建立慢性高眼压模型并评估RGC存活
诱导IOP升高并观察RGC及轴突的进行性丧失
通过巩膜静脉烧灼(EVC)建立大鼠青光眼模型,记录IOP变化,并在不同时间点(6周和6个月)用FG逆行标记和甲苯胺蓝染色评估RGC和轴突数量。
Cumulative mtDNA damage and mutations contribute to the progressive loss of RGCs in a rat model of glaucoma.
包含体内动物模型、细胞分子实验(Western blot、PCR、线粒体功能检测)及基因干预(AAV介导的过表达和敲低),并进行功能验证和机制验证。
Wistar大鼠慢性高眼压模型 RGC分离样本 AAV2-shPOLG处理的正常大鼠模型
EVC诱导的IOP升高持续6周,之后恢复正常 RGC样品由7-8只视网膜混合,每组每时间点3个样本(n=22-24) AAV2-POLG或AAV2-GFP(1×10^9 vg/μl)在EVC前1周玻璃体内注射2 μl AAV2-shPOLG或AAV2-shCTL(1×10^9 vg/μl)玻璃体内注射2 μl,12个月后施加二次损伤 谷氨酸注射(2 μl 4 mM)或EVC作为二次损伤
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
诱导IOP升高并观察RGC及轴突的进行性丧失
通过巩膜静脉烧灼(EVC)建立大鼠青光眼模型,记录IOP变化,并在不同时间点(6周和6个月)用FG逆行标记和甲苯胺蓝染色评估RGC和轴突数量。
确定IOP升高是否导致mtDNA改变及其随时间的变化
分离RGC,提取DNA,通过LX-PCR检测mtDNA损伤,随机突变捕获试验检测突变频率,实时PCR定量mtDNA拷贝数。
确定mtDNA修复/复制能力是否受损以及线粒体功能是否失调
通过qRT-PCR和Western blot检测OGG1、MYH和POLG的mRNA和蛋白水平,检测线粒体复合物I和III活性、ATP产生速率和ROS水平。
验证预防mtDNA改变是否能改善RGC存活
在EVC前1周玻璃体内注射AAV2-POLG或AAV2-GFP,检测POLG表达、mtDNA损伤/突变、复合物活性以及RGC和轴突存活。
验证mtDNA改变增加RGC对高IOP和谷氨酸的脆弱性
玻璃体内注射AAV2-shPOLG或AAV2-shCTL,12个月后施加EVC或谷氨酸注射,检测RGC凋亡、caspase-3激活和RGC存活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | TonoLab回弹式眼压计 | TioLat | -- |
| 基因操作 | AAV辅助病毒免费试剂盒 | Stratagene | -- |
| ViraTrap AAV纯化试剂盒 | GeneMega | -- | |
| 细胞培养 | Lipofectamine 2000 | -- | -- |
| RGC标记 | DiI | Molecular Probes | -- |
| Fluoro-Gold | Sigma | -- | |
| 组织处理 | Leica RM2265切片机 | Leica | -- |
| ImageJ软件 | NIH | -- | |
| RGC分离 | CD11b/c单克隆抗体包被磁珠 | BD Pharmingen | -- |
| Thy-1单克隆抗体包被磁珠 | Chemicon | -- | |
| 线粒体分离 | 线粒体分离试剂盒 | Pierce | -- |
| 蛋白质提取 | 细胞裂解缓冲液 | Cell Signaling Technology | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白测定试剂盒 | Pierce | -- |
| Western blot | OGG1抗体 | Abcam | -- |
| MYH抗体 | Abcam | -- | |
| POLG抗体 | Abcam | -- | |
| cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling | -- | |
| 细胞色素b抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| ND4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| ND5抗体 | Bioss, Inc. | -- | |
| ND6抗体 | Bioss, Inc. | -- | |
| β-actin抗体 | Sigma | -- | |
| Cox IV抗体 | Molecular Probes | -- | |
| HRP标记的山羊抗兔抗体 | Millipore | -- | |
| HRP标记的山羊抗小鼠抗体 | Millipore | -- | |
| DNA提取 | DNeasy血液和组织试剂盒 | QIAGEN | -- |
| DNA定量 | Quant-iT dsDNA检测 | Invitrogen | -- |
| PCR | SYBR Premix EX Taq试剂盒 | TAKARA | -- |
| TaqMan通用预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 突变检测 | Brilliant SYBR Green I预混液 | Stratagene | -- |
| 尿嘧啶DNA糖基化酶 | New England Biolabs, Inc. | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNeasy迷你柱 | QIAGEN | -- | |
| 无RNase的DNase I | QIAGEN | -- | |
| cDNA合成 | SuperScript II第一链RT-PCR试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 线粒体功能 | ENLITEN ATP检测系统 | Promega | -- |
| OxiSelect ROS检测试剂盒 | Cell Biolabs, Inc. | -- | |
| 免疫荧光和TUNEL | Cy5标记的抗兔IgG | Molecular Probes | -- |
| 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche | -- | |
| 组织处理 | Leica CM 3050S冰冻切片机 | Leica | -- |
| 显微镜 | 共聚焦显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 大鼠品系(8周龄雄性Wistar),EVC手术导致IOP升高>30%且持续6周,IOP测量方法(TonoLab),排除标准(IOP未升高超过30%) 阅读提示:Materials and methods, Experimental rat glaucoma model |
| AAV注射 | AAV2-POLG/GFP或AAV2-shPOLG/CTL滴度(1×10^9 vg/μl),注射体积(2 μl),注射时间(EVC前1周或12个月前) 阅读提示:Materials and methods, Generation of AAV2-POLG and AAV2-shPOLG |
| RGC分离 | RGC分离方法(磁珠分选),纯度验证(TUJ-1阳性>95%),样本混合(7-8视网膜/样本) 阅读提示:Materials and methods, RGC isolation |
| mtDNA损伤检测 | LX-PCR扩增片段大小(13.4 kb/235 bp),PCR循环条件,DNA量 阅读提示:Materials and methods, Mitochondrial and nuclear DNA damage |
| mtDNA突变检测 | 随机突变捕获试验引物位置(1,427和8,335),TaqI酶切,突变频率计算 阅读提示:Materials and methods, Mitochondrial DNA mutation assays |
| 线粒体功能 | 复合物I和III活性测定方法,ATP测定试剂盒,ROS测定试剂盒 阅读提示:Materials and methods, Mitochondrial function assay |