LSD1抑制剂的设计与合成
获得三唑-二硫代氨基甲酸酯杂合体库,并筛选对LSD1有抑制活性的化合物。
通过点击化学方法合成了一系列1,2,3-三唑-二硫代氨基甲酸酯杂合体(化合物12-95),并测定了其对重组LSD1的抑制活性。
Triazole-dithiocarbamate based selective lysine specific demethylase 1 (LSD1) inactivators inhibit gastric cancer cell growth, invasion, and migration.
包含体外酶活性测定、细胞活性与功能实验、分子机制研究及体内异种移植瘤模型,且具备功能验证和机制验证。
人胃癌细胞系MGC-803 人胃癌细胞系HGC-27 人胃癌细胞系SGC-7901 人正常胃上皮细胞系GES-1 MGC-803细胞裸鼠异种移植瘤模型
LSD1过表达胃癌细胞系MGC-803和HGC-27 化合物26浓度(0.5、2.5、12.5 μM)和时间(60 min)对LSD1活性抑制的影响 化合物26的细胞毒性IC50值(MGC-803: 0.89 μM; HGC-27: 1.13 μM) 化合物26在体内异种移植瘤模型中给药剂量(5、10、20 mg/kg)和给药方式(静脉注射,每日一次,共21天) siRNA介导的LSD1敲低对细胞活力和迁移侵袭的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得三唑-二硫代氨基甲酸酯杂合体库,并筛选对LSD1有抑制活性的化合物。
通过点击化学方法合成了一系列1,2,3-三唑-二硫代氨基甲酸酯杂合体(化合物12-95),并测定了其对重组LSD1的抑制活性。
评估化合物对LSD1的抑制效力、结合亲和力以及对LSD1同源物的选择性。
对化合物进行体外LSD1活性抑制测定,对活性最好的化合物26进行了MST实验测定Kd值,并检测其对LSD2、MAO-A、MAO-B的抑制活性。
验证化合物26在细胞内的LSD1抑制活性及其对胃癌细胞的选择性毒性。
在不同胃癌细胞系和正常胃上皮细胞中检测化合物26的细胞毒性(MTT法),并检测组蛋白甲基化水平变化以确认LSD1被抑制。
评估化合物26对胃癌细胞凋亡、迁移和侵袭的影响。
通过Hoechst 33258染色和Annexin V-FITC/PI双染流式检测凋亡;通过划痕实验、Transwell实验评估迁移和侵袭,并通过Western blot和免疫共沉淀检测相关蛋白表达和相互作用。
验证化合物26在体内对胃癌肿瘤生长的抑制作用及安全性。
建立MGC-803细胞裸鼠异种移植瘤模型,给予不同剂量化合物26,监测肿瘤体积、重量和体重。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化学合成 | X-5显微熔点仪 | -- | -- |
| Bruker 400 MHz核磁共振波谱仪 | Bruker | -- | |
| Nicolet iS10红外光谱仪 | Nicolet | -- | |
| Waters Micromass Q-T of Micromass质谱仪 | Waters | -- | |
| Dionex UltiMate 3000超高效液相色谱仪 | ThermoFisher | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 细胞活性检测 | MTT | -- | 298-93-1 |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX试剂 | Invitrogen | -- |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| H3K4me抗体 | Selleck Chemicals | A1237 | |
| H3K4me2抗体 | Epitomics | 1347-1 | |
| H3K9me2抗体 | Epitomics | 1349-1 | |
| H3K4me3抗体 | Bioss | bs-4715R | |
| H3抗体 | Sino Biological Inc | 100005-MM01 | |
| LSD1抗体 | Epitomics | 5890-1 | |
| E-钙粘蛋白抗体 | Epitomics | 1702-1 | |
| Snai1抗体 | Cell Signaling | 3879 | |
| GAPDH抗体 | GoodHere | AB-M-M | |
| 免疫沉淀 | 交联免疫沉淀试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| 组蛋白提取 | 组蛋白纯化试剂盒 | Epigentek | -- |
| 蛋白质印迹 | 增强化学发光试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| 凋亡检测 | Hoechst-33258 | -- | 23491-45-4 |
| AnnexinV-FITC/PI染色试剂盒 | Biovision | -- | |
| 流式分析 | Accuri C6流式细胞仪 | BD | -- |
| MST实验 | Monolith NT.115 | NanoTemper Technologies | -- |
| 细胞培养 | 二甲基亚砜 | -- | 67-68-5 |
| 动物实验 | 羟丙基-β-环糊精 | -- | 128446-35-5 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LSD1活性抑制测定 | LSD1重组蛋白来源和浓度,底物H3K4me2浓度,反应时间,抑制剂浓度范围 阅读提示:Methods: Inhibitory Evaluation of the Synthesized Compounds Against LSD1, LSD2, MAO-A, MAO-B and Mechanism of Action Studies |
| 细胞毒性测定 | 细胞系(MGC-803, HGC-27, SGC-7901, GES-1),细胞密度,化合物浓度范围,处理时间,MTT检测时间点 阅读提示:Methods: Cells and Cell Viability Assay; Figure 7 |
| 细胞凋亡检测 | 化合物26浓度,处理时间(48h),Hoechst染色浓度,流式检测方法 阅读提示:Methods: Apoptotic Analysis; Figure 8 |
| 迁移和侵袭实验 | 细胞密度,划痕工具,化合物26浓度,处理时间(48h),Transwell小室孔径和基质胶浓度 阅读提示:Methods: Migration and Invasion Assay; Figure 9 |
| 体内异种移植瘤实验 | 小鼠品系(BALB/C nude mice),细胞接种数,肿瘤体积起始大小(100 mm3),给药剂量(5, 10, 20 mg/kg)、给药方式(i.v.)、给药频率(每日一次)、给药周期(21天),对照组设置(saline, HP-β-CD) 阅读提示:Methods: Xenograft Studies; Figure 10 |