功能。
阐明AGGF1调节内质网应激信号的分子机制
在H9C2细胞中,通过荧光素酶报告基因验证miR-183-5p与CHOP 3'UTR的结合,通过ChIP验证ZEB1与miR-183-5p启动子结合,通过siRNA敲低ERK1/2、ZEB1或AGGF1,检测miR-183-5p和CHOP水平。
验证miR-183-5p对心脏肥大和心力衰竭的作用
在WT和Aggf1+/−小鼠TAC模型中,通过心肌内注射Ago-miR-183-5p或Antago-miR-183-5p抑制剂,评估心脏功能、肥大指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫染色 | KDEL受体抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-33806 |
| 蛋白质印迹 | Bax抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-493 |
| Bcl2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7382 | |
| CHOP抗体 | Cell Signaling Technology | 2895 | |
| cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| Ero1α抗体 | Cell Signaling Technology | 3264 | |
| sXBP1抗体 | Cell Signaling Technology | 12782 | |
| cleaved PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| BiP抗体 | Abcam | ab21685 | |
| cATF6抗体 | Abcam | ab11909 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab9484 | |
| AGGF1抗体 | Proteintech | 11889-1-AP | |
| ATF4抗体 | Proteintech | 10835-1-AP | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 60008-1-Ig | |
| DR5抗体 | Proteintech | 15497-1-AP | |
| Puma抗体 | Proteintech | 55120-1-AP | |
| p-PERK抗体 | Affinity Biosciences | DF7576 | |
| p-eIF2α抗体 | Bioss | -- | |
| 细胞培养 | H9C2细胞系 | ATCC | CRL-1446™ |
| 杜氏改良伊格尔培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 双荧光素酶检测 | pMIR-REPORT荧光素酶载体 | Applied Biosystems | -- |
| pRL-TK载体 | Promega | -- | |
| 双荧光素酶检测试剂盒 | Gibco Life Technologies | -- | |
| 动物实验 | ALZET 1004型微型泵 | ALZET | Model |
| Vevo2100高分辨率小动物超声系统 | Visual Sonics | -- | |
| BP-98A尾袖容积描记仪 | Softron | BP-98A | |
| 组织化学分析 | 生物素化二抗 | Dako | -- |
| VECTASTAIN ABC-AP试剂盒 | Vector Laboratories | -- | |
| 实时RT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| M-MLV逆转录酶 | Promega | -- | |
| FastStart通用SYBR Green预混液 | Roche | -- | |
| 7900 HT快速实时PCR系统 | Thermo | -- | |
| 蛋白质印迹 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Calbiochem | -- |
| 1-D分析软件 | Bio-Rad | -- | |
| Quantity One软件 | Bio-Rad | -- | |
| ChIP分析 | 抗ZEB1抗体 | Proteintech | -- |
| ChIP试剂盒 | Beyotime | -- | |
| ELISA | ANF ELISA试剂盒 | Abcam | -- |
| 动物实验 | AAV9-AGGF1病毒 | Vector Biolabs | -- |
| AAV9-GFP病毒 | Vector Biolabs | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TAC模型 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;手术方法(缝线规格、针号);样本量(n=12);术后时间点(6周) 阅读提示:Methods: Animals and procedures; Figure legend 1 |
| AGGF1蛋白治疗 | AGGF1剂量(0.25 mg/kg BW)、给药途径(静脉)、频率(每周两次,共4周)、起始时间(术后2周) 阅读提示:Methods: Animals and procedures; Figure legend 3 |
| ISO模型 | ISO剂量(30 mg/kg BW/天)、给药途径(腹腔植入微泵)、持续时间(28天);细胞处理浓度和时间(H9C2细胞,48小时) 阅读提示:Methods: Animals and procedures; Figure legend 2 |
| miRNA处理 | Ago-miR-183-5p剂量(100 nmol/kg)、miR-183-5p抑制剂剂量(200 nmol/kg)、给药途径(心肌内注射)、时间(TAC前24小时) 阅读提示:Methods: Animals and procedures; Figure legends 7-8 |
| 分子机制实验 | H9C2细胞培养条件、转染试剂和浓度、荧光素酶报告基因载体(pMIR-CHOP-wt/mut, pGL3-miR-183)、ChIP实验条件(细胞数、交联、超声) 阅读提示:Methods: Cell culture and transfection, Dual luciferase assays, ChIP assays |