建立PDX模型并评估体内顺铂敏感性
验证YAP表达与体内顺铂反应的相关性
将UCC患者肿瘤组织皮下植入SCID小鼠建立RP-B-01和RP-B-02 PDX模型,用不同剂量顺铂(5或10 mg/kg)处理,检测肿瘤生长和YAP表达。
YAP activation protects urothelial cell carcinoma from treatment-induced DNA damage.
包含患者来源异种移植模型体外和体内实验、基因和药理调控、DNA损伤检测及临床样本验证,功能与机制验证完整
RP-B-01和RP-B-02患者来源异种移植模型(PDX)及其衍生细胞 RP-B-02 C-r顺铂耐药PDX模型及细胞 T24人尿路上皮癌细胞系 253J人尿路上皮癌细胞系
PDX模型中顺铂给药剂量(5或10 mg/kg,每周一次)和给药周期(2或3周) YAP敲低或过表达使用的慢病毒载体(pGIPZ shRNA或pWPI)及筛选标记(嘌呤霉素) 体外药物处理浓度(顺铂、多柔比星、依托泊苷、维替泊芬)和时间点 体内实验中T24细胞注射数量(5×10^6)和顺铂剂量(6mg/kg,每周一次,共4周) TMA样本中YAP核染色评分标准(0, 1+, 2+, 3+)及高/低分组定义
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证YAP表达与体内顺铂反应的相关性
将UCC患者肿瘤组织皮下植入SCID小鼠建立RP-B-01和RP-B-02 PDX模型,用不同剂量顺铂(5或10 mg/kg)处理,检测肿瘤生长和YAP表达。
模拟临床获得性耐药并分析YAP变化
用RP-B-02肿瘤在体内持续顺铂处理,逐步增加剂量,筛选出耐药肿瘤并传代,检测YAP及其靶基因表达。
确认体外细胞模型保留体内敏感性
从PDX肿瘤中分离癌细胞,用顺铂处理,检测细胞存活和凋亡标志物。
验证YAP对顺铂敏感性的因果作用
用shRNA敲低YAP或过表达组成性激活形式(S127A),检测细胞死亡、增殖和凋亡标志物。
探究YAP保护作用的机制
用彗星实验和DNA损伤标志物(pATM, pH2A.X)检测YAP敲低细胞对顺铂、多柔比星、依托泊苷和γ射线的响应。
验证YAP敲低在体内增强顺铂抗肿瘤活性
将T24或T24 YAPsh细胞皮下注射SCID小鼠,用顺铂处理,检测肿瘤重量、增殖和DNA损伤标志物。
评估维替泊芬单药及联合顺铂的抗肿瘤效果
用维替泊芬处理UCC细胞,检测细胞死亡和凋亡,并测试联合顺铂的增敏作用。
评估YAP作为预后标志物的临床价值
对171例UCC患者的组织芯片进行YAP免疫组化染色,评分并分析核YAP表达与生存期的关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | F培养基 | -- | -- |
| Y-27632 | Enzo Life Sciences | -- | |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 药物处理 | 顺铂 | Sigma-Aldrich | -- |
| 盐酸多柔比星 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 依托泊苷 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 维替泊芬 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞凋亡检测 | 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| pATM (Ser1981)抗体 | Abcam | ab81292 | |
| pYAP (Ser127)抗体 | Abcam | ab76252 | |
| CTGF抗体 | Bioss | bs-0743R | |
| Caspase 3抗体 | Cell Signaling | #9662 | |
| Cleaved caspase 3 (Asp175)抗体 | Cell Signaling | #9664 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling | #5174 | |
| pH2A.X (Ser139)抗体 | Cell Signaling | #9718 | |
| PARP抗体 | Cell Signaling | #9542 | |
| Cleaved PARP (Asp214)抗体 | Cell Signaling | #9541 | |
| β-actin抗体 | Santa Cruz | sc-47778 | |
| Survivin抗体 | Santa Cruz | sc-17779 | |
| YAP抗体 | Santa Cruz | sc-15407 | |
| 免疫组化 | Ki67抗体 | Thermo Scientific | RM9106S1 |
| Western blot | α-tubulin抗体 | Millipore | 04-1117 |
| 细胞培养 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 细胞增殖检测 | 结晶紫 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞计数 | TC10自动细胞计数器 | Bio-Rad | -- |
| γ射线照射 | Mark I 137Cs γ射线照射器 | Shepherd | -- |
| 组织染色 | DAB显色液 | Dako | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PDX模型建立 | 患者肿瘤样本来源、SCID小鼠品系(6周龄雌性)、植入肿瘤大小(~20 mm3)、样本量 阅读提示:Materials and Methods: Establishment of UCC patient-derived xenograft models (PDXs) |
| 体内药物处理 | 顺铂剂量(5或10 mg/kg)、给药频率(每周一次)、给药周期(2-4周)、注射方式(腹腔注射)、对照组(0.9% NaCl) 阅读提示:Materials and Methods: In vivo cisplatin studies and establishment of a cisplatin-resistant PDX model; Figure 1 legend |
| 细胞培养 | 细胞系(RP-B-01, RP-B-02, RP-B-02 C-r, T24, 253J)、培养基组成(F medium, RPMI 1640)、补充因子(如Y-27632)浓度、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods: Cell isolation and culture |
| 慢病毒感染与筛选 | 慢病毒载体(pGIPZ-shYAP, pWPI-YAP S127A)、病毒滴度、感染条件(polybrene 8μg/ml)、选择标记(puromycin浓度未明确) 阅读提示:Materials and Methods: RNA interference and expression plasmids |
| 体外药物处理 | 药物浓度(顺铂、多柔比星、依托泊苷、维替泊芬)及处理时间点(如48小时)、溶剂(PBS, DMSO) 阅读提示:Materials and Methods: In vitro cell assays |
| Western blot | 细胞裂解液(RIPA buffer)、抗体稀释比例(未明确)、蛋白上样量(未明确)、内参(GAPDH, α-tubulin) 阅读提示:Materials and Methods: Western blot analysis |
| 彗星实验 | 细胞处理条件、裂解液成分、电泳条件、定量方法(尾长)及时间点 阅读提示:Materials and Methods: Comet assay |
| 免疫组化 | 抗原修复缓冲液(10 mM柠檬酸钠pH 6.0)、过氧化物酶淬灭(3% H2O2)、封闭液(1% BSA)、一抗孵育条件(4°C过夜)、二抗和显色(DAB) 阅读提示:Materials and Methods: Histology and immunohistochemistry |
| 临床样本分析 | TMA样本数(171例)、化疗暴露情况(42例)、YAP评分标准(0-3+)、生存期定义(OS, RFS)及统计方法(Kaplan-Meier, Cox) 阅读提示:Materials and Methods: Human UCC tissue microarray (TMA); Statistical analysis |