生成条件性ELL2敲除小鼠
研究ELL2在前列腺中的功能作用
通过将Ell2loxp/loxp小鼠与probasin-Cre4小鼠杂交,获得前列腺上皮细胞特异性ELL2敲除小鼠,并通过PCR确认基因型。
Conditional deletion of ELL2 induces murine prostate intraepithelial neoplasia.
包含基因敲除小鼠模型、组织病理学分析、免疫组化、微阵列及qPCR验证、细胞实验(siRNA敲低和雄激素处理)以及癌症基因组学数据分析等多个证据层级。
ELL2条件性敲除小鼠(Ell2-cko) C4-2前列腺癌细胞系 LNCaP前列腺癌细胞系
ELL2条件性敲除小鼠的基因型(通过PCR确认) 小鼠年龄(17-20个月龄) 野生型与Ell2-cko小鼠的比较 Ki-67增殖标记检测 CD31微血管密度检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究ELL2在前列腺中的功能作用
通过将Ell2loxp/loxp小鼠与probasin-Cre4小鼠杂交,获得前列腺上皮细胞特异性ELL2敲除小鼠,并通过PCR确认基因型。
评估ELL2缺失对前列腺组织学的影响
对17-20个月龄雄性小鼠的前列腺进行固定、切片、HE染色,并由病理学家盲法评估上皮增生、间质增生和mPIN。
评估ELL2缺失对细胞增殖和血管生成的影响
通过Ki-67免疫组化评估上皮细胞增殖,通过CD31免疫组化评估微血管密度。
识别ELL2缺失引起的基因表达改变
对3个月龄小鼠前列腺进行cDNA微阵列分析,并用17个月龄小鼠前列腺进行qPCR验证。
验证ELL2缺失对细胞增殖和蛋白表达的影响
在LNCaP细胞中敲低ELL2检测增殖,在C4-2细胞中检测R1881对ELL2表达的影响以及ELL2敲低对HIF1α蛋白水平的影响。
评估ELL2及其靶基因在患者中的改变频率
利用cBioPortal分析两个前列腺癌数据集(神经内分泌和TCGA)中ELL2及其潜在靶基因的改变。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 原位杂交 | pBluescript II SK质粒载体 | -- | -- |
| T3 RNA聚合酶 | Promega Corp. | -- | |
| T7 RNA聚合酶 | Promega Corp. | -- | |
| 蛋白提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA质量分析 | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- |
| 微阵列 | 小鼠基因组430 2.0基因芯片 | Affymetrix Inc. | -- |
| qPCR验证 | RNeasy小提试剂盒 | Qiagen | -- |
| qPCR | SYBR Green/ROX | Thermo Scientific | -- |
| Applied Biosystems StepOne™Plus™实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning cellgro | 10-040-CV |
| 胎牛血清 | Atlanta Biologicals | S11150 | |
| R1881 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma | -- |
| 抗ELL2抗体 | Bethyl Laboratories, Inc. | A302-505A | |
| HIF1α抗体 | BD Transduction Laboratories | 610959 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc25778 | |
| siRNA敲低 | siELL2 | Integrated DNA Technologies | -- |
| siEAF2 | Integrated DNA Technologies | -- | |
| siSCR(对照siRNA-A) | Santa Cruz | sc-37007 | |
| DharmaFECT™转染试剂 | GE Healthcare | -- | |
| 免疫组化 | 抗ELL2抗体 | Bioss Antibodies | bs-6993R |
| 抗Ki-67抗体 | Dako | M7249 | |
| 抗CD31抗体 | BD Biosciences | 550274 | |
| 图像采集 | 徕卡DM LB显微镜 | Leica Microsystems Inc. | -- |
| QImaging MicroPublisher 3.3 RTV相机 | QImaging | -- | |
| 图像分析 | Aperio ScanScope CS扫描仪 | Aperio | -- |
| Aperio ImageScope软件 | Aperio Technologies, Inc. | -- | |
| Photoshop CS | Adobe Systems | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 4 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 基因敲除小鼠生成 | Ell2loxp/loxp小鼠与probasin-Cre4小鼠的杂交;基因型通过PCR验证;小鼠背景C57BL/6J 阅读提示:Methods部分-生成前列腺特异性ELL2缺失小鼠 |
| 组织病理学分析 | 小鼠年龄:17-20个月;组织固定于10%福尔马林;切片厚度5μm;HE染色 阅读提示:Methods部分-组织病理学分析 |
| 增殖和血管密度检测 | Ki-67免疫组化;CD31免疫组化;小鼠数量(至少6只/组);视野数量(至少20个) 阅读提示:Methods部分-免疫组化 |
| 基因表达分析 | 3个月龄小鼠各6只用于微阵列;17个月龄WT n=5,Ell2-cko n=3用于qPCR;内参基因GAPDH 阅读提示:Methods部分-组织制备和微阵列杂交,基因表达验证 |
| 细胞实验 | LNCaP和C4-2细胞培养条件;R1881浓度范围;siRNA敲低条件 阅读提示:Methods部分-细胞培养实验 |