细胞因子刺激下ERK激活的磷酸化流式分析
检测野生型与KrasG12D小鼠骨髓细胞中GM-CSF和SCF诱导的ERK磷酸化水平,并评估不同激酶抑制剂的影响
分离骨髓细胞,用指定抑制剂预孵育,再以GM-CSF或SCF刺激,通过磷酸化流式细胞术分析不同细胞亚群(M+G+和K+M−G−)中pERK水平。
PLC-γ and PI3K link cytokines to ERK activation in hematopoietic cells with normal and oncogenic Kras.
包含体外细胞实验(BMMPCs、原代骨髓细胞)、RNAi敲低、药理学抑制剂、集落形成实验及体内小鼠给药实验,并进行功能与机制验证。
野生型小鼠骨髓细胞 Mx1-Cre, KrasG12D小鼠骨髓细胞 骨髓巨噬细胞祖细胞(BMMPCs) KLS 48−造血干/祖细胞富集群体
GM-CSF刺激浓度(10 ng/ml或1 ng/ml)及刺激时间(10或15分钟) 抑制剂浓度(5 μM)及预孵育时间(30分钟) 体内GDC-0941给药剂量(100 mg/kg口服)及时间点(2或6小时) BMMPCs培养及血清饥饿条件(4小时或过夜) CFU-GM集落形成实验中甲基纤维素培养基及GM-CSF浓度(10 ng/ml)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测野生型与KrasG12D小鼠骨髓细胞中GM-CSF和SCF诱导的ERK磷酸化水平,并评估不同激酶抑制剂的影响
分离骨髓细胞,用指定抑制剂预孵育,再以GM-CSF或SCF刺激,通过磷酸化流式细胞术分析不同细胞亚群(M+G+和K+M−G−)中pERK水平。
确定PLC-γ和PI3K在Ras-Raf-MEK-ERK信号通路中的作用位置
在抑制剂存在下,用GM-CSF刺激骨髓细胞或BMMPCs,通过Raf-RBD pulldown实验检测Ras-GTP水平,并通过Western blotting检测pERK和pAkt水平。
利用RNAi敲低和药理学抑制剂,探究PLC-γ和PI3K在GM-CSF激活ERK和Akt中的功能关系
在BMMPCs中通过逆转录病毒转导shRNA敲低PLC-γ1或PLC-γ2,或使用U73122和PI-90,观察GM-CSF刺激后ERK和Akt磷酸化水平。
验证DAG能否绕过PLC-γ和PI3K抑制,直接激活Ras-ERK通路
用PMA或GM-CSF处理BMMPCs,检测Ras-GTP、pERK和pAkt水平,并观察抑制剂存在下PMA对ERK磷酸化的影响。
评估PLC-γ和PI3K对髓系祖细胞功能的影响
在含有GM-CSF的甲基纤维素培养基中,加入不同浓度的JakI、PI-90、U73122或Akt VIII,计数CFU-GM集落形成。
验证PI3K抑制剂在体内是否抑制细胞因子诱导的骨髓细胞ERK激活
给小鼠口服GDC-0941或PD0325901,在不同时间点处死小鼠,分离骨髓细胞并用GM-CSF刺激后检测pERK水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体 | pERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 |
| RasGRP3抗体 | Cell Signaling Technology | 3334 | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4967 | |
| pAkt抗体 | Invitrogen | 44-621G | |
| Ras抗体(克隆Ras10) | Millipore | 05-516 | |
| RasGRP4抗体 | Covalab | pab0554-1 | |
| PLC-γ1抗体 | Santa Cruz | sc-7290 | |
| PLC-γ2抗体 | Bioss | bs-3532R | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | DakoCytomation | P0448 | |
| 辣根过氧化物酶标记的绵羊抗小鼠IgG | GE Healthcare | NA931V | |
| FITC标记的抗兔IgG | Jackson Immunoresearch | 711-096-152 | |
| APC标记的抗兔IgG | Jackson Immunoresearch | 711-136-152 | |
| pSTAT5(pY694)抗体 | BD Biosciences | 612599 | |
| pPLC-γ1抗体 | Bioss | bs-3343R | |
| pPLC-γ2抗体 | Bioss | bs-3339R | |
| CD11b/Mac1抗体 | BD Pharmingen | 553311 | |
| Gr1抗体 | BD Pharmingen | 553128 | |
| CD117/c-kit抗体 | eBioscience | 15-1171-320 | |
| CD16/CD32抗体 | BD Biosciences | 553142 | |
| 抑制剂 | JakI | Calbiochem | 420099 |
| SU6656 | Calbiochem | 572635 | |
| PP2 | Calbiochem | 529576 | |
| 双吲哚马来酰亚胺I(BIM I) | Calbiochem | 203291 | |
| U73122 | Calbiochem | 662035 | |
| U73343 | Calbiochem | 662041 | |
| 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | P8139 | |
| 2-氨基乙基二苯基硼酸酯 | Sigma-Aldrich | D9754 | |
| KN-62 | Sigma-Aldrich | I2142 | |
| PD0325901 | Pfizer Inc. | -- | |
| GDC-0941 | Genentech, Inc. | -- | |
| PLX4720 | Plexxikon, Inc. | -- | |
| PI-90 | -- | -- | |
| PI-103 | -- | -- | |
| AS605240 | -- | -- | |
| TGX 115 | -- | -- | |
| IC87114 | -- | -- | |
| SW13 | -- | -- | |
| 试剂 | Lipofectamine RNAiMAX | Invitrogen | 13778-150 |
| RasGRP3 siRNA | Invitrogen | MSS216067 | |
| RasGRP4 siRNA | Invitrogen | MSS239172 | |
| 阴性通用对照低GC | Invitrogen | 12935-110 | |
| 细胞培养 | Iscove改良Dulbecco培养基(IMDM) | -- | -- |
| 牛血清白蛋白(BSA) | Sigma-Aldrich | -- | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 干细胞因子 | Peprotech | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 甲基纤维素培养基M3231 | Stem Cell Technologies | -- | |
| PBS基解离缓冲液 | Gibco | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- |
| Immobilon-P膜 | Millipore | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Amersham Biosciences | -- | |
| ECL plus | GE Healthcare | -- | |
| qPCR | RNeasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| Nanodrop分光光度计 | -- | -- | |
| Taqman 7300 | Applied Biosystems | -- | |
| Amplitaq Gold混合液 | Applied Biosystems | -- | |
| Taqman探针 | Applied Biosystems | Mm01205647_g1, Mm01233143_m1, Mm00460898_m1 | |
| 动物实验 | 聚肌胞苷酸 | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞刺激与抑制剂处理 | GM-CSF浓度(10或1 ng/ml)、SCF浓度(100 ng/ml)、刺激时间(10或15分钟)、抑制剂种类及浓度(5 μM)、预孵育时间(30分钟) 阅读提示:Materials and Methods: Harvesting and stimulation of bone marrow cells; Figure legends 1A-C |
| BMMPCs的培养与处理 | 巨噬细胞培养基成分、M-CSF浓度(30 ng/ml)、血清饥饿时间(4小时或过夜)、细胞传代次数 阅读提示:Materials and Methods: Culture and stimulation of BMMPCs |
| Ras-GTP检测 | 细胞裂解缓冲液成分、Raf-RBD pulldown实验步骤 阅读提示:Materials and Methods: Western blotting analysis and Ras-GTP assays |
| 体内药物处理 | GDC-0941剂量(100 mg/kg口服)、PD0325901剂量(5 mg/kg口服)、给药后处理时间(2或6小时)、小鼠品系及数量(n=3) 阅读提示:Results: In vivo treatment of mice with a PI3K inhibitor; Figure 5 legend |
| CFU-GM集落形成实验 | 甲基纤维素培养基(M3231)、GM-CSF浓度(10 ng/ml)、抑制剂浓度(0.1-10 μM)、培养时间(8天) 阅读提示:Materials and Methods: Flow cytometric analysis and myeloid progenitor cell proliferation; Figure 2D legend |