Max敲除ESCs中减数分裂基因表达的诱导
确定Max缺失对生殖细胞相关基因表达的影响。
在Dox诱导的Max敲除ESCs中,通过微阵列和qPCR分析基因表达变化。
Loss of MAX results in meiotic entry in mouse embryonic and germline stem cells.
研究包含基因敲除、转录组分析、免疫染色、ChIP、功能回复及体内表达检测等多层级验证。
小鼠胚胎干细胞(Max敲除) 小鼠生殖系干细胞(GSCs) 小鼠睾丸和生殖嵴组织
Max敲除的ESCs使用Dox诱导的tet-off系统。 Stra8基因敲除通过CRISPR-Cas9实现。 SYP3免疫染色评估减数分裂样细胞学变化。 维生素C和RA处理增强减数分裂样变化。 在2i+LIF条件下诱导减数分裂样变化。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Max缺失对生殖细胞相关基因表达的影响。
在Dox诱导的Max敲除ESCs中,通过微阵列和qPCR分析基因表达变化。
验证Max缺失是否引起减数分裂特异性细胞学特征。
通过免疫细胞化学染色检测SYP3、STRA8、γH2AX等标记。
确定Stra8是否为Max缺失诱导的减数分裂样变化所必需。
在Max敲除ESCs中用CRISPR-Cas9敲除Stra8,观察减数分裂样变化是否消失。
测试在抑制分化的2i培养条件下Max缺失是否仍能诱导减数分裂。
在2i+LIF条件下培养Max敲除ESCs,检测基因表达和细胞学变化。
验证减数分裂样变化是否不经过PGC状态。
在Max敲除ESCs中敲除Blimp1,观察减数分裂样变化是否仍发生。
探究RA信号和LIF对Max缺失诱导的减数分裂的调节作用。
用RA、LIF、RA受体抑制剂处理细胞,并检测Stra8表达和减数分裂样变化。
确定MAX/MGA-PRC1.6复合物是否直接抑制减数分裂基因。
通过敲降Mga、L3mbtl2等以及ChIP检测MAX和L3MBTL2在减数分裂基因启动子上的结合。
检查生理性减数分裂过程中MAX的表达变化。
对成年小鼠睾丸和13.5 dpc胚胎生殖嵴进行免疫组化分析MAX表达。
检验在生殖系干细胞中降低Max表达是否足以诱导减数分裂。
用慢病毒敲降GSCs中的Max,检测Stra8表达和SYP3染色模式。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 多西环素 | Clontech | 631311 |
| 药物处理 | VX680 | ADG | A10981-25 |
| 细胞凋亡抑制 | Z-VAD-FMK | Calbiochem | 627610 |
| RA信号抑制 | AGN193109 | Santa Cruz Biotechnology | sc210768 |
| 药物处理 | 全反式维甲酸 | Sigma | R2625 |
| 维生素C | SIGMA | A4544 | |
| 细胞培养 | StemPro-34无血清培养基 | Invitrogen | 10639-011 |
| 胰岛素 | Sigma | 1882 | |
| 转铁蛋白 | Sigma | T1147 | |
| 腐胺 | Sigma | P7505 | |
| D-(+)-葡萄糖 | Sigma | G7021 | |
| DL-乳酸 | Sigma | 4263 | |
| 牛血清白蛋白 | Invitrogen | 15561-020 | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| MEM维生素溶液 | Invitrogen | 11120-052 | |
| 非必需氨基酸溶液 | Invitrogen | 11140-050 | |
| β-雌二醇 | Sigma | E2758 | |
| 孕酮 | Sigma | P8783 | |
| D-生物素 | Sigma | B4501 | |
| 抗坏血酸 | Sigma | A4544 | |
| 小鼠表皮生长因子 | R&D systems | 2028-EG | |
| 人碱性成纤维细胞生长因子 | Becton Dickinson | 13256-029 | |
| 小鼠白血病抑制因子 | Stem Cell Technologies | 02740 | |
| 大鼠胶质细胞源性神经营养因子 | R&D systems | 512-GF | |
| MEK抑制剂PD0325901 | -- | -- | |
| GSK3β抑制剂CHIR99021 | -- | -- | |
| 免疫染色 | 抗SYCP1抗体 | Abcam | ab15090 |
| 抗SYCP3抗体 | Abcam | ab97672 | |
| 抗STRA8抗体 | Abcam | ab49602 | |
| 抗REC8抗体 | Abcam | ab192241 | |
| 抗Aurora B抗体 | Abcam | ab2254 | |
| 抗MAX抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-197 | |
| 抗L3mbtl2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-134879 | |
| 抗PLZF抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc28319 | |
| DNA甲基化分析 | 抗5-甲基胞嘧啶抗体 | Active Motif | 61255 |
| 抗5-羟甲基胞嘧啶抗体 | Active Motif | 39791 | |
| 免疫染色 | 抗γH2AX抗体 | Cell Signaling Technology | 2577 |
| 抗cKIT抗体 | BD Pharmingen | 553352 | |
| 抗Aurora A/B/C抗体 | Bioss Antibodies | BS-2445R | |
| Alexa Fluor染料偶联二抗 | Invitrogen | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 细胞培养 | pCAG-IP载体 | -- | -- |
| 基因编辑 | pX330-U6-Chimeric_BB_CBh-hSpCas9载体 | -- | -- |
| 转染 | 脂质体转染试剂2000 | Invitrogen | -- |
| 显微成像 | 共聚焦激光扫描显微镜TCS SP8 | Leica Microsystems | -- |
| 实时PCR | StepOnePlus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| 微阵列 | Affymetrix GeneChip小鼠基因组430 2.0芯片 | Affymetrix | -- |
| 细胞培养 | 细胞培养圆片 | SUMITOMO BAKELITE | MS-92132 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | ESCs培养条件(常规LIF+血清或2i+LIF)、GSCs培养基成分、Dox浓度、RA浓度、维生素C浓度等 阅读提示:Methods: Mouse ESC and GSC culture |
| Max敲除诱导 | Dox处理时间(0-10天)、Dox浓度(1微克/毫升) 阅读提示:Results, Figure legends |
| 基因敲除 | CRISPR-Cas9靶向序列、敲除效率验证(测序、western blot) 阅读提示:Methods: Gene disruption |
| 免疫染色 | 抗体稀释比例、固定和封闭条件、SYP3染色长度判读标准 阅读提示:Methods: Immunostaining, Estimation of meiotic stages |
| ChIP | 抗体(MAX, L3MBTL2)、Dox处理时间(4天)、引物序列 阅读提示:Methods: ChIP-PCR analyses |
| 体内分析 | 小鼠年龄(8周龄)、胚胎阶段(13.5 dpc)、组织固定和切片方法 阅读提示:Methods: Immunostaining, Results |